冠心病不穩(wěn)定性心絞痛血瘀證差異表達(dá)譜分析及IL6基因甲基化水平的研究
本文關(guān)鍵詞:冠心病不穩(wěn)定性心絞痛血瘀證差異表達(dá)譜分析及IL6基因甲基化水平的研究,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
【摘要】:背景:冠心病血瘀證與微循環(huán)障礙、血液高凝滯狀態(tài)、血小板活化和粘附聚集、血栓形成、免疫功能障礙等現(xiàn)代病理改變等密切相關(guān)。同時(shí),冠心病血瘀證基因組學(xué)也在mRNA、 miRNA. lncRNA等層面有所研究。但至今尚未完全闡明血瘀證發(fā)生的機(jī)制,以及可以用于定量診斷的血瘀證生物標(biāo)志物和用于闡明藥物作用的分子靶標(biāo)。目的:通過生物信息學(xué)的方法分析冠心病血瘀證差異表達(dá)譜相關(guān)的信號(hào)通路及關(guān)鍵差異基因,并利用表觀遺傳學(xué)的方法研究冠心病不穩(wěn)定性心絞痛血瘀證差異基因的DNA甲基化調(diào)節(jié)機(jī)制。方法:本研究在PubMed, CNKI, VIP,萬方以及SinoMed數(shù)據(jù)庫中檢索冠心病血瘀證差異表達(dá)譜的文獻(xiàn),并匯總差異表達(dá)譜的結(jié)果,應(yīng)用DAVID平臺(tái)對(duì)差異表達(dá)譜基因進(jìn)行功能注釋、功能富集分析、以及通路分析;利用GeneCards對(duì)目的基因在亞細(xì)胞結(jié)構(gòu)中的分布情況和表達(dá)蛋白STRING相互作用網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行分析。臨床納入不穩(wěn)定性心絞痛血瘀證患者6例和不穩(wěn)定型心絞痛非血瘀證患者6例,收集血樣,通用型柱式試劑盒法提取基因組DNA, ZYMO RESEARCH試劑盒法重亞硫酸鹽處理,UCSC查閱目的基因注釋信息,針對(duì)目的基因利用Epidesigner設(shè)計(jì)引物,甲基化特異性PCR, SAP處理,T7DNA聚合酶轉(zhuǎn)錄,堿基特異性酶切,最后運(yùn)用Sequenom公司推出的MassARRAY分子量陣列技術(shù)平臺(tái)檢測目的序列甲基化程度。結(jié)果:差異表達(dá)譜Go的分析結(jié)果富集在炎癥反應(yīng)(inflammatory response)這一生物過程。差異表達(dá)譜BIOCARTA基因富集的信號(hào)通路是“Cells and Molecules involved in local acute inflammatory response",涉及IL6、ITGB2、 C3這三個(gè)基因。IL6基因轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)前-1118bp至-826bp序列(IL6_1)中7個(gè)位點(diǎn)CpG位點(diǎn)甲基化程度血瘀證組存在高于非血瘀證組的趨勢,但差異尚無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。而IL6基因轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)前-1471bp至-1184bp序列(IL6-2)4個(gè)CpG位點(diǎn)甲基化程度血瘀證組與非血瘀證組之間的差異尚不明顯。結(jié)論:冠心病血瘀證與炎癥反應(yīng)密切相關(guān)。IL6基因轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)前2000bp內(nèi)兩段序列的甲基化程度,發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)前-1118bp至-826bp序列(IL6_1)中7個(gè)位點(diǎn)CpG位點(diǎn)甲基化程度血瘀證組存在高于非血瘀證組的趨勢,而IL6基因轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)前-1471bp至-1184bp序列(IL6-2)4個(gè)CpG位點(diǎn)甲基化程度血瘀證組與非血瘀證組之間的差異尚不明顯。本研究在一定程度上提示DNA甲基化可能調(diào)節(jié)血瘀證進(jìn)程。
【關(guān)鍵詞】:冠心病 血瘀證 差異表達(dá)譜 DNA甲基化 表觀遺傳學(xué) 生物信息學(xué)
【學(xué)位授予單位】:北京中醫(yī)藥大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類號(hào)】:R259
【目錄】:
- 摘要5-7
- ABSTRACT7-9
- 符號(hào)說明9-10
- 第一部分 文獻(xiàn)綜述10-21
- 冠心病血瘀證基因組學(xué)及表觀遺傳學(xué)研究進(jìn)展10-21
- 1 SNP研究10-11
- 2 基因表達(dá)譜研究11-13
- 3 DNA甲基化13-14
- 4 非編碼RNA14-16
- 5 表觀遺傳學(xué)研究展望16-18
- 參考文獻(xiàn)18-21
- 前言21-25
- 參考文獻(xiàn)23-25
- 第二部分 實(shí)驗(yàn)研究25-62
- 第一節(jié) 基于文獻(xiàn)的冠心病血瘀證差異表達(dá)譜生物信息學(xué)研究25-41
- 材料25-26
- 方法26-27
- 結(jié)果27-36
- 小結(jié)36
- 討論36-39
- 參考文獻(xiàn)39-41
- 第二節(jié) 冠心病不穩(wěn)定性心絞痛血瘀證差異基因啟動(dòng)子甲基化水平研究41-62
- 材料41-43
- 方法43-47
- 結(jié)果47-57
- 小結(jié)57
- 討論57-61
- 參考文獻(xiàn)61-62
- 結(jié)語62-63
- 致謝63-64
- 在學(xué)期間主要研究成果64-65
- 個(gè)人簡歷65
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本文編號(hào):351517
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