生長(zhǎng)素受體SlTIR1/AFBs家族基因在番茄生長(zhǎng)與發(fā)育中的調(diào)控機(jī)制研究
發(fā)布時(shí)間:2021-11-22 10:55
生長(zhǎng)素作為一種重要的植物激素,參與植物生長(zhǎng)和發(fā)育諸多過(guò)程以及調(diào)控許多生理反應(yīng)。生長(zhǎng)素通過(guò)介導(dǎo)其受體TIR1/AFB與轉(zhuǎn)錄抑制子Aux/IAA蛋白直接相互作用,促使Aux/IAA蛋白降解,將下游的轉(zhuǎn)錄因子ARF去抑制化,從而激活生長(zhǎng)素信號(hào)通路,使得植物最終表現(xiàn)出生理反應(yīng)。植物對(duì)生長(zhǎng)素的響應(yīng)是一個(gè)極其復(fù)雜的過(guò)程,存在著嚴(yán)密的調(diào)控機(jī)制。因此,研究生長(zhǎng)素的作用機(jī)制對(duì)深入認(rèn)識(shí)植物生長(zhǎng)發(fā)育的生理過(guò)程有著重要的意義。番茄是一種重要經(jīng)濟(jì)作物,也是研究一些重要性狀,如:復(fù)葉、聚傘花序以及果實(shí)發(fā)育、成熟的模式植物。TIR1/AFB蛋白作為生長(zhǎng)素受體,處于生長(zhǎng)素信號(hào)通路中關(guān)鍵位置,研究生長(zhǎng)素受體基因功能至關(guān)重要。但是生長(zhǎng)素受體及信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)對(duì)番茄復(fù)葉及花器官發(fā)育、果實(shí)形成的調(diào)控機(jī)制仍缺乏了解。本論文以番茄為研究材料,通過(guò)生物信息學(xué)、遺傳轉(zhuǎn)化、組織切片法、生理生化、分子生物學(xué)等方法分析了SlTIR1/AFBs基因家族成員的結(jié)構(gòu)、表達(dá)、蛋白互作特性及其功能,以期揭示生長(zhǎng)素受體SlTIR1/AFBs同源基因家族成員對(duì)番茄生長(zhǎng)、發(fā)育調(diào)控功能的差異性以及在生長(zhǎng)素信號(hào)中調(diào)控方式,同時(shí)闡明SlmiR393在轉(zhuǎn)錄后介導(dǎo)生長(zhǎng)素受...
【文章來(lái)源】:重慶大學(xué)重慶市 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:131 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【部分圖文】:
生長(zhǎng)素信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)的模式
IN (CUL1)、RING-H2 鋅指蛋白 R接酶所介導(dǎo)的泛素化-蛋白水解體途antner and Estelle, 2009)。盡管擬AFB2, AFB3, AFB4 與 AFB5 已被需要進(jìn)一步研究。Tan 等 (Tan et 構(gòu),該結(jié)構(gòu)呈現(xiàn)蘑菇形狀 (圖 1.2)。位置,由 TIR1的 C 端 LRR結(jié)構(gòu)域口。蘑菇莖形狀則為 TIR1 的 N 端素作為分子黏合劑,可促進(jìn) TIR1 /IAA 與 TIR1 之間結(jié)合并不能使得 ,TIR1 跟 Aux/IAA 互作僅在生長(zhǎng)的降解決定子序列的晶體結(jié)構(gòu)被解蛋白結(jié)構(gòu)被全部解析,將會(huì)揭示生
圖 2.1 SlTIR1/AFBs 家族基因組的結(jié)構(gòu)(A) 圖片由在線軟件 GSDS所生成。(B) 番茄 TIR1/AFB家族成員的基因結(jié)構(gòu)。Fig 2.1 Gene structure of the four tomato SlTIR1/AFBs genes(A) The figure was produced using GSDS software. (B) Structural features of the tomatoSlTIR1/AFBs family members.對(duì) Sl-TIR1/AFBs 的氨基酸序列比對(duì)發(fā)現(xiàn),番茄 Sl-TIR1A/B 都與擬IR1 具有高度的同源,相似性在 80%-89%;Sl-AFB4 與擬南芥 AFB4/AFB為 66-68%; Sl-AFB6與擬南芥 TIR1/AFB 家族成員之間的相似性略低,56%;但是,Sl-AFB6卻與楊樹(shù) PtAFB6氨基酸序列相似性為 84% (表 2.4)確番茄與其他物種的 TIR1/AFB 家族基因的進(jìn)化關(guān)系,我們利用 clustalX Mega 5.0軟件構(gòu)建了系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)。結(jié)果表明,番茄 Sl-TIR1/AFB家族基個(gè)亞家族。Sl-TIR1A/B 與擬南芥 TIR1 同屬于 TIR1/AFB1 亞家族;Sl-A南芥 AFB4、AFB5 歸屬為 AFB4 亞家族;Sl-AFB6 與 PtAFB6 歸屬于 A族,該亞家族不含有擬南芥 TIR1/AFB家族成員 (圖 2.2)。
本文編號(hào):3511546
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生長(zhǎng)素信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)的模式
IN (CUL1)、RING-H2 鋅指蛋白 R接酶所介導(dǎo)的泛素化-蛋白水解體途antner and Estelle, 2009)。盡管擬AFB2, AFB3, AFB4 與 AFB5 已被需要進(jìn)一步研究。Tan 等 (Tan et 構(gòu),該結(jié)構(gòu)呈現(xiàn)蘑菇形狀 (圖 1.2)。位置,由 TIR1的 C 端 LRR結(jié)構(gòu)域口。蘑菇莖形狀則為 TIR1 的 N 端素作為分子黏合劑,可促進(jìn) TIR1 /IAA 與 TIR1 之間結(jié)合并不能使得 ,TIR1 跟 Aux/IAA 互作僅在生長(zhǎng)的降解決定子序列的晶體結(jié)構(gòu)被解蛋白結(jié)構(gòu)被全部解析,將會(huì)揭示生
圖 2.1 SlTIR1/AFBs 家族基因組的結(jié)構(gòu)(A) 圖片由在線軟件 GSDS所生成。(B) 番茄 TIR1/AFB家族成員的基因結(jié)構(gòu)。Fig 2.1 Gene structure of the four tomato SlTIR1/AFBs genes(A) The figure was produced using GSDS software. (B) Structural features of the tomatoSlTIR1/AFBs family members.對(duì) Sl-TIR1/AFBs 的氨基酸序列比對(duì)發(fā)現(xiàn),番茄 Sl-TIR1A/B 都與擬IR1 具有高度的同源,相似性在 80%-89%;Sl-AFB4 與擬南芥 AFB4/AFB為 66-68%; Sl-AFB6與擬南芥 TIR1/AFB 家族成員之間的相似性略低,56%;但是,Sl-AFB6卻與楊樹(shù) PtAFB6氨基酸序列相似性為 84% (表 2.4)確番茄與其他物種的 TIR1/AFB 家族基因的進(jìn)化關(guān)系,我們利用 clustalX Mega 5.0軟件構(gòu)建了系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)。結(jié)果表明,番茄 Sl-TIR1/AFB家族基個(gè)亞家族。Sl-TIR1A/B 與擬南芥 TIR1 同屬于 TIR1/AFB1 亞家族;Sl-A南芥 AFB4、AFB5 歸屬為 AFB4 亞家族;Sl-AFB6 與 PtAFB6 歸屬于 A族,該亞家族不含有擬南芥 TIR1/AFB家族成員 (圖 2.2)。
本文編號(hào):3511546
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