小麥小分子RNA TaMIR1119/5086和轉(zhuǎn)錄因子基因TaNF-YB6;1分子特征和耐逆功能
發(fā)布時間:2021-11-09 09:29
干旱和鹽分等非生物逆境脅迫是全球范圍內(nèi)限制作物生長及產(chǎn)量形成的重要因素。揭示植物應(yīng)答和抵御干旱和鹽分脅迫的分子機制對于作物耐逆的遺傳改良和生產(chǎn)實踐具有重要實踐意義。本研究在實驗室前期工作積累基礎(chǔ)上,對應(yīng)答干旱脅迫的小麥miRNA家族成員TaMIR1119、TaMIR5086和應(yīng)答鹽分和干旱逆境脅迫的轉(zhuǎn)錄因子基因TaNF-YB6;1的分子特征及其耐逆功能進行了研究。主要研究結(jié)果如下:1.TaMIR1119的前體序列長度為176 nt,成熟序列位于84 nt至107 nt,長度為24 nt。該小分子RNA通過自身堿基互補序列形成二級莖環(huán)結(jié)構(gòu)。TaMIR1119作用的靶基因有為6個,功能上分屬于轉(zhuǎn)錄調(diào)控、RNA和生化代謝、運輸和氧化脅迫逆境抵御等類別。2.干旱脅迫下,TaMIR1119及其煙草同源基因NtMIR1119在根系中呈上調(diào)表達。超表達TaMIR1119的轉(zhuǎn)基因煙草植株,干旱脅迫條件下植株的生長特性得到明顯改善,植株形態(tài)增大,干物質(zhì)量增多,葉片光合碳同化能力增強,植株體內(nèi)SOD、POD、CAT的抗氧化酶活性明顯提高,表明該小麥種屬miRNA成員通過內(nèi)在生理生化過程改善和活性氧清除能力...
【文章來源】: 史桂清 河北農(nóng)業(yè)大學(xué)
【文章頁數(shù)】:59 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
TaMIR1119和NtMIR1119的前體序列比對結(jié)果
圖 3-3 TaMIR1119 與其作用靶基因的堿igure 3-3 Base pairing characterization between TaMIR6 的分子特征前體序列長度為 126 nt,成熟小分子序列GGAAGGCGUGGUA-3′)。該小分子 RNA 通 所示。以干旱處理煙草的根系 cDNA 為模物(NtMIR5086)經(jīng)測序結(jié)果表明與 TaM征。源于小麥和煙草的 miR5086 前體序列圖 3-4 TaMIR5086 前體序列形成的莖環(huán)3-4 Characteristics of stem-loop structure formed by T
圖 3-5 TaMIR5086 和 NtMIR5086 的前體序列比對結(jié)果Figure 3-5Alignment of TaMIR5086 and NtMIR5086 precursor sequencestMIR5086,下列為 TaMIR5086。預(yù)測植物種屬miRNA作用靶基因的在線預(yù)測工具對 TaMIR5086 可能作用的如表 3-1 所示。TaMIR5086 作用 6 個靶基因。上述靶基因包括 2 個全基因組體 chr4 scaffold_6 基因(登錄號 TC424860),二是染色體 chr7 scaffold_20 基3);2 個蛋白質(zhì)因子基因,一是粳稻中 Os10g0131000 蛋白質(zhì)基因(登錄號 CJ5Os09g0407700 蛋白質(zhì)基因(登錄號 TC371590);1 個延長因子基因(一個絲氨酸蛋白酶抑制劑基因(登錄號 TC377686)。TaMIR5086 通過調(diào)控上能的靶基因,在介導(dǎo)植株響應(yīng)干旱脅迫逆境中可能發(fā)揮著重要功能。表 3-1 TaMIR5086 作用的靶基因及生物學(xué)功能Table 3-1 The target genes of TaMIR5086 and their biological functionsTarget Acc.SequencelengthExpectation(E)Target Accessibility(UPE)Target Descript
【參考文獻】:
期刊論文
[1]低夜溫下番茄ABA缺失突變體和野生型葉片中miRNA差異表達分析[J]. 王孝,劉陽,陳海銀,劉琨,齊明芳,李天來,劉玉鳳. 園藝學(xué)報. 2016(12)
[2]陸地棉種子發(fā)育過程中microRNA的挖掘與功能研究[J]. Wang Gaskin,余道乾,杜雄明. 棉花學(xué)報. 2014(01)
[3]核因子Y在植物中的分類及其功能概述[J]. 李文濱,李勝暢,王志坤. 東北農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2012(01)
[4]植物microRNA對重金屬脅迫響應(yīng)的調(diào)控[J]. 丁艷菲,朱誠,王珊珊,劉海麗. 生物化學(xué)與生物物理進展. 2011(12)
