為發(fā)掘甘薯近緣野生種三裂葉薯（Ipomoea triloba）的NBS-LRR類抗病基因,從基因數(shù)據(jù)庫中對三裂葉薯基因組序列進行了篩選、鑒定和分析。結(jié)果表明,從三裂葉薯的98 025個基因中,篩選到282個編碼NBS-LRR類蛋白的基因,其中N型80個,NL型83個,CN型28個,CNL型57個,TN型10個,TNL型23個,RN型1個。三裂葉薯的16條染色體上均含有NBS-LRR家族基因,數(shù)量最多的染色體含有65個,最少的只有1個。三裂葉薯基因組共有55個基因簇,包含了63.5%的NBS-LRR家族基因。在NBS-LRR抗病基因家族中,CNL和TNL亞家族分別對應(yīng)到7和11個保守結(jié)構(gòu)域。這為三裂葉薯抗性資源的利用提供了科學(xué)參考。 

【文章來源】：熱帶亞熱帶植物學(xué)報. 2020,28(05)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：10 頁

【部分圖文】：

三裂葉薯NBS-LRR基因家族中CNL亞家族蛋白保守結(jié)構(gòu)域分布

將三裂葉薯的NBS-LRR家族蛋白中CC/TIR/RPW8/NBS/LRR結(jié)構(gòu)域序列分別提取，使用MEGA X構(gòu)建進化樹(圖4)，可見有3個明顯的分支，分別為CNL型(藍色)、TNL型(紫色)和RN型(黃色)。進化樹分支中有些基因分支路徑很長，如CP025666.1-snap.8798、CP025670.1-snap.5147等,推測這類基因的“祖先”基因在較早時即已發(fā)生分化，相應(yīng)的基因序列也發(fā)生了較大的變化。有些基因序列的分支距離較近,如CP025666.1-snap.1140和CP025666.1-snap.1141、CP025663.1-snap.531和CP025663.1-snap.532，說明這些變化發(fā)生的時間較晚。圖3 三裂葉薯CNL和TNL亞家族NB-ARC保守性分析

三裂葉薯CNL和TNL亞家族NB-ARC保守性分析

【參考文獻】：
期刊論文
[1]甘薯二倍體近緣野生種三裂葉薯MYB轉(zhuǎn)錄因子全基因組分析及逆境脅迫響應(yīng)[J]. 石曉雯,賀立恒,焦晉華,劉霞宇,王婷,劉世芳,賈小云,李潤植.  核農(nóng)學(xué)報. 2018(07)
[2]小果野蕉（Musa acuminata）全基因組NBS抗病基因的鑒定與分析[J]. 劉夢雅,李偉明,吳偉,葛學(xué)軍.  熱帶亞熱帶植物學(xué)報. 2014(05)
[3]五爪金龍、三裂葉薯和七爪龍水浸液對4種作物種子萌發(fā)與幼苗生長的影響[J]. 宋鑫,沈奕德,黃喬喬,李曉霞,范志偉.  熱帶生物學(xué)報. 2013(01)
[4]中國甘薯種質(zhì)資源核心種質(zhì)構(gòu)建初探[J]. 趙冬蘭,唐君,曹清河,周志林.  江西農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2012(10)
[5]植物抗病基因（R）與病原物無毒基因（Avr）相互作用機制的研究進展[J]. 何鋒,王長春,王鋒青,楊玲.  中國細胞生物學(xué)學(xué)報. 2011(09)
[6]甘薯NBS類抗病基因類似物的分離與序列分析[J]. 陳觀水,周以飛,林生,潘大仁.  熱帶亞熱帶植物學(xué)報. 2006(05)
[7]甘薯品種抗旱適應(yīng)性綜合評價的方法研究[J]. 張明生,劉志,戚金亮,張麗霞,楊永華.  熱帶亞熱帶植物學(xué)報. 2005(06)
[8]我國甘薯種質(zhì)資源研究的歷史與現(xiàn)狀[J]. 房伯平,張雄堅,陳景益,安康.  廣東農(nóng)業(yè)科學(xué). 2004(S1)
[9]甘薯和近緣野生種Ipomoea triloba的種間體細胞雜種植株再生[J]. 王晶珊,劉慶昌,孟祥霞,王維華,徐麗娟,翟紅.  農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報. 2003(01)
[10]水稻NBS-LRR類R基因同源序列[J]. 鄭先武,翟文學(xué),李曉兵,王文君,徐吉臣,劉國振,朱立煌.  中國科學(xué)（C輯:生命科學(xué)）. 2001(01)



本文編號：3469806