目的比較橫紋肌肉瘤（RMS）融合基因陽性和陰性細胞的生物學行為,結合生物信息學分析差異miRNA,并在RMS細胞中驗證篩選差異miRNA的表達。方法分別利用CCK-8、Transwell、流式細胞術檢測RMS中融合基因陽性RH30細胞和融合基因陰性RD及PLA-802細胞的增殖、侵襲、遷移和凋亡能力;利用GEO2R分析融合基因陽性和陰性細胞的差異miRNA;利用Sangerbox繪制差異miRNA火山圖,運用qRT-PCR驗證篩選的差異miRNA。結果 RD細胞的增殖能力高于RH30細胞和PLA-802細胞（P<0.05）。RH30細胞的侵襲、遷移和抗凋亡能力高于PLA-802細胞和RD細胞（P<0.05）。火山圖結果顯示上調miRNA（紅色）多于下調miRNA（綠色）（P<0.05）。根據(jù)|log₂FC|>3,P<0.05篩選得到12個差異miRNA（上調miRNA:miR-1、let-7d-5p和let-7b-5p,下調miRNA:miR-196a-5p、miR-455-3p、miR-21-5p、miR-193a-3p、miR-2... 

【文章來源】：安徽醫(yī)科大學學報. 2020,55(12)北大核心

【文章頁數(shù)】：5 頁

【部分圖文】：

3株RMS細胞系的遷移和侵襲能力

3株細胞系的細胞增殖能力

在RH30細胞、PLA-802細胞、RD細胞中利用qRT-PCR檢測篩選出的12個差異miRNA,結果顯示miR-1(F=28.908,PRD=0.001,PPLA-802=0.000),let-7d-5p(F=187.469,PRD=0.000,PPLA-802=0.000)和let-7b-5p(F=2920.115,PRD=0.000,PPLA-802=0.000)在融合基因陽性RH30細胞中表達高于融合基因陰性PLA-802細胞和RD細胞(圖5);miR-196a-5p(F=98.196,PRD=0.000,PPLA-802=0.001),miR-455-3p(F=8.773,PRD=0.006,PPLA-802=0.040),miR-21-5p(F=187.469,PRD=0.000,PPLA-802=0.000),miR-193a-3p(F=87.856,PRD=0.000,PPLA-802=0.002),miR-29b-3p (F=16.142,PRD=0.001,PPLA-802=0.044),miR-29a-3p(F=16.573,PRD=0.006,PPLA-802=0.002),miR-100-5p(F=13.040,PRD=0.002,PPLA-802=0.038),miR-222-3p(F=53.234,PRD=0.000,PPLA-802=0.003)和miR-221-3p(F=48.550,PRD=0.000,PPLA-802=0.003)在融合基因陰性RD細胞和PLA-802細胞中表達高于融合基因陽性RH30細胞(圖5)。上述結果與生物信息學分析結果一致。圖4 火山圖分析差異miRNA


本文編號：3486182