甘草DNA甲基轉(zhuǎn)移酶基因在高壓靜電場脅迫下的表達及其系統(tǒng)發(fā)育分析
發(fā)布時間:2021-10-09 23:28
DNA甲基化是表觀遺傳修飾重要方式之一,參與調(diào)節(jié)植物生長發(fā)育及進化等一系列生命過程。DNA甲基化的建立和維持依靠DNA甲基轉(zhuǎn)移酶的參與。本論文以烏拉爾甘草為材料,通過PCR技術(shù)分離到甘草中疑似甲基轉(zhuǎn)移酶基因部分序列,通過相關(guān)生物信息學分析,得到初步確認。構(gòu)建了其與苜蓿、擬南芥等20個物種相關(guān)基因的系統(tǒng)進化樹;采用實時熒光定量技術(shù)(RT-qPCR)研究了甘草幼苗中三類甲基轉(zhuǎn)移酶基因經(jīng)過高壓靜電場處理的表達情況。主要結(jié)果如下:1、采用簡并引物PCR擴增的方法,從甘草基因組中分離出了MET1類、DRM類和CMT類甲基轉(zhuǎn)移酶基因片段各一條。MET1類甲基轉(zhuǎn)移酶目的片段長度為951bp,與豌豆MET1基因核酸序列相似性為92.63%;DRM類甲基轉(zhuǎn)移酶目的片段長度為357bp,與苜蓿DRM2基因核酸序列相似性為92.37%;CMT類甲基轉(zhuǎn)移酶目的片段長度為692bp,與苜蓿CMT1基因核酸序列相似性為83.97%。2、采用系統(tǒng)進化分析法構(gòu)建了甘草MET1類、DRM類和CMT類甲基轉(zhuǎn)移酶基因和其它20余物種的進化樹,甘草的MET1類甲基轉(zhuǎn)移酶和鷹嘴豆距離很近,與DRM類甲基轉(zhuǎn)移酶距離最近的是苜蓿,...
【文章來源】:內(nèi)蒙古大學內(nèi)蒙古自治區(qū) 211工程院校
【文章頁數(shù)】:59 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
甘草基因組DNA電泳圖
內(nèi)蒙古大學碩士學位論文13圖2-3以甘草DNA為模板的PCR電泳圖M:2000bpDNAMaker;1:CMT類基因片段擴增結(jié)果;2:DRM類基因片段擴增結(jié)果;3,4:MET1類基因片段擴增結(jié)果Fig.2-3TheelectrophoresisofPCRusinglicoricegenomicDNAasatemplateM:2000bpDNAMaker;1:AmplifiedresultofCMT-like;2:AmplifiedresultofDRM-like;3,4:AmplifiedresultofMET1-like2.3.4基因特異片段序列分析2.3.4.1MET1基因特異片段序列分析測序結(jié)果表明,引物對M1/M2擴增片段長度951bp,與預期大小一致。進入NCBI進行BLAST,結(jié)果顯示,引物對M1/M2擴增出的951bp片段Gu-M1與豌豆MET1基因(AF034419)的核酸序列相似性為92.63%,E-value:3e-177;氨基酸序列相似性為96.08%,E-value:5e-30?纱_認Gu-M1為甘草MET1基因特異性片段。
內(nèi)蒙古大學碩士學位論文14圖2-4MET1類基因片段核酸序列與豌豆序列在BLAST中比對Query:所測甘草序列;Subject:豌豆序列AlignmentScores>=20080-200Figure2-4MET1genefragmentnucleicacidsequenceandpeasequencealignmentinBLASTQuery:measuredlicoricesequence;Subject:peasequenceAlignmentScores>=20080-200
【參考文獻】:
期刊論文
[1]甘草主要化學成分及藥效活性與環(huán)境關(guān)系研究進展[J]. 李倩,高海榮,郭九峰. 黑龍江農(nóng)業(yè)科學. 2019(09)
[2]Expectation: Advances and Entropy Analysis of Plant Epigenetics under Stress[J]. Qian LI,Hairong GAO,Jiufeng GUO,Mengyu MA,Zhuoya ZHAO. Agricultural Science & Technology. 2017(10)
