以"HM1-1""MS-5"甜瓜品種為試材,采用同源克隆的方法得到甜瓜FT同源基因,命名為CmFT,通過進(jìn)化樹分析、實(shí)時(shí)熒光定量方法以及分子標(biāo)記輔助選擇育種等方法初步驗(yàn)證了CmFT在甜瓜花發(fā)育過程中的作用。結(jié)果表明:該基因全長3 843 bp,CDS區(qū)為534 bp,編碼178個(gè)氨基酸。在24個(gè)甜瓜品種中開展分子標(biāo)記輔助篩選準(zhǔn)確率達(dá)87.5%。該標(biāo)記與甜瓜開花性狀相關(guān),可用于甜瓜早花育種的輔助選擇,研究結(jié)果對甜瓜分子育種與開花基因調(diào)控提供了參考依據(jù)。 

【文章來源】：北方園藝. 2020,(19)北大核心

【文章頁數(shù)】：7 頁

【部分圖文】：

甜瓜CmFT基因與黃瓜CsFT基因的結(jié)構(gòu)

除甜瓜外,利用NCBI找到其它13個(gè)物種的FT同源基因的蛋白序列,利用DNAMAN軟件進(jìn)行蛋白序列比對(圖2)。結(jié)果表明,CmFT與其它FT蛋白長度相似,有178個(gè)氨基酸,并且,關(guān)鍵性氨基酸Tyr84/Gln139(黑點(diǎn))、第4個(gè)外顯子中的14個(gè)保守氨基酸和LYN三聯(lián)體在CmFT 中均沒有發(fā)生變化,不同物種FT基因編碼的氨基酸序列中間區(qū)域是高度保守的。有70個(gè)氨基酸殘基在所有13個(gè)蛋白序列中高度保守,還有85個(gè)殘基的保守性在80%以上。表明CmFT在氨基酸序列上高度保守。采用 MEGA 7.0 軟件 Neighbor-joining(NJ)法將甜瓜FT基因預(yù)測的蛋白序列和黃瓜、擬南芥、水稻、玉米、小麥等18個(gè)物種的FT蛋白序列進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)育樹分析,進(jìn)一步分析FT基因與其它物種間的親緣關(guān)系,由圖3可知,FT 蛋白可以分為單子葉和雙子葉2個(gè)不同的進(jìn)化枝。CmFT與黃瓜的CsFT在同一個(gè)進(jìn)化枝上,同源性為97.8%。而與擬南芥的AtFT相對進(jìn)化距離較遠(yuǎn),同源性為73.63%。不同物種間氨基酸序列高度相似說明該蛋白質(zhì)在生物生命活動中執(zhí)行著不可替代的重要功能。

采用 MEGA 7.0 軟件 Neighbor-joining(NJ)法將甜瓜FT基因預(yù)測的蛋白序列和黃瓜、擬南芥、水稻、玉米、小麥等18個(gè)物種的FT蛋白序列進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)育樹分析,進(jìn)一步分析FT基因與其它物種間的親緣關(guān)系,由圖3可知,FT 蛋白可以分為單子葉和雙子葉2個(gè)不同的進(jìn)化枝。CmFT與黃瓜的CsFT在同一個(gè)進(jìn)化枝上,同源性為97.8%。而與擬南芥的AtFT相對進(jìn)化距離較遠(yuǎn),同源性為73.63%。不同物種間氨基酸序列高度相似說明該蛋白質(zhì)在生物生命活動中執(zhí)行著不可替代的重要功能。2.3 CmFT基因的功能初步分析


本文編號：3421139