水稻淀粉相關(guān)性狀的SSR標(biāo)記關(guān)聯(lián)分析及OsAGPL3基因優(yōu)異單體型鑒定
發(fā)布時(shí)間:2021-10-07 19:20
水稻是一種具有悠久栽培歷史的一年生禾本科作物,也是世界上三大糧食作物之一。在生活水平日漸提高的今天,人們關(guān)注的不僅是吃飽而且將注意力更加側(cè)重于品質(zhì),其品質(zhì)相關(guān)性狀的研究已經(jīng)成為近些年來(lái)水稻科研的重點(diǎn)。碾磨品質(zhì)、外觀品質(zhì)、蒸煮食味品質(zhì)和營(yíng)養(yǎng)品質(zhì)是評(píng)價(jià)稻米品質(zhì)的4個(gè)主要指標(biāo),其中,蒸煮食味品質(zhì)作為一個(gè)非常重要而復(fù)雜的指標(biāo)受到遺傳學(xué)者和育種學(xué)家的廣泛關(guān)注。直鏈淀粉含量(AAC)、支鏈淀粉含量(APC)、膠稠度(GC)和糊化溫度(GT)是影響稻米蒸煮食味品質(zhì)的主要因素,因此,研究上述4個(gè)性狀在不同水稻品種中的變異規(guī)律,挖掘控制性狀的標(biāo)記位點(diǎn),對(duì)改善稻米蒸煮食味品質(zhì)具有重要意義,基于此,本研究選用154個(gè)均勻分布于水稻12條染色體的SSR標(biāo)記對(duì)269份粳稻品種構(gòu)成的自然群體進(jìn)行全基因組掃描,對(duì)直鏈淀粉含量、支鏈淀粉含量、膠稠度和糊化溫度等4個(gè)淀粉相關(guān)性狀與SSR標(biāo)記進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析,在此基礎(chǔ)上,以具有廣泛代表性的77個(gè)粳稻品種,開展用SSR標(biāo)記關(guān)聯(lián)分析鑒定出的OsAGPL3基因與淀粉相關(guān)性狀進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析,結(jié)果如下:(1)通過(guò)對(duì)269份粳稻品種淀粉相關(guān)性狀測(cè)定顯示,糊化溫度的變異系數(shù)相對(duì)較小,而直鏈淀...
【文章來(lái)源】:東北農(nóng)業(yè)大學(xué)黑龍江省 211工程院校
【文章頁(yè)數(shù)】:56 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
直鏈淀粉的分子結(jié)構(gòu)
圖 1-2 支鏈淀粉的分子結(jié)構(gòu)[19,20]Fig. l-2 Molecular structure of Amylopectin4 淀粉的生物合成淀粉在高等植物中主要在淀粉體和葉綠體中合成,并且在光合和非光合組織都有轉(zhuǎn)運(yùn)淀粉(transitory starch)指的是白天進(jìn)行光合作用合成的淀粉,作為儲(chǔ)備碳源它代謝中,等到晚間的時(shí)候轉(zhuǎn)運(yùn)到植株的其它部位。比較小的轉(zhuǎn)運(yùn)淀粉顆粒幾乎都粉組成[25-27]。貯藏淀粉(storage starch)在淀粉體中合成的淀粉貯藏時(shí)間較長(zhǎng),是要存在形式,并且作為種子發(fā)芽時(shí)的營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)[28]。通常人們所提到的淀粉一般是貯淀粉合成過(guò)程受到一系列酶的調(diào)控。在葉綠體中,卡爾文循環(huán)固定的 CO2作為碳源到淀粉合成中,而在淀粉體中,它自身不能通過(guò)光合作用固定 CO2,因此將蔗糖作與淀粉合成。蔗糖由蔗糖酶分解為果糖和 UDP-葡萄糖,然后在 UDPG-焦磷酸PP)的催化下生成 1-磷酸葡萄糖[29]。研究表明,與稻米淀粉合成相關(guān)的酶主要有括 ADP 葡萄糖焦磷酸化酶(AGPase)、淀粉分支酶(SBE)、顆粒結(jié)合淀粉合成酶(G性淀粉合成酶(SSS)和脫分支酶(DBE),各類酶又存在相應(yīng)的同工型,有近 20 個(gè)之多碼以上這些酶,在合成的不同階段每個(gè)基因都起著不同但都有至關(guān)重要的作用[30,3
