新生兒感染埃可病毒11型臨床、基因特征及分子檢測方法
發(fā)布時間:2021-11-03 03:47
背景感染是導(dǎo)致新生兒死亡的重要原因,住院患兒因免疫系統(tǒng)不成熟、使用廣譜抗生素、接受侵入性外科操作等因素影響,容易發(fā)生醫(yī)院獲得性感染,尤其在新生兒重癥監(jiān)護病房(Neonatal Intensive Care Unit,NICU)內(nèi),醫(yī)院獲得性感染與患兒的發(fā)病率和死亡率顯著相關(guān)。本實驗室長期對我院就診患者進行發(fā)熱呼吸道癥候群、發(fā)熱出疹癥候群和腹瀉癥候群病原譜的監(jiān)測,其中80%為兒童,包括新生兒。在監(jiān)測工作中發(fā)現(xiàn),2019年5~7月集中檢出來自我院NICU 7例?刹《11型(echovirus 11,EchoV 11)陽性樣本。EchoV 11屬于B組腸道病毒,多數(shù)致死性腸道病毒感染由EchoV 11所致。1977年至今,國外已報道多起新生兒病房內(nèi)EchoV 11的暴發(fā),死亡率高;國內(nèi)目前多為散發(fā)病例,近年也開始出現(xiàn)新生兒院內(nèi)感染的隱患,但尚未引起廣泛關(guān)注。目前臨床常用的EchoV 11檢測方法是利用多聚酶鏈式反應(yīng)(polymerase chain reaction,PCR)擴增VP1區(qū)序列后進行測序鑒定,該方法檢測周期較長(約2~3天),國內(nèi)外目前還未有針對EchoV 11的快速分子檢測...
【文章來源】:南方醫(yī)科大學(xué)廣東省
【文章頁數(shù)】:84 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖1?-2?EchoV?11感染患兒住院時間段??Fig.?1-2?Duration?of?hospitalization?for?children?with?EchoV?11?infection??
雙峰,陰??性對照孔在78°C左右出現(xiàn)非特異性峰值,故引物濃度為l.O^M時PCR反應(yīng)特異性??欠佳,不應(yīng)設(shè)置為最佳反應(yīng)濃度。??針對陽性樣本3個復(fù)孔擴增曲線的重復(fù)性,在0.2?0.8^M引物濃度中,濃度為??0.4pM吋重復(fù)性最好;針對擴增曲線的熒光強度,在0.2?0仰M引物濃度中,濃??度為0.2pM或0.6pM吋熒光強度最高;針對擴增曲線的Ct值,弓丨物濃度為0.2_??時Ct值在20左右,引物濃度為0.4?0.8pM時Ct值均為18左右。不同引物濃度的熔??解曲線綜合展示見圖2-3。??Melt?Curve?Plot??。5?2??r::??i?-?/1??i?/?1??\___??05?〇?70?0?75?〇?80?0?8S?0?MO?09?0??Temperature?(^C)??圖2-3引物濃度0.2-1你M?PCR反應(yīng)熔解曲線??Figure?2-3?PCR?Melt?curve?plot?with?primer?concentration?of?0.2-1.0?|iM??47??
?第二章EchoV?11熒光定量PCR檢測方法的建立???copies/|il、10?copies/(il>?102?copies/(il、103?copies/|iK?104?copies/|il、105?copies/|iK??106?copies/jxl、107?copies/(il、108?copies/jxl、109?copies/pl系列濃度的標準品。??圖2-6?EchoV?11?VP1完整區(qū)域擴增產(chǎn)物瓊脂糖凝膠電泳圖??Figure?2-6?Agarose?gel?electrophoresis?of?amplification?product?of?EchoV?11?VP1?complete??sequence??注:電泳條帶從左至右依次為M?(DNAMakerB500351:?100?5000bp);?1、2?(95128病毒液??擴增產(chǎn)物),擴增產(chǎn)物片段長約1400bp。??圖2-7?TA克隆插入片段擴增產(chǎn)物瓊脂糖凝膠電泳圖??Figure?2-7?Agarose?gel?electrophoresis?of?amplification?product?of?TA?clone?insert?sequence??注:電泳條帶從左至右依次為M?(DNAMakerB500351:?100?5000bp);?1?(TA克隆插入片??段擴增產(chǎn)物),擴增產(chǎn)物片段長約MOObp。??52??
本文編號:3472982
【文章來源】:南方醫(yī)科大學(xué)廣東省
【文章頁數(shù)】:84 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖1?-2?EchoV?11感染患兒住院時間段??Fig.?1-2?Duration?of?hospitalization?for?children?with?EchoV?11?infection??
雙峰,陰??性對照孔在78°C左右出現(xiàn)非特異性峰值,故引物濃度為l.O^M時PCR反應(yīng)特異性??欠佳,不應(yīng)設(shè)置為最佳反應(yīng)濃度。??針對陽性樣本3個復(fù)孔擴增曲線的重復(fù)性,在0.2?0.8^M引物濃度中,濃度為??0.4pM吋重復(fù)性最好;針對擴增曲線的熒光強度,在0.2?0仰M引物濃度中,濃??度為0.2pM或0.6pM吋熒光強度最高;針對擴增曲線的Ct值,弓丨物濃度為0.2_??時Ct值在20左右,引物濃度為0.4?0.8pM時Ct值均為18左右。不同引物濃度的熔??解曲線綜合展示見圖2-3。??Melt?Curve?Plot??。5?2??r::??i?-?/1??i?/?1??\___??05?〇?70?0?75?〇?80?0?8S?0?MO?09?0??Temperature?(^C)??圖2-3引物濃度0.2-1你M?PCR反應(yīng)熔解曲線??Figure?2-3?PCR?Melt?curve?plot?with?primer?concentration?of?0.2-1.0?|iM??47??
?第二章EchoV?11熒光定量PCR檢測方法的建立???copies/|il、10?copies/(il>?102?copies/(il、103?copies/|iK?104?copies/|il、105?copies/|iK??106?copies/jxl、107?copies/(il、108?copies/jxl、109?copies/pl系列濃度的標準品。??圖2-6?EchoV?11?VP1完整區(qū)域擴增產(chǎn)物瓊脂糖凝膠電泳圖??Figure?2-6?Agarose?gel?electrophoresis?of?amplification?product?of?EchoV?11?VP1?complete??sequence??注:電泳條帶從左至右依次為M?(DNAMakerB500351:?100?5000bp);?1、2?(95128病毒液??擴增產(chǎn)物),擴增產(chǎn)物片段長約1400bp。??圖2-7?TA克隆插入片段擴增產(chǎn)物瓊脂糖凝膠電泳圖??Figure?2-7?Agarose?gel?electrophoresis?of?amplification?product?of?TA?clone?insert?sequence??注:電泳條帶從左至右依次為M?(DNAMakerB500351:?100?5000bp);?1?(TA克隆插入片??段擴增產(chǎn)物),擴增產(chǎn)物片段長約MOObp。??52??
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