托品烷生物堿生物合成途徑中三個新基因的發(fā)現(xiàn)與功能鑒定
發(fā)布時間:2021-10-30 10:39
天然產(chǎn)物(Natural Products)是藥物的重要來源,在治療疾病、維護健康和改善生活質(zhì)量等方面起到十分重要的作用。托品烷生物堿(Tropane Alkaloids,TAs)是一類具有獨特托品烷骨架(Tropane Skeleton)的生物堿。莨菪堿(Hyoscyamine)和東莨菪堿(Scopolamine)是TAs中最具代表性的藥物,在臨床上作為抗膽堿藥物用于麻醉鎮(zhèn)痛、止咳平喘、治療暈動癥和農(nóng)藥中毒等。茄科藥用植物如顛茄(Atropa belladonna)、曼陀羅(Datura species)和澳洲毒茄雜交種(Dubiosia×hybrid)是生產(chǎn)TAs的主要來源。顛茄為國內(nèi)外多部藥典收錄且大規(guī)模人工種植,是最為重要的生產(chǎn)TAs的藥用植物。顛茄葉片中TAs含量很低,莨菪堿含量一般為0.2%干重(Dry Weight,DW),東莨菪堿含量一般為0.02%DW。莨菪堿和東莨菪堿的市場需求巨大,來源十分有限,導(dǎo)致其藥物資源短缺。代謝工程技術(shù)和合成生物學(xué)技術(shù)被認(rèn)為是解決藥物資源短缺問題最為有效的方法,但是代謝工程和合成生物學(xué)都依賴于鑒定生物合成途徑中的基因/酶。迄今為止,共有9個...
【文章來源】:西南大學(xué)重慶市 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:141 頁
【學(xué)位級別】:博士
【部分圖文】:
托品環(huán)骨架、莨菪堿和東莨菪堿分子結(jié)構(gòu)
西南大學(xué)博士學(xué)位論文4`r圖1-2.TAs生物合成途徑實線箭頭表示已鑒定的反應(yīng),虛線表示未知反應(yīng)或多步反應(yīng)。Figure1-2.BiosyntheticpathwayoftropanealkaloidsSolidarrowsindicateidentifiedreactions,dashedlinesrepresentedunknownormultistepreactions.1.2.1鳥氨酸脫羧酶鳥氨酸是TAs生物合成的基本前體,其脫羧產(chǎn)物腐胺是多胺、TAs和尼古丁的共同前體[59]。二氟甲基鳥氨酸(Difluoromethylornithine,DFMO)是鳥氨酸脫羧酶(OrnithineDecarboxylase,ODC)的專一抑制劑,用其處理天仙子和顛茄等植物材料,能夠大幅度減少莨菪堿的生物合成,表明ODC參與TAs的生物合成[60]。ODC屬于磷酸吡哆醛依賴的氨基酸脫羧酶家族,能夠以鳥氨酸作為底物,直接脫羧形成腐胺[61]。由于ODC參與多胺和尼古丁生物合成,其相關(guān)研究大多集中在于植物抗逆性和尼古丁生物合成方面[62]。在關(guān)于ODC參與TAs生物研究方面,Michael等從草本曼陀羅中克隆了ODC基因,發(fā)現(xiàn)該基因在側(cè)根中高表達,將該基因在大腸桿菌中表達,能夠檢測到較高的鳥氨酸脫羧活性;但由于沒有純化重組蛋白,關(guān)于該酶的相關(guān)動力學(xué)研究并不清楚[63]。Zhao等從天仙子中克隆了ODC基因(HnODC),并開展了酶動力學(xué)研究,表明HnODC能夠高效率催化鳥氨酸脫羧生成腐胺[64]。趙騰飛對顛茄ODC(AbODC)進行了較為系統(tǒng)的
