SPL家族基因復(fù)制及功能分化分析
發(fā)布時間:2021-10-22 10:13
【目的】基因復(fù)制及隨后的功能分化是基因組和物種演化的重要驅(qū)動力。植物特有的轉(zhuǎn)錄因子家族SPL(SQUAMOSA-promoter binding protein like)廣泛參與調(diào)控植物生長發(fā)育及響應(yīng)逆境脅迫,為研究重復(fù)基因的起源方式和進(jìn)化命運(yùn)提供了良好的研究系統(tǒng)。本研究對葡萄(Vitis vinifera)、番木瓜(Carica papaya)、毛果楊(Populus trichocarpa)和擬南芥(Arabidopsis thaliana)4種模式植物的SPL基因家族開展基因復(fù)制及功能分化分析,為進(jìn)一步研究SPL基因功能、預(yù)測種屬特異性的功能基因提供系統(tǒng)進(jìn)化角度的參考!痉椒ā坷肧BP特征結(jié)構(gòu)域,鑒定葡萄、番木瓜、毛果楊和擬南芥4種模式植物中SPL基因家族成員,并利用最大似然法構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹。基于物種內(nèi)、物種間基因組共線性,分析SPL基因家族發(fā)生基因復(fù)制的方式及差異保留情況,并計(jì)算保留的SPL直系和旁系同源基因的同義、非同義替換率,分析功能分化情況!窘Y(jié)果】在4種模式植物中共鑒定出SPL基因73個,其中42個是miR156的靶基因。系統(tǒng)進(jìn)化分析顯示:73個SPL基因聚類為9個...
【文章來源】:南京林業(yè)大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2020,44(05)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:12 頁
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]SPL轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控植物花發(fā)育及其分子機(jī)制研究進(jìn)展[J]. 田晶,趙雪媛,謝隆聖,權(quán)晉誼,姚連梅,王國東,鄭要強(qiáng),劉雪梅. 南京林業(yè)大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2018(03)
[2]Conservation and Diversity of MicroRNA-associated Copper-regulatory Networks in Populus trichocarpa[J]. Vincent L.Chiang. Journal of Integrative Plant Biology. 2011(11)
[3]重復(fù)基因的進(jìn)化--回顧與進(jìn)展[J]. 孫紅正,葛頌. 植物學(xué)報. 2010(01)
本文編號:3450892
【文章來源】:南京林業(yè)大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2020,44(05)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:12 頁
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]SPL轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控植物花發(fā)育及其分子機(jī)制研究進(jìn)展[J]. 田晶,趙雪媛,謝隆聖,權(quán)晉誼,姚連梅,王國東,鄭要強(qiáng),劉雪梅. 南京林業(yè)大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2018(03)
[2]Conservation and Diversity of MicroRNA-associated Copper-regulatory Networks in Populus trichocarpa[J]. Vincent L.Chiang. Journal of Integrative Plant Biology. 2011(11)
[3]重復(fù)基因的進(jìn)化--回顧與進(jìn)展[J]. 孫紅正,葛頌. 植物學(xué)報. 2010(01)
本文編號:3450892
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