油菜雜交種寧雜21號及其雙親苗期在鹽脅迫條件下差異表達基因分析
發(fā)布時間:2021-10-08 17:57
為了解甘藍型油菜雜種優(yōu)勢在鹽脅迫中的表現(xiàn),遏制減產,以油菜強優(yōu)勢雜交種寧雜21號及其親本為材料,通過轉錄組測序,篩選鑒定得到1078個芽苗期差異表達基因(DEG)與耐鹽雜種優(yōu)勢密切相關,并能被已有鹽脅迫相關QTL注釋,部分基因的表達能被熒光定量PCR驗證,說明所得DEG具有可靠性,有潛在的油菜耐鹽育種價值。雜交組合中耐鹽雜種優(yōu)勢相關DEG表達模式與母本更為類似,大部分表現(xiàn)為正調控,功能傾向于生物合成的同化作用,而表達模式類似父本的DEG其功能傾向于氧化還原等調節(jié)作用。本研究還對耐鹽性雜種優(yōu)勢特異的SNP位點進行了預測和注釋,以期為雜交油菜耐鹽分子標記的開發(fā)以及耐鹽育種提供理論依據。
【文章來源】:中國油料作物學報. 2020,42(04)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:10 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 材料與耐鹽處理
1.2 RNA提取與轉錄組測序
1.3 序列分析
1.4 差異表達基因(DEG)篩選
1.5 耐鹽雜種優(yōu)勢相關差異基因分析
1.6 實時熒光定量PCR
1.7 統(tǒng)計分析
2 結果與分析
2.1 耐鹽雜種優(yōu)勢表型鑒定
2.2 耐鹽雜種優(yōu)勢DEG鑒定
2.3 耐鹽雜種優(yōu)勢相關基因的表達模式分析
2.4 耐鹽雜種優(yōu)勢相關基因的功能注釋
2.5 耐鹽雜種優(yōu)勢相關DEG的QTL注釋
2.6 qPCR驗證
2.7 耐鹽雜種優(yōu)勢相關SNP位點解析
3 討論
4 結論
【參考文獻】:
期刊論文
[1]油菜寧雜21號在江蘇沿海灘涂鹽堿地的種植表現(xiàn)及高產栽培技術要點[J]. 張培通,張萼,郭文琦,陳建平,李春宏,王永慧,胡茂龍,蔡立旺,施慶華. 江蘇農業(yè)科學. 2014(06)
[2]甘藍型單、雙低油菜細胞質雄性不育雜種的抗逆性研究[J]. 張書芬,傅廷棟,宋文光. 河南農業(yè)科學. 1993(10)
本文編號:3424665
【文章來源】:中國油料作物學報. 2020,42(04)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:10 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 材料與耐鹽處理
1.2 RNA提取與轉錄組測序
1.3 序列分析
1.4 差異表達基因(DEG)篩選
1.5 耐鹽雜種優(yōu)勢相關差異基因分析
1.6 實時熒光定量PCR
1.7 統(tǒng)計分析
2 結果與分析
2.1 耐鹽雜種優(yōu)勢表型鑒定
2.2 耐鹽雜種優(yōu)勢DEG鑒定
2.3 耐鹽雜種優(yōu)勢相關基因的表達模式分析
2.4 耐鹽雜種優(yōu)勢相關基因的功能注釋
2.5 耐鹽雜種優(yōu)勢相關DEG的QTL注釋
2.6 qPCR驗證
2.7 耐鹽雜種優(yōu)勢相關SNP位點解析
3 討論
4 結論
【參考文獻】:
期刊論文
[1]油菜寧雜21號在江蘇沿海灘涂鹽堿地的種植表現(xiàn)及高產栽培技術要點[J]. 張培通,張萼,郭文琦,陳建平,李春宏,王永慧,胡茂龍,蔡立旺,施慶華. 江蘇農業(yè)科學. 2014(06)
[2]甘藍型單、雙低油菜細胞質雄性不育雜種的抗逆性研究[J]. 張書芬,傅廷棟,宋文光. 河南農業(yè)科學. 1993(10)
本文編號:3424665
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