西南大學(xué)博士學(xué)位論文40圖3-1.hmmsearch篩選獲得的羥酸脫氫酶基因和報道的TAs生物合成途徑基因在顛茄不同組織中的表達相關(guān)性分析紅線框表示報道的TAs生物合成途徑基因和具有根特異性表達的候選基因。Figure3-1.CorrelationanalysisoftheexpressionofhydroxylaciddehydrogenasesgenesbyhmmsearchandTAsbiosyntheticpathwaygenesindifferenttissuesofA.belladonnaTheredboxrepresentedtheidentifiedTAsbiosyntheticpathwaygenesandcandidategeneswithroot-specificexpression.3.2.2克隆顛茄PPR的cDNA序列將上述登錄號為aba_locus_14073的unigene命名為苯丙酮酸還原酶基因(PPR)。采用RACE技術(shù)獲得了471bp長度的3′末端和461bp長度的5′末端,利用VectorNTI11.5將轉(zhuǎn)錄組序列和RACE獲得的3′和5′末端序列進行拼接,獲得了PPR基因電子序列;高保真DNA聚合酶擴增獲得PPR基因的物理序列。顛茄PPR的cDNA序列為1445bp,包含7bp的5′UTR、1029bp的ORF和408bp的3′UTR,該基因編碼342個氨基酸的多肽,預(yù)測其分子量為38.4kDa,等電點為6.09(圖3-2)。
【參考文獻】:
期刊論文
[1]植物天然產(chǎn)物與合成生物學(xué)[J]. 羅杰,王勇,鄭亞潔,黃繼榮. 植物生理學(xué)報. 2017(08)
[2]天仙子中參與托品烷生物堿生物合成的ArAT基因的克隆及功能鑒定[J]. 李笑,強瑋,邱飛,陳敏,蘭小中,廖志華,劉小強. 藥學(xué)學(xué)報. 2017(01)
[3]托品烷生物堿生物合成與代謝工程研究進展[J]. 強瑋,范雨芳,廖志華. 世界科學(xué)技術(shù)-中醫(yī)藥現(xiàn)代化. 2016(11)
[4]木本曼陀羅中催化東莨菪堿生物合成關(guān)鍵步驟的H6H基因克隆與表達分析[J]. 強瑋,侯艷玲,李笑,夏科,廖志華. 藥學(xué)學(xué)報. 2015(10)
[5]植物次生代謝產(chǎn)物生物反應(yīng)器研究進展[J]. 唐克軒,沈乾,付雪晴,顏廷祥. 中國農(nóng)業(yè)科技導(dǎo)報. 2014(01)
[6]顛茄托品烷生物堿合成途徑基因表達分析與生物堿積累研究[J]. 強瑋,王亞雄,張巧卓,李金弟,夏科,吳能表,廖志華. 中國中藥雜志. 2014(01)
[7]過表達莨菪h6h基因提高顛茄東莨菪堿含量的研究[J]. 李金弟,秦白富,楊春賢,蘭小中,吳能表,廖志華. 中國中藥雜志. 2013(11)
[8]藥用植物次生代謝工程研究概況[J]. 生書晶,趙煒,趙樹進. 生命的化學(xué). 2010(06)
[9]麻醉學(xué)過去現(xiàn)在與未來[J]. 姚尚龍. 皖南醫(yī)學(xué)院學(xué)報. 2009(01)
博士論文
[1]顛茄N-甲基腐胺氧化酶基因的克隆與功能研究[D]. Zun Lai Lai Htun.西南大學(xué) 2019
本文編號:3466582
【文章來源】:西南大學(xué)重慶市 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:141 頁
【學(xué)位級別】:博士
【部分圖文】:
托品環(huán)骨架、莨菪堿和東莨菪堿分子結(jié)構(gòu)
西南大學(xué)博士學(xué)位論文4`r圖1-2.TAs生物合成途徑實線箭頭表示已鑒定的反應(yīng),虛線表示未知反應(yīng)或多步反應(yīng)。Figure1-2.BiosyntheticpathwayoftropanealkaloidsSolidarrowsindicateidentifiedreactions,dashedlinesrepresentedunknownormultistepreactions.1.2.1鳥氨酸脫羧酶鳥氨酸是TAs生物合成的基本前體,其脫羧產(chǎn)物腐胺是多胺、TAs和尼古丁的共同前體[59]。二氟甲基鳥氨酸(Difluoromethylornithine,DFMO)是鳥氨酸脫羧酶(OrnithineDecarboxylase,ODC)的專一抑制劑,用其處理天仙子和顛茄等植物材料,能夠大幅度減少莨菪堿的生物合成,表明ODC參與TAs的生物合成[60]。ODC屬于磷酸吡哆醛依賴的氨基酸脫羧酶家族,能夠以鳥氨酸作為底物,直接脫羧形成腐胺[61]。