油菜雜交種寧雜21號(hào)及其雙親苗期在鹽脅迫條件下差異表達(dá)基因分析
發(fā)布時(shí)間:2021-10-08 17:57
為了解甘藍(lán)型油菜雜種優(yōu)勢(shì)在鹽脅迫中的表現(xiàn),遏制減產(chǎn),以油菜強(qiáng)優(yōu)勢(shì)雜交種寧雜21號(hào)及其親本為材料,通過轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,篩選鑒定得到1078個(gè)芽苗期差異表達(dá)基因(DEG)與耐鹽雜種優(yōu)勢(shì)密切相關(guān),并能被已有鹽脅迫相關(guān)QTL注釋,部分基因的表達(dá)能被熒光定量PCR驗(yàn)證,說明所得DEG具有可靠性,有潛在的油菜耐鹽育種價(jià)值。雜交組合中耐鹽雜種優(yōu)勢(shì)相關(guān)DEG表達(dá)模式與母本更為類似,大部分表現(xiàn)為正調(diào)控,功能傾向于生物合成的同化作用,而表達(dá)模式類似父本的DEG其功能傾向于氧化還原等調(diào)節(jié)作用。本研究還對(duì)耐鹽性雜種優(yōu)勢(shì)特異的SNP位點(diǎn)進(jìn)行了預(yù)測(cè)和注釋,以期為雜交油菜耐鹽分子標(biāo)記的開發(fā)以及耐鹽育種提供理論依據(jù)。
【文章來源】:中國(guó)油料作物學(xué)報(bào). 2020,42(04)北大核心CSCD
【文章頁(yè)數(shù)】:10 頁(yè)
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 材料與耐鹽處理
1.2 RNA提取與轉(zhuǎn)錄組測(cè)序
1.3 序列分析
1.4 差異表達(dá)基因(DEG)篩選
1.5 耐鹽雜種優(yōu)勢(shì)相關(guān)差異基因分析
1.6 實(shí)時(shí)熒光定量PCR
1.7 統(tǒng)計(jì)分析
2 結(jié)果與分析
2.1 耐鹽雜種優(yōu)勢(shì)表型鑒定
2.2 耐鹽雜種優(yōu)勢(shì)DEG鑒定
2.3 耐鹽雜種優(yōu)勢(shì)相關(guān)基因的表達(dá)模式分析
2.4 耐鹽雜種優(yōu)勢(shì)相關(guān)基因的功能注釋
2.5 耐鹽雜種優(yōu)勢(shì)相關(guān)DEG的QTL注釋
2.6 qPCR驗(yàn)證
2.7 耐鹽雜種優(yōu)勢(shì)相關(guān)SNP位點(diǎn)解析
3 討論
4 結(jié)論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]油菜寧雜21號(hào)在江蘇沿海灘涂鹽堿地的種植表現(xiàn)及高產(chǎn)栽培技術(shù)要點(diǎn)[J]. 張培通,張萼,郭文琦,陳建平,李春宏,王永慧,胡茂龍,蔡立旺,施慶華. 江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2014(06)
[2]甘藍(lán)型單、雙低油菜細(xì)胞質(zhì)雄性不育雜種的抗逆性研究[J]. 張書芬,傅廷棟,宋文光. 河南農(nóng)業(yè)科學(xué). 1993(10)
本文編號(hào):3424665
【文章來源】:中國(guó)油料作物學(xué)報(bào). 2020,42(04)北大核心CSCD
【文章頁(yè)數(shù)】:10 頁(yè)
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 材料與耐鹽處理
1.2 RNA提取與轉(zhuǎn)錄組測(cè)序
1.3 序列分析
1.4 差異表達(dá)基因(DEG)篩選
1.5 耐鹽雜種優(yōu)勢(shì)相關(guān)差異基因分析
1.6 實(shí)時(shí)熒光定量PCR
1.7 統(tǒng)計(jì)分析
2 結(jié)果與分析
2.1 耐鹽雜種優(yōu)勢(shì)表型鑒定
2.2 耐鹽雜種優(yōu)勢(shì)DEG鑒定
2.3 耐鹽雜種優(yōu)勢(shì)相關(guān)基因的表達(dá)模式分析
2.4 耐鹽雜種優(yōu)勢(shì)相關(guān)基因的功能注釋
2.5 耐鹽雜種優(yōu)勢(shì)相關(guān)DEG的QTL注釋
2.6 qPCR驗(yàn)證
2.7 耐鹽雜種優(yōu)勢(shì)相關(guān)SNP位點(diǎn)解析
3 討論
4 結(jié)論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]油菜寧雜21號(hào)在江蘇沿海灘涂鹽堿地的種植表現(xiàn)及高產(chǎn)栽培技術(shù)要點(diǎn)[J]. 張培通,張萼,郭文琦,陳建平,李春宏,王永慧,胡茂龍,蔡立旺,施慶華. 江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2014(06)
[2]甘藍(lán)型單、雙低油菜細(xì)胞質(zhì)雄性不育雜種的抗逆性研究[J]. 張書芬,傅廷棟,宋文光. 河南農(nóng)業(yè)科學(xué). 1993(10)
本文編號(hào):3424665
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