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原發(fā)性開角型青光眼患者ABCA1基因編碼區(qū)稀有變異的篩查與研究

發(fā)布時間:2021-11-05 06:10
  目的:原發(fā)性開角型青光眼(POAG)是全球重要的致盲性眼病,ABCA1基因是POAG的易感基因之一。本研究通過對POAG患者ABCA1基因編碼區(qū)變異進行檢測與分析,篩選ABCA1基因稀有非同義變異,探討其在POAG患者中的分布情況。方法:自2017年3月到2018年3月,共招募到散發(fā)型POAG患者398例和健康個體198例,采用全外顯子測序(WES)技術(shù)對ABCA1基因50個外顯子區(qū)進行測序,對在POAG患者中篩選出來的ABCA1基因稀有變異位點進行Sanger測序驗證,并在健康人群中進行頻率驗證。對這些ABCA1基因稀有變異進行生物信息學分析與統(tǒng)計學分析,并根據(jù)美國醫(yī)學遺傳學與基因組學學會(ACMG)遺傳變異分類標準與指南對稀有變異進行分類。結(jié)果:1.ABCA1基因WES結(jié)果:在398例POAG患者中,共27例檢出ABCA1基因稀有變異(MAF<0.01),共21個稀有變異位點,包括19個錯義變異、1個無義變異(c.2725C>T(p.Arg909X))以及1個移碼變異(c.15071508insGAGGT(p.Glu503GlyfsX7)),均為雜... 

【文章來源】:成都中醫(yī)藥大學四川省

【文章頁數(shù)】:72 頁

【學位級別】:碩士

【部分圖文】:

原發(fā)性開角型青光眼患者ABCA1基因編碼區(qū)稀有變異的篩查與研究


ABCA1蛋白合成HDL過程示意圖

示意圖,蛋白結(jié)構(gòu),示意圖,遺傳度


圖 2 ABCA1 蛋白結(jié)構(gòu)示意圖Figure2 The structure ofABCA1 proteinD1 和 ECD2 為胞外域;NBD1 和 NBD2 為核苷酸結(jié)合域;TMD1 和 TMD2 為R1 和 R2 為兩個小的調(diào)節(jié)域。ECD1 and ECD2 are extracellular domains. NBD1 and NBD2 are nucleotids. TMD1 and TMD2 are transmembrane domains. R1 and R2 are two R domains.CA1 基因稀有變異與 POAG 的關(guān)系尚未見報道OAG 作為眼科常見的復(fù)雜疾病,由遺傳因素和環(huán)境因素共同決定 研究基于常見疾病-常見變異(common disease-common variants)復(fù)雜疾病相關(guān)聯(lián)的常見變異(最小等位基因頻率 MAF>0.05)方面成就,但同時也發(fā)現(xiàn)常見變異只能解釋常見疾病遺傳度中很小的一較為嚴重的遺傳度的缺失[22]。近年來,隨著第二代測序(the next gecing , NGS)技術(shù)的發(fā)展,對全外顯子甚至整個基因組的測序研究

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圖 1-1 POAG 患者與健康者臨床特征 1-1 The clinical characteristics of POAG patients and healthy眼底(B)與健康者(A)相比,眼底發(fā)生典型病變;POA(C)相比,杯盤比明顯增高;POAG 患者視野(F)與健康 of the POAG patient (B) has a typical lesion compared w(A); the cup-to-disk ratio (D) of the POAG patient is significany people (C); the vision of the POAG patient (F ) is significision ofhealthypeople (E).與儀器試劑組 DNA 提取試劑盒(北京天根生化科技有限公司)n V6 試劑盒(安捷倫科技有限公司)、無水乙醇(成異丙醇(成都欣正通化工有限公司)、引物(上海生Taq Master Mix(康為世紀生物有限公司)、DM2000


本文編號:3477238

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