[3]福州宦溪野生蕉CBF7的cDNA與啟動子克隆及在不同溫度下的表達特性[J]. 劉煒?gòu)O,林玉玲,賴鐘雄. 應用與環(huán)境生物學報. 2017(02)
[4]電場處理后檸條(Caragana korshinskii)種子對干旱脅迫的敏感性[J]. 王文星,楊體強,王共義,劉翔宇,趙清春,李偉. 中國沙漠. 2016(05)
[5]靈芝DNA甲基轉(zhuǎn)移酶(GlMET1)基因克隆及原核表達誘導分析[J]. 查良平,王亞君,劉爽,趙玉洋,袁媛,黃璐琦. 中國中藥雜志. 2016(06)
[6]高壓靜電場對羽衣甘藍自交不親和系種子基因組DNA甲基化的影響[J]. 張旸,胡中影,李娜,丁兵,王江,解莉楠. 華北農(nóng)學報. 2015(S1)
[7]甘草組培與栽培主要成分的提取及活性比較[J]. 滿淑麗,劉延濤,張咪,郭松波,高文遠. 天津科技大學學報. 2015(04)
[8]甘藍型油菜及其親本物種甲基化酶I基因的克隆及表達模式[J]. 譚河林,許欣穎,付立曼,向小娥,李劍橋,郭昊倫,葉文雪. 作物學報. 2015(03)
[9]逆境脅迫下植物DNA甲基化變異的研究進展[J]. 徐妍,張海玲,徐香玲,張會新,姚琳,張必弦,王全偉. 中國生物工程雜志. 2014(10)
[10]高壓靜電場對大豆幼苗生長的影響[J]. 黃洪云. 大豆科學. 2012(06)
博士論文
[1]草莓和蘋果DNA甲基轉(zhuǎn)移酶基因分離及表達分析[D]. 常琳琳.沈陽農(nóng)業(yè)大學 2009
[2]高壓脈沖電場對蔬菜種子生物學效應的研究[D]. 遲燕平.吉林大學 2008
碩士論文
[1]半膜覆蓋下玉米主要農(nóng)藝性狀變化及基因差異表達的研究[D]. 高海榮.內(nèi)蒙古大學 2018
[2]高壓靜電場處理甘草三年生植株DNA甲基化多態(tài)性分析[D]. 王斯靚.內(nèi)蒙古大學 2018
[3]蒙古口蘑菌絲體生長發(fā)育及其漆酶表達特性研究[D]. 劉曉婷.內(nèi)蒙古大學 2017
[4]負高壓靜電場對甘草種子萌發(fā)及幾項生理指標的影響[D]. 李亞嬌.內(nèi)蒙古大學 2016
[5]高壓靜電場對采后綠蘆筍生理特性影響的研究[D]. 陳慶.江西農(nóng)業(yè)大學 2015
[6]優(yōu)質(zhì)甘草組培快繁及遺傳穩(wěn)定性分析[D]. 蘇姍.河北科技大學 2015
[7]茶樹冷馴化過程中DNA甲基化的變化分析及DNA甲基轉(zhuǎn)移酶基因CsDRM2的克隆[D]. 周艷華.中國農(nóng)業(yè)科學院 2015
[8]馬鈴薯甲基轉(zhuǎn)移酶和去甲基化酶預測及表達研究[D]. 毛銳濤.內(nèi)蒙古大學 2014
[9]高壓靜電場對羽衣甘藍種子萌發(fā)過程DNA甲基化的影響[D]. 李娜.東北林業(yè)大學 2013
[10]非生物脅迫下SIBADH基因在遼寧堿蓬和轉(zhuǎn)pB-BADH煙草中的表達特性分析[D]. 張寅寅.遼寧師范大學 2013
本文編號:3427193
【文章來源】:內(nèi)蒙古大學內(nèi)蒙古自治區(qū) 211工程院校
【文章頁數(shù)】:59 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
甘草基因組DNA電泳圖
內(nèi)蒙古大學碩士學位論文13圖2-3以甘草DNA為模板的PCR電泳圖M:2000bpDNAMaker;1:CMT類基因片段擴增結(jié)果;2:DRM類基因片段擴增結(jié)果;3,4:MET1類基因片段擴增結(jié)果Fig.2-3TheelectrophoresisofPCRusinglicoricegenomicDNAasatemplateM:2000bpDNAMaker;1:AmplifiedresultofCMT-like;2:AmplifiedresultofDRM-like;3,4:AmplifiedresultofMET1-like2.3.4基因特異片段序列分析2.3.4.1MET1基因特異片段序列分析測序結(jié)果表明,引物對M1/M2擴增片段長度951bp,與預期大小一致。進入NCBI進行BLAST,結(jié)果顯示,引物對M1/M2擴增出的951bp片段Gu-M1與豌豆MET1基因(AF034419)的核酸序列相似性為92.63%,E-value:3e-177;氨基酸序列相似性為96.08%,E-value:5e-30?纱_認Gu-M1為甘草MET1基因特異性片段。
