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轉錄組分析鑒定連翹中控制連翹苷、連翹酯苷A含量及胚發(fā)育的候選基因

發(fā)布時間:2021-11-22 04:58
  連翹為木犀科植物連翹Forsythia suspensa(Thunb.)Vahl的干燥果實,是我國廣泛使用的傳統(tǒng)中藥材。連翹苷和連翹酯苷A是2015版《中國藥典》中規(guī)定的指標性成分,用于控制連翹藥材及飲片的質(zhì)量。由于目前市場上連翹多為野生,連翹苷和連翹酯苷A的含量較低,同時還存在胚率較低的問題,導致藥材質(zhì)量無法保證,培育優(yōu)質(zhì)品種是解決連翹藥材質(zhì)量問題的最佳方法。迄今為止,對連翹的育種還尚未展開,關于連翹分子育種方面的研究較少。為了填補連翹育種領域的空白,本研究在連翹發(fā)育的五個不同時期,利用無參RNA-Seq技術,對各個時期連翹果實進行轉錄組測序,并通過生物技術平臺篩選出與連翹苷和連翹酯苷A含量及胚發(fā)育相關的候選基因,為日后優(yōu)質(zhì)連翹品種的培育奠定基礎。本課題的研究方法及結果如下:1.采用HPLC法,分別對6月20日至7月30日五個不同時期的連翹樣品進行連翹苷和連翹酯苷A的含量測定。結果表明在此期間,隨著連翹的生長發(fā)育連翹苷含量持續(xù)下降,連翹酯苷A含量先持續(xù)降低又在7月30日略微上升。2.提取上述各發(fā)育時期的連翹果實樣品的總RNA進行RNA-Seq測序,五個時期的樣本均得到了大于20M高質(zhì)... 

【文章來源】:河南大學河南省

【文章頁數(shù)】:93 頁

【學位級別】:碩士

【部分圖文】:

轉錄組分析鑒定連翹中控制連翹苷、連翹酯苷A含量及胚發(fā)育的候選基因


苯丙烷代謝途徑Fig.1-1Phenylpropanoidmetabolicpathway(1)連翹苷的生物合成機制在植物體內(nèi),經(jīng)莽草酸途徑產(chǎn)生苯丙烷途徑的前體物質(zhì)苯丙氨酸,苯丙烷途徑及部

連翹,途徑,松脂,木脂素


第一章緒論木脂素松脂醇的產(chǎn)生,近年來關于木脂素中連翹苷后期合成途徑的研究較少。早期曾有研究小組用標記的表松脂素作底物,用F.intermedia脫細胞制備物進行培育,結果發(fā)現(xiàn)表松脂素可以很好地并入連翹脂素中,同時推測了連翹苷可能的合成途徑[31]:兩分子松柏醇偶聯(lián)產(chǎn)生不同構型的化合物,然后轉化為表松脂素((+)-Epipinoresinol),表松脂素繼而轉化為連翹脂素,連翹脂素最終形成連翹苷。圖1-2連翹苷的生物合成途徑Fig.1-2ForsythinbiosyntheticpathwayinF.suspensa第一階段中的苯丙烷代謝途徑以及所涉及的基因已被廣泛研究,而從松柏醇到連翹苷的合成通路涉及的基因和酶是未知的?紤]到連翹苷的分子結構,首先需要將苯丙烷代謝途徑產(chǎn)生的松柏醇轉化為表松脂素,然而迄今為止還未有任何關于表松脂素生物合成途徑的報導,但木脂素具有光學活性在酸性條件下易異構化[32],故可能先通過松柏醇合成松脂素((+)-Pinoresinol)然后在酸性的內(nèi)環(huán)境下轉化為表松脂素。松脂醇型木脂素((+)-Pinoresinol)的生物合成途徑是從兩分子松柏醇單元的特異性不對稱偶聯(lián)開始的[33],該步驟過程中發(fā)生了自由基加成反應,盡管還沒有確定松脂醇合成酶,但顯示一種Dirigant蛋白(DIR)參與了E-松柏醇的立體特異性二聚化,該蛋白不具有催化活性,但卻能夠指導雙分子偶聯(lián)反應形成立體特異性或區(qū)域特異性產(chǎn)物,使木脂素單體偶連形成聚合體木脂素[34],由于該過程限定了合成途徑的反應方向,所以是木脂素合成途徑中的限速步驟,對木脂素生物合成過程具有重要的調(diào)節(jié)作用[35]。DIR蛋白的基因已從丹參[36]、杜仲[37]、毛竹[38]等不同種植物中被發(fā)現(xiàn),同時也有相關研究對連翹中的DIR蛋白基因進行了克隆[39]。表松脂素形成后還需要在C-4"所連接的氧的?