圖 1-3 淀粉生物合成途徑Fig. 1-3 The pathway of starch biosynthesis.1.5 ADP-葡萄糖焦磷酸化酶(AGP)在淀粉合成中的中的功能ADP-葡萄糖焦磷酸化酶(簡(jiǎn)稱 AGP 酶)格外重要,蒸煮食味品質(zhì)被認(rèn)為主要由 AGP決定作用[37]。它是水稻中催化淀粉合成第一階段的關(guān)鍵酶,催化 1-磷酸葡萄糖和 ATP ADP-葡萄糖(ADP-glucose,ADPG),ADPG 作為活化葡萄糖基供體將糖基部分加到(1聚糖引物的非還原端[38],進(jìn)而作為底物參與淀粉的合成,其濃度直接影響淀粉的合成速效率,植物組織中淀粉合成的曲線與積累曲線基本一致。根據(jù)前人的研究表明,AGP 是合成的限速酶[39-40],類似于其他代謝過(guò)程的限速酶,AGP 同樣是變構(gòu)調(diào)節(jié)酶,正向經(jīng)-磷酸甘油激活而受到負(fù)向無(wú)機(jī)磷酸的抑制[41]。水稻 AGP 基因家族主要由四個(gè)大亞OsAGPL1、OsAGPL2、OsAGPL3 和 OsAGPL4)和兩個(gè)小亞基(OsAGPS1 和 OsAGPS2)[34]。通常情況下小亞基分子量在 50-55KDa 之間,大亞基分子量在 51-60KDa 之間[42]。大亞基和小亞基的序列,發(fā)現(xiàn)它們均有較大的同源性,但在 AGpase 中承擔(dān)的功能不同亞基被認(rèn)為是酶的調(diào)節(jié)中心,而小亞基則是酶的催化中心[43]。Lee 等人證實(shí)了 OsAGPLsAGPS2 在胚乳中特異性表達(dá)[44];Akihiro、Ohdan 等人發(fā)現(xiàn) OsAGPL4 在源組織和庫(kù)組織[45-46]
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]水稻籽粒性狀的SSR關(guān)聯(lián)分析[J]. 陳氏秋江,黨小景,劉強(qiáng)明,趙凱銘,王卉,洪德林. 中國(guó)水稻科學(xué). 2014(03)
[2]水稻紋枯病抗性關(guān)聯(lián)分析及抗性等位變異發(fā)掘[J]. 孫曉棠,盧冬冬,歐陽(yáng)林娟,胡麗芳,邊建民,彭小松,陳小榮,傅軍如,賀曉鵬,賀浩華,朱昌蘭. 作物學(xué)報(bào). 2014(05)
[3]植物基因組中的連鎖不平衡[J]. 王榮煥,王天宇,黎裕. 遺傳. 2007(11)
[4]植物支鏈淀粉生物合成研究進(jìn)展[J]. 高振宇,黃大年,錢前. 植物生理與分子生物學(xué)學(xué)報(bào). 2004(05)
[5]水稻直鏈淀粉含量與秈粳分化度的QTL及其相互關(guān)系研究[J]. 吳長(zhǎng)明,孫傳清,陳亮,李自超,王象坤. 中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2000(05)
[6]水稻高產(chǎn)、高效、高氨基酸含量及營(yíng)養(yǎng)價(jià)的施氮量?jī)?yōu)化[J]. 王德仁,盧婉芳,溫懷南,楊志根. 中國(guó)農(nóng)學(xué)通報(bào). 1995(02)
博士論文
[1]水稻關(guān)聯(lián)定位群體的構(gòu)建及若干品質(zhì)性狀的關(guān)聯(lián)分析[D]. 金亮.浙江大學(xué) 2009
[2]水稻淀粉合成相關(guān)基因?qū)Φ久资澄镀焚|(zhì)影響的研究[D]. 吳洪愷.揚(yáng)州大學(xué) 2006
本文編號(hào):3422624
【文章來(lái)源】:東北農(nóng)業(yè)大學(xué)黑龍江省 211工程院校
【文章頁(yè)數(shù)】:56 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
直鏈淀粉的分子結(jié)構(gòu)
圖 1-2 支鏈淀粉的分子結(jié)構(gòu)[19,20]Fig. l-2 Molecular structure of Amylopectin4 淀粉的生物合成淀粉在高等植物中主要在淀粉體和葉綠體中合成,并且在光合和非光合組織都有轉(zhuǎn)運(yùn)淀粉(transitory starch)指的是白天進(jìn)行光合作用合成的淀粉,作為儲(chǔ)備碳源它代謝中,等到晚間的時(shí)候轉(zhuǎn)運(yùn)到植株的其它部位。比較小的轉(zhuǎn)運(yùn)淀粉顆粒幾乎都粉組成[25-27]。貯藏淀粉(storage starch)在淀粉體中合成的淀粉貯藏時(shí)間較長(zhǎng),是要存在形式,并且作為種子發(fā)芽時(shí)的營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)[28]。