目的:長非編碼RNA（long non-coding RNA,lncRNA）可以競爭性結(jié)合內(nèi)源性miRNA,從而誘導(dǎo)miRNA靶基因表達(dá)上調(diào)。這類細(xì)胞內(nèi)競爭性結(jié)合miRNA的RNA也被稱作競爭性內(nèi)源性RNA（competing endogenous RNA,ceRNA）。目前,研究已發(fā)現(xiàn)ceRNA在肝硬化的發(fā)生發(fā)展中起著重要作用。盡管肝硬化存在較大的癌變風(fēng)險(xiǎn),但尚無研究系統(tǒng)化構(gòu)建肝硬化癌變相關(guān)ceRNA網(wǎng)絡(luò)。本研究擬利用基因表達(dá)譜數(shù)據(jù),構(gòu)建肝硬化癌變相關(guān)的ceRNA網(wǎng)絡(luò),挖掘網(wǎng)絡(luò)中的關(guān)鍵基因。方法:在Gene Expression Omnibus（GEO）數(shù)據(jù)中,獲取肝硬化-肝細(xì)胞性肝癌各階段組織的基因芯片數(shù)據(jù),利用芯片探針重注釋的方法,構(gòu)建lncRNA-mRNA雙相表達(dá)矩陣。然后,利用加權(quán)基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析（weighted gene co-expression network analysis,WGCNA）將基因根據(jù)表達(dá)水平上的相關(guān)性分成不同的基因集模塊（module）。在與肝硬化癌變顯著相關(guān)的模塊中,分別構(gòu)建ceRNA網(wǎng)絡(luò)。將WGCNA與ceRNA網(wǎng)絡(luò)分析中共同的樞紐基因（hub... 

【文章來源】：武漢大學(xué)湖北省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：102 頁

【學(xué)位級(jí)別】：博士

【部分圖文】：

基于65例樣本mRNA和lncRNA表達(dá)數(shù)據(jù)的層次聚類圖

加權(quán)基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析的參數(shù)選擇

基于拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)的基因?qū)哟尉垲悩浼皠?dòng)態(tài)剪切法確定的基因集模塊


本文編號(hào)：3442727