內(nèi)蒙古大學碩士學位論文14圖2-4MET1類基因片段核酸序列與豌豆序列在BLAST中比對Query:所測甘草序列;Subject:豌豆序列AlignmentScores>=20080-200Figure2-4MET1genefragmentnucleicacidsequenceandpeasequencealignmentinBLASTQuery:measuredlicoricesequence;Subject:peasequenceAlignmentScores>=20080-200
【參考文獻】:
期刊論文
[1]甘草主要化學成分及藥效活性與環(huán)境關(guān)系研究進展[J]. 李倩,高海榮,郭九峰. 黑龍江農(nóng)業(yè)科學. 2019(09)
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[4]電場處理后檸條(Caragana korshinskii)種子對干旱脅迫的敏感性[J]. 王文星,楊體強,王共義,劉翔宇,趙清春,李偉. 中國沙漠. 2016(05)
[5]靈芝DNA甲基轉(zhuǎn)移酶(GlMET1)基因克隆及原核表達誘導分析[J]. 查良平,王亞君,劉爽,趙玉洋,袁媛,黃璐琦. 中國中藥雜志. 2016(06)
[6]高壓靜電場對羽衣甘藍自交不親和系種子基因組DNA甲基化的影響[J]. 張旸,胡中影,李娜,丁兵,王江,解莉楠. 華北農(nóng)學報. 2015(S1)
[7]甘草組培與栽培主要成分的提取及活性比較[J]. 滿淑麗,劉延濤,張咪,郭松波,高文遠. 天津科技大學學報. 2015(04)
[8]甘藍型油菜及其親本物種甲基化酶I基因的克隆及表達模式[J]. 譚河林,許欣穎,付立曼,向小娥,李劍橋,郭昊倫,葉文雪. 作物學報. 2015(03)
[9]逆境脅迫下植物DNA甲基化變異的研究進展[J]. 徐妍,張海玲,徐香玲,張會新,姚琳,張必弦,王全偉. 中國生物工程雜志. 2014(10)
[10]高壓靜電場對大豆幼苗生長的影響[J]. 黃洪云. 大豆科學. 2012(06)
博士論文
[1]草莓和蘋果DNA甲基轉(zhuǎn)移酶基因分離及表達分析[D]. 常琳琳.沈陽農(nóng)業(yè)大學 2009
[2]高壓脈沖電場對蔬菜種子生物學效應的研究[D]. 遲燕平.吉林大學 2008
碩士論文
[1]半膜覆蓋下玉米主要農(nóng)藝性狀變化及基因差異表達的研究[D]. 高海榮.內(nèi)蒙古大學 2018
[2]高壓靜電場處理甘草三年生植株DNA甲基化多態(tài)性分析[D]. 王斯靚.內(nèi)蒙古大學 2018
[3]蒙古口蘑菌絲體生長發(fā)育及其漆酶表達特性研究[D]. 劉曉婷.內(nèi)蒙古大學 2017
[4]負高壓靜電場對甘草種子萌發(fā)及幾項生理指標的影響[D]. 李亞嬌.內(nèi)蒙古大學 2016
[5]高壓靜電場對采后綠蘆筍生理特性影響的研究[D]. 陳慶.江西農(nóng)業(yè)大學 2015
[6]優(yōu)質(zhì)甘草組培快繁及遺傳穩(wěn)定性分析[D]. 蘇姍.河北科技大學 2015
[7]茶樹冷馴化過程中DNA甲基化的變化分析及DNA甲基轉(zhuǎn)移酶基因CsDRM2的克隆[D]. 周艷華.中國農(nóng)業(yè)科學院 2015
[8]馬鈴薯甲基轉(zhuǎn)移酶和去甲基化酶預測及表達研究[D]. 毛銳濤.內(nèi)蒙古大學 2014
[9]高壓靜電場對羽衣甘藍種子萌發(fā)過程DNA甲基化的影響[D]. 李娜.東北林業(yè)大學 2013
[10]非生物脅迫下SIBADH基因在遼寧堿蓬和轉(zhuǎn)pB-BADH煙草中的表達特性分析[D]. 張寅寅.遼寧師范大學 2013
本文編號:3427193
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