糖尿病足潰瘍相關(guān)基因與免疫細胞特征分析
發(fā)布時間:2021-12-17 22:35
目的·探究糖尿病足潰瘍(diabetic foot ulceration,DFU)相關(guān)基因的表達以及免疫細胞的特征。方法·從GEO數(shù)據(jù)庫下載基因表達數(shù)據(jù)集GSE80178,利用其中6個DFU樣本及3個糖尿病足皮膚(diabetic foot skin,DFS)樣本,鑒別DFU與DFS的差異表達基因(differentially expressed gene,DEG),以基因本體論(Gene Ontology,GO)注釋DEG可能涉及的生物過程及細胞成分,并利用反卷積方法計算并比較DFU、DFS及非糖尿病足部皮膚(non-diabetic foot skin,nDFS)的免疫細胞相對比例差異。結(jié)果·共獲得296個DFU與DFS的DEG,包括80個上調(diào)基因和216個下調(diào)基因。GO分析發(fā)現(xiàn),DEG在細胞成分上主要富集于細胞外泌體和細胞外空間;在生物過程中,DEG富集于角質(zhì)形成細胞分化、角質(zhì)化、中性粒細胞趨化等。DFS與nDFS比較,未發(fā)現(xiàn)免疫細胞比例差異;而DFU與DFS比較,DFU中活化肥大細胞、靜息自然殺傷細胞、CD8+ T細胞、單核細胞比例增加。結(jié)論·DFU發(fā)病過...
【文章來源】:上海交通大學學報(醫(yī)學版). 2020,40(10)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:6 頁
【部分圖文】:
DFU、DFS和nDFS中免疫細胞的相對比例
DFU、DFS和nDFS中免疫細胞相對比例的比較
DFU和DFS之間的DEG
本文編號:3541078
【文章來源】:上海交通大學學報(醫(yī)學版). 2020,40(10)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:6 頁
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DFU、DFS和nDFS中免疫細胞的相對比例
DFU、DFS和nDFS中免疫細胞相對比例的比較
DFU和DFS之間的DEG
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