前列腺癌中致病基因與核心轉(zhuǎn)錄因子的識(shí)別與功能分析
發(fā)布時(shí)間:2021-11-16 18:41
目的:通過分析識(shí)別前列腺癌功能基因模塊并挖掘影響這些模塊的核心轉(zhuǎn)錄因子與關(guān)鍵基因,探討前列腺癌的發(fā)病機(jī)制。方法:通過加權(quán)基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析(weighted gene co-expressed network analysis, WGCNA)識(shí)別與前列腺癌病理分期、Gleason分級(jí)等重要臨床特征相關(guān)的樞紐基因模塊,利用OPOSSUM在線工具分析富集調(diào)控這些基因的轉(zhuǎn)錄因子,應(yīng)用通路富集分析和蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)分析識(shí)別前列腺癌的關(guān)鍵基因及其對(duì)前列腺癌患者重要臨床特征和無病生存率(disease free survival,DFS)的影響。結(jié)果:識(shí)別出3個(gè)樞紐模塊,分別與前列腺癌病理T分期、病理N分期、Gleason分級(jí)高度相關(guān)。進(jìn)一步篩選得到13個(gè)前列腺癌核心轉(zhuǎn)錄因子參與調(diào)控這3個(gè)樞紐模塊。這些轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控的差異表達(dá)基因顯著富集于Calcium、c GMP-PKG、cAMP前列腺癌相關(guān)信號(hào)通路,其組成的基因網(wǎng)絡(luò)中14個(gè)關(guān)鍵基因(PRKG1、PRKG2、CYSLTR2、GRPR、CHRM3、ADCY5、ADRA1D、EDNRA、EDNRB、CYSLTR2、AGTR1、GRPR、GRIA1和...
【文章來源】:中國(guó)腫瘤生物治療雜志. 2020,27(10)北大核心CSCD
【文章頁(yè)數(shù)】:6 頁(yè)
【部分圖文】:
前列腺癌異常樣本檢測(cè)與WGCN構(gòu)建
以上結(jié)果表明,篩選的核心轉(zhuǎn)錄因子通過調(diào)控樞紐模塊對(duì)前列腺癌起重要作用,并且前列腺癌中轉(zhuǎn)錄因子的活性高低往往會(huì)導(dǎo)致調(diào)控靶基因數(shù)目的變化。圖3 13個(gè)核心轉(zhuǎn)錄因子表達(dá)(A)和調(diào)控DEG的情況分析(B)
13個(gè)核心轉(zhuǎn)錄因子表達(dá)(A)和調(diào)控DEG的情況分析(B)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]FOXM1在結(jié)直腸癌中的作用及其機(jī)制[J]. 王思毓,劉珊,蔣永新. 中國(guó)腫瘤生物治療雜志. 2020(05)
[2]前列腺癌Gleason分級(jí)[J]. 周橋. 中華病理學(xué)雜志. 2005(04)
碩士論文
[1]基于加權(quán)基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)的腫瘤中特異表達(dá)基因篩選方法研究[D]. 劉毅.哈爾濱工程大學(xué) 2018
本文編號(hào):3499373
【文章來源】:中國(guó)腫瘤生物治療雜志. 2020,27(10)北大核心CSCD
【文章頁(yè)數(shù)】:6 頁(yè)
【部分圖文】:
前列腺癌異常樣本檢測(cè)與WGCN構(gòu)建
以上結(jié)果表明,篩選的核心轉(zhuǎn)錄因子通過調(diào)控樞紐模塊對(duì)前列腺癌起重要作用,并且前列腺癌中轉(zhuǎn)錄因子的活性高低往往會(huì)導(dǎo)致調(diào)控靶基因數(shù)目的變化。圖3 13個(gè)核心轉(zhuǎn)錄因子表達(dá)(A)和調(diào)控DEG的情況分析(B)
13個(gè)核心轉(zhuǎn)錄因子表達(dá)(A)和調(diào)控DEG的情況分析(B)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]FOXM1在結(jié)直腸癌中的作用及其機(jī)制[J]. 王思毓,劉珊,蔣永新. 中國(guó)腫瘤生物治療雜志. 2020(05)
[2]前列腺癌Gleason分級(jí)[J]. 周橋. 中華病理學(xué)雜志. 2005(04)
碩士論文
[1]基于加權(quán)基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)的腫瘤中特異表達(dá)基因篩選方法研究[D]. 劉毅.哈爾濱工程大學(xué) 2018
本文編號(hào):3499373
本文鏈接:http://sikaile.net/kejilunwen/jiyingongcheng/3499373.html
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