目的·探究糖尿病足潰瘍（diabetic foot ulceration,DFU）相關基因的表達以及免疫細胞的特征。方法·從GEO數(shù)據(jù)庫下載基因表達數(shù)據(jù)集GSE80178,利用其中6個DFU樣本及3個糖尿病足皮膚（diabetic foot skin,DFS）樣本,鑒別DFU與DFS的差異表達基因（differentially expressed gene,DEG）,以基因本體論（Gene Ontology,GO）注釋DEG可能涉及的生物過程及細胞成分,并利用反卷積方法計算并比較DFU、DFS及非糖尿病足部皮膚（non-diabetic foot skin,nDFS）的免疫細胞相對比例差異。結果·共獲得296個DFU與DFS的DEG,包括80個上調基因和216個下調基因。GO分析發(fā)現(xiàn),DEG在細胞成分上主要富集于細胞外泌體和細胞外空間;在生物過程中,DEG富集于角質形成細胞分化、角質化、中性粒細胞趨化等。DFS與nDFS比較,未發(fā)現(xiàn)免疫細胞比例差異;而DFU與DFS比較,DFU中活化肥大細胞、靜息自然殺傷細胞、CD8⁺ T細胞、單核細胞比例增加。結論·DFU發(fā)病過... 

【文章來源】：上海交通大學學報(醫(yī)學版). 2020,40(10)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：6 頁

【部分圖文】：

DFU、DFS和nDFS中免疫細胞的相對比例

DFU、DFS和nDFS中免疫細胞相對比例的比較

DFU和DFS之間的DEG


本文編號：3541078