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轉錄組分析鑒定連翹中控制連翹苷、連翹酯苷A含量及胚發(fā)育的候選基因連翹脂素,該甲基化反應可能是由特定的O-甲基化酶介導的;生成的連翹脂素還需要在C-4氧位置加上糖基部分才能形成連翹苷,故催化葡萄糖基轉移反應的UDP-葡萄糖基轉移酶(UGT)可能參與了該過程,具體途徑如圖1-2所示。此外,松柏醇也可能因UGT71A18(一種UDP-葡萄糖依賴性葡萄糖基轉移酶)的作用發(fā)生糖基化[40],并且這種糖基化作用很可能抑制松柏醇的酚羥基的化學反應性,同時增強松柏醇糖苷配基的高水溶性,從而導致產(chǎn)生大量而穩(wěn)定的松柏醇[41]。實際上,大約90%的松脂醇以其糖基化形式積聚在連翹屬植物中,在日本的連翹葉中,PLR在針對UGT71A18的基因表達中顯示出相反的季節(jié)性變化[45],因此UGT71A18指導的糖基化與一些木脂素合成途徑中酶的催化是相互競爭的途徑,因為它們都以松脂醇為底物。(2)連翹酯苷A的生物合成機制圖1-3苯乙醇苷的生物合成途徑Fig.1-3phenylethanoidglycosidesbiosyntheticpathway近幾年來,關于苯乙醇苷(PhG)的生物合成通路的研究結果基本上達成共識,推測的苯乙醇苷類化合物的合成途徑如圖1-3所示:經(jīng)莽草酸途徑分別生成苯丙烷代謝途徑和酪氨酸代謝途徑的前體苯丙氨酸和酪氨酸,苯丙氨酸經(jīng)由苯丙烷代謝途徑生成苯丙烯酸,酪氨酸通過酪氨酸代謝途徑生成苯乙醇,隨后在一系列;D移酶和葡萄糖基轉移酶的作用下,發(fā)生生苷化或酯化等反應,最終縮合生成PhG[47]。4

【參考文獻】:
期刊論文
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[3]轉錄組學主要研究技術及其應用概述[J]. 劉偉,郭光艷,秘彩莉.  生物學教學. 2019(10)
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[5]D-酪氨酰-tRNA脫;傅难芯窟M展[J]. 張曉剛,劉楠.  藥物生物技術. 2018(04)
[6]苯乙醇苷類化合物的分類及研究進展[J]. 薛景,王英愛,賈獻慧,杜成林,唐文照.  藥學研究. 2018(05)
[7]連翹2個DIR基因的分子特征與表達分析[J]. 朱畇昊,趙樂,謝小龍,李景亮,董誠明.  中藥材. 2017(12)
[8]連翹中具有抗菌活性的苯乙醇苷類化學成分研究[J]. 姜醒,魯麗敏,張春蕾,王興焱,孫琦,王佳天,苑光軍.  中國現(xiàn)代中藥. 2017(05)
[9]杜仲Dirigent蛋白編碼基因的克隆及序列分析[J]. 王維東,趙德剛,趙懿琛.  基因組學與應用生物學. 2018(03)
[10]丹參Dirigent基因家族的發(fā)現(xiàn)與生物信息學分析[J]. 馬金洋,楊瑾冬,李卿,張磊.  基因組學與應用生物學. 2017(04)

碩士論文
[1]河南產(chǎn)連翹飲片的質(zhì)量分析研究[D]. 郝敏.河南中醫(yī)藥大學 2016



本文編號:3510987

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