[5]轉(zhuǎn)錄因子與植物抗逆性研究進展[J]. 劉欣,李云. 中國農(nóng)學(xué)通報. 2006(04)
[6]植物轉(zhuǎn)錄因子的結(jié)構(gòu)與調(diào)控作用[J]. 劉強,張貴友,陳受宜. 科學(xué)通報. 2000(14)
碩士論文
[1]谷子耐鹽相關(guān)基因SiNF-YA5和SiATG4的功能分析及調(diào)控途徑解析[D]. 黃鎖.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2016
[2]玉米自交系鹽脅迫響應(yīng)miRNA及其靶基因的鑒定研究[D]. 付蓉.南通大學(xué) 2016
本文編號:3485072
【文章來源】: 史桂清 河北農(nóng)業(yè)大學(xué)
【文章頁數(shù)】:59 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
TaMIR1119和NtMIR1119的前體序列比對結(jié)果
圖 3-3 TaMIR1119 與其作用靶基因的堿igure 3-3 Base pairing characterization between TaMIR6 的分子特征前體序列長度為 126 nt,成熟小分子序列GGAAGGCGUGGUA-3′)。該小分子 RNA 通 所示。以干旱處理煙草的根系 cDNA 為模物(NtMIR5086)經(jīng)測序結(jié)果表明與 TaM征。源于小麥和煙草的 miR5086 前體序列圖 3-4 TaMIR5086 前體序列形成的莖環(huán)3-4 Characteristics of stem-loop structure formed by T
圖 3-5 TaMIR5086 和 NtMIR5086 的前體序列比對結(jié)果Figure 3-5Alignment of TaMIR5086 and NtMIR5086 precursor sequencestMIR5086,下列為 TaMIR5086。預(yù)測植物種屬miRNA作用靶基因的在線預(yù)測工具對 TaMIR5086 可能作用的如表 3-1 所示。TaMIR5086 作用 6 個靶基因。上述靶基因包括 2 個全基因組體 chr4 scaffold_6 基因(登錄號 TC424860),二是染色體 chr7 scaffold_20 基3);2 個蛋白質(zhì)因子基因,一是粳稻中 Os10g0131000 蛋白質(zhì)基因(登錄號 CJ5Os09g0407700 蛋白質(zhì)基因(登錄號 TC371590);1 個延長因子基因(一個絲氨酸蛋白酶抑制劑基因(登錄號 TC377686)。TaMIR5086 通過調(diào)控上能的靶基因,在介導(dǎo)植株響應(yīng)干旱脅迫逆境中可能發(fā)揮著重要功能。表 3-1 TaMIR5086 作用的靶基因及生物學(xué)功能Table 3-1 The target genes of TaMIR5086 and their biological functionsTarget Acc.SequencelengthExpectation(E)Target Accessibility(UPE)Target Descript
【參考文獻】:
期刊論文
[1]低夜溫下番茄ABA缺失突變體和野生型葉片中miRNA差異表達分析[J]. 王孝,劉陽,陳海銀,劉琨,齊明芳,李天來,劉玉鳳. 園藝學(xué)報. 2016(12)
[2]陸地棉種子發(fā)育過程中microRNA的挖掘與功能研究[J]. Wang Gaskin,余道乾,杜雄明. 棉花學(xué)報. 2014(01)
[3]核因子Y在植物中的分類及其功能概述[J]. 李文濱,李勝暢,王志坤. 東北農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2012(01)
[4]植物microRNA對重金屬脅迫響應(yīng)的調(diào)控[J]. 丁艷菲,朱誠,王珊珊,劉海麗. 生物化學(xué)與生物物理進展. 2011(12)
[5]轉(zhuǎn)錄因子與植物抗逆性研究進展[J]. 劉欣,李云. 中國農(nóng)學(xué)通報. 2006(04)
[6]植物轉(zhuǎn)錄因子的結(jié)構(gòu)與調(diào)控作用[J]. 劉強,張貴友,陳受宜. 科學(xué)通報. 2000(14)
碩士論文
[1]谷子耐鹽相關(guān)基因SiNF-YA5和SiATG4的功能分析及調(diào)控途徑解析[D]. 黃鎖.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2016
[2]玉米自交系鹽脅迫響應(yīng)miRNA及其靶基因的鑒定研究[D]. 付蓉.南通大學(xué) 2016
本文編號:3485072
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