通常人們所提到的淀粉一般是貯淀粉合成過(guò)程受到一系列酶的調(diào)控。在葉綠體中,卡爾文循環(huán)固定的 CO2作為碳源到淀粉合成中,而在淀粉體中,它自身不能通過(guò)光合作用固定 CO2,因此將蔗糖作與淀粉合成。蔗糖由蔗糖酶分解為果糖和 UDP-葡萄糖,然后在 UDPG-焦磷酸PP)的催化下生成 1-磷酸葡萄糖[29]。研究表明,與稻米淀粉合成相關(guān)的酶主要有括 ADP 葡萄糖焦磷酸化酶(AGPase)、淀粉分支酶(SBE)、顆粒結(jié)合淀粉合成酶(G性淀粉合成酶(SSS)和脫分支酶(DBE),各類酶又存在相應(yīng)的同工型,有近 20 個(gè)之多碼以上這些酶,在合成的不同階段每個(gè)基因都起著不同但都有至關(guān)重要的作用[30,3
圖 1-3 淀粉生物合成途徑Fig. 1-3 The pathway of starch biosynthesis.1.5 ADP-葡萄糖焦磷酸化酶(AGP)在淀粉合成中的中的功能ADP-葡萄糖焦磷酸化酶(簡(jiǎn)稱 AGP 酶)格外重要,蒸煮食味品質(zhì)被認(rèn)為主要由 AGP決定作用[37]。它是水稻中催化淀粉合成第一階段的關(guān)鍵酶,催化 1-磷酸葡萄糖和 ATP ADP-葡萄糖(ADP-glucose,ADPG),ADPG 作為活化葡萄糖基供體將糖基部分加到(1聚糖引物的非還原端[38],進(jìn)而作為底物參與淀粉的合成,其濃度直接影響淀粉的合成速效率,植物組織中淀粉合成的曲線與積累曲線基本一致。根據(jù)前人的研究表明,AGP 是合成的限速酶[39-40],類似于其他代謝過(guò)程的限速酶,AGP 同樣是變構(gòu)調(diào)節(jié)酶,正向經(jīng)-磷酸甘油激活而受到負(fù)向無(wú)機(jī)磷酸的抑制[41]。水稻 AGP 基因家族主要由四個(gè)大亞OsAGPL1、OsAGPL2、OsAGPL3 和 OsAGPL4)和兩個(gè)小亞基(OsAGPS1 和 OsAGPS2)[34]。通常情況下小亞基分子量在 50-55KDa 之間,大亞基分子量在 51-60KDa 之間[42]。大亞基和小亞基的序列,發(fā)現(xiàn)它們均有較大的同源性,但在 AGpase 中承擔(dān)的功能不同亞基被認(rèn)為是酶的調(diào)節(jié)中心,而小亞基則是酶的催化中心[43]。Lee 等人證實(shí)了 OsAGPLsAGPS2 在胚乳中特異性表達(dá)[44];Akihiro、Ohdan 等人發(fā)現(xiàn) OsAGPL4 在源組織和庫(kù)組織[45-46]
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]水稻籽粒性狀的SSR關(guān)聯(lián)分析[J]. 陳氏秋江,黨小景,劉強(qiáng)明,趙凱銘,王卉,洪德林. 中國(guó)水稻科學(xué). 2014(03)
[2]水稻紋枯病抗性關(guān)聯(lián)分析及抗性等位變異發(fā)掘[J]. 孫曉棠,盧冬冬,歐陽(yáng)林娟,胡麗芳,邊建民,彭小松,陳小榮,傅軍如,賀曉鵬,賀浩華,朱昌蘭. 作物學(xué)報(bào). 2014(05)
[3]植物基因組中的連鎖不平衡[J]. 王榮煥,王天宇,黎裕. 遺傳. 2007(11)
[4]植物支鏈淀粉生物合成研究進(jìn)展[J]. 高振宇,黃大年,錢前. 植物生理與分子生物學(xué)學(xué)報(bào). 2004(05)
[5]水稻直鏈淀粉含量與秈粳分化度的QTL及其相互關(guān)系研究[J]. 吳長(zhǎng)明,孫傳清,陳亮,李自超,王象坤. 中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2000(05)
[6]水稻高產(chǎn)、高效、高氨基酸含量及營(yíng)養(yǎng)價(jià)的施氮量?jī)?yōu)化[J]. 王德仁,盧婉芳,溫懷南,楊志根. 中國(guó)農(nóng)學(xué)通報(bào). 1995(02)
博士論文
[1]水稻關(guān)聯(lián)定位群體的構(gòu)建及若干品質(zhì)性狀的關(guān)聯(lián)分析[D]. 金亮.浙江大學(xué) 2009
[2]水稻淀粉合成相關(guān)基因?qū)Φ久资澄镀焚|(zhì)影響的研究[D]. 吳洪愷.揚(yáng)州大學(xué) 2006
本文編號(hào):3422624
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