由于ODC參與多胺和尼古丁生物合成,其相關(guān)研究大多集中在于植物抗逆性和尼古丁生物合成方面[62]。在關(guān)于ODC參與TAs生物研究方面,Michael等從草本曼陀羅中克隆了ODC基因,發(fā)現(xiàn)該基因在側(cè)根中高表達,將該基因在大腸桿菌中表達,能夠檢測到較高的鳥氨酸脫羧活性;但由于沒有純化重組蛋白,關(guān)于該酶的相關(guān)動力學(xué)研究并不清楚[63]。Zhao等從天仙子中克隆了ODC基因(HnODC),并開展了酶動力學(xué)研究,表明HnODC能夠高效率催化鳥氨酸脫羧生成腐胺[64]。趙騰飛對顛茄ODC(AbODC)進行了較為系統(tǒng)的
西南大學(xué)博士學(xué)位論文40圖3-1.hmmsearch篩選獲得的羥酸脫氫酶基因和報道的TAs生物合成途徑基因在顛茄不同組織中的表達相關(guān)性分析紅線框表示報道的TAs生物合成途徑基因和具有根特異性表達的候選基因。Figure3-1.CorrelationanalysisoftheexpressionofhydroxylaciddehydrogenasesgenesbyhmmsearchandTAsbiosyntheticpathwaygenesindifferenttissuesofA.belladonnaTheredboxrepresentedtheidentifiedTAsbiosyntheticpathwaygenesandcandidategeneswithroot-specificexpression.3.2.2克隆顛茄PPR的cDNA序列將上述登錄號為aba_locus_14073的unigene命名為苯丙酮酸還原酶基因(PPR)。采用RACE技術(shù)獲得了471bp長度的3′末端和461bp長度的5′末端,利用VectorNTI11.5將轉(zhuǎn)錄組序列和RACE獲得的3′和5′末端序列進行拼接,獲得了PPR基因電子序列;高保真DNA聚合酶擴增獲得PPR基因的物理序列。顛茄PPR的cDNA序列為1445bp,包含7bp的5′UTR、1029bp的ORF和408bp的3′UTR,該基因編碼342個氨基酸的多肽,預(yù)測其分子量為38.4kDa,等電點為6.09(圖3-2)。
【參考文獻】:
期刊論文
[1]植物天然產(chǎn)物與合成生物學(xué)[J]. 羅杰,王勇,鄭亞潔,黃繼榮. 植物生理學(xué)報. 2017(08)
[2]天仙子中參與托品烷生物堿生物合成的ArAT基因的克隆及功能鑒定[J]. 李笑,強瑋,邱飛,陳敏,蘭小中,廖志華,劉小強. 藥學(xué)學(xué)報. 2017(01)
[3]托品烷生物堿生物合成與代謝工程研究進展[J]. 強瑋,范雨芳,廖志華. 世界科學(xué)技術(shù)-中醫(yī)藥現(xiàn)代化. 2016(11)
[4]木本曼陀羅中催化東莨菪堿生物合成關(guān)鍵步驟的H6H基因克隆與表達分析[J]. 強瑋,侯艷玲,李笑,夏科,廖志華. 藥學(xué)學(xué)報. 2015(10)
[5]植物次生代謝產(chǎn)物生物反應(yīng)器研究進展[J]. 唐克軒,沈乾,付雪晴,顏廷祥. 中國農(nóng)業(yè)科技導(dǎo)報. 2014(01)
[6]顛茄托品烷生物堿合成途徑基因表達分析與生物堿積累研究[J]. 強瑋,王亞雄,張巧卓,李金弟,夏科,吳能表,廖志華. 中國中藥雜志. 2014(01)
[7]過表達莨菪h6h基因提高顛茄東莨菪堿含量的研究[J]. 李金弟,秦白富,楊春賢,蘭小中,吳能表,廖志華. 中國中藥雜志. 2013(11)
[8]藥用植物次生代謝工程研究概況[J]. 生書晶,趙煒,趙樹進. 生命的化學(xué). 2010(06)
[9]麻醉學(xué)過去現(xiàn)在與未來[J]. 姚尚龍. 皖南醫(yī)學(xué)院學(xué)報. 2009(01)
博士論文
[1]顛茄N-甲基腐胺氧化酶基因的克隆與功能研究[D]. Zun Lai Lai Htun.西南大學(xué) 2019
本文編號:3466582
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