結(jié)縷草轉(zhuǎn)錄因子基因ZjDREB 1.4功能研究
發(fā)布時間:2021-09-19 03:40
高溫、低溫、干旱和高鹽等非生物脅迫是影響草坪種植和觀賞性的重要因素,因而非生物脅迫抗性及其機(jī)制一直是草坪草研究的重要內(nèi)容。結(jié)縷草屬(Zoysia Willd.)是我國重點開發(fā)的暖季型草種之一,具有抗旱、耐熱、耐鹽堿、抗病等特點,其抗逆性的分子機(jī)制有待深入研究。植物轉(zhuǎn)錄因子DREB(Dehydration responsive element binding)與多種非生物脅迫響應(yīng)密切相關(guān),通過激活多個抗逆相關(guān)基因的表達(dá)使植物獲得抗逆能力。結(jié)縷草DREB轉(zhuǎn)錄因子的功能尚未有系統(tǒng)的研究報道。本研究以日本結(jié)縷草’Meyer’(Zoysia japonica Steud.)為材料對DREB類轉(zhuǎn)錄因子基因ZjDREB1.4開展研究,主要研究結(jié)果如下:(1)ZjDREB1.4基因編碼區(qū)長681 bp,無內(nèi)含子,推測編碼226個氨基酸,含有一個AP2結(jié)構(gòu)域,其上下游具有DREB轉(zhuǎn)錄因子A-1亞組的典型特征序列。在禾本科植物DREB1同源基因的系統(tǒng)進(jìn)化樹中,ZjDREB1.4基因?qū)儆谠谂拘椭参镏械玫竭x擇性擴(kuò)張的Ⅲa分支。根據(jù)qRT-PCR分析結(jié)果,ZjDREB1.4基因的表達(dá)受高溫、低溫和干旱脅迫誘導(dǎo)...
【文章來源】:中央民族大學(xué)北京市 211工程院校 985工程院校
【文章頁數(shù)】:88 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖1-1研究技術(shù)流程圖??Fig.?1-1?The?flowthart?of?research??
M:?DL2000Marker;a:基因擴(kuò)增結(jié)果,1:模板為cDNA;2:模板為基因組DNA;?b:菌液PCR結(jié)果:??\-4:?ZjDREBU?基面??結(jié)縷草冷基因編碼區(qū)全長為681個堿基,推測編碼226個氨基酸(圖2-2),??其中含量最高的兩種氨基酸分別是甘氨酸(Gly?35.4%)和半胱氨酸(Cys?35.1%),蛋白??分子式為Ci90gH312iN681〇78〇S239,相對分子量大小為24.6kDa,等電點為4.9,不穩(wěn)定指數(shù)為??50.68?(>40),總平均疏水指數(shù)為0.907,推測為不穩(wěn)定的疏水性蛋白。NCBI保守結(jié)構(gòu)域??在線預(yù)測結(jié)果表明,該基因編碼的蛋白有一個保守的AP2結(jié)構(gòu)域(E-ValueiSASe-11),在??其上、下游含有DREB1類基因的特征性序列PKKPAGRTKFRETRH和DSAW,因而屬于??中的A-1亞組。??17??
?1G0?150??圖2-3?ZjDREB1.4蛋白二級結(jié)構(gòu)預(yù)測??Fig.?2-3?The?predicted?secondary?structure?of?ZjDREB?1.4??橫坐標(biāo)代表氨基酸所在位置;長豎線為a-螺旋,中長豎線為0-折疊片,短豎線為無規(guī)則卷曲。??C?端C-terminal?V???j?N?端N-terminai??圖2-4?ZjDREB1.4蛋白三級結(jié)構(gòu)模型預(yù)測??Fig.?2-4?The?predicted?tertiary?structure?of?ZjDREB1.4??虛線框內(nèi)為AP2結(jié)構(gòu)域??3.2?ZjDREB1.4的系統(tǒng)進(jìn)化分析??為進(jìn)一步研究ZyT)狀5/.?/在DREB1家族中的系統(tǒng)進(jìn)化地位,按照DREB1組的分類特??征[93】,篩選出來自于玉米、水稻、高梁、小米、小麥、大麥和短柄草等7種植物(表2-2)??的DREB1同源基因的氨基酸序列,利用MEGA7.0軟件對包括基因在內(nèi)的91??個基因的全長序列構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹。如圖2-5所示,禾本科植物中的DREB1同源物被分為??11個單系分支,10個分支與Badawi文章中的分類一致,其中水稻的和??CWM五5A7基因與玉米ZmD狀57.6、高粱劭C5F9基因共同組成第H個分支,名為CBF??V。狀5/.*/基因被分配到DREB1家族的Ilia分支中
本文編號:3400939
【文章來源】:中央民族大學(xué)北京市 211工程院校 985工程院校
【文章頁數(shù)】:88 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖1-1研究技術(shù)流程圖??Fig.?1-1?The?flowthart?of?research??
M:?DL2000Marker;a:基因擴(kuò)增結(jié)果,1:模板為cDNA;2:模板為基因組DNA;?b:菌液PCR結(jié)果:??\-4:?ZjDREBU?基面??結(jié)縷草冷基因編碼區(qū)全長為681個堿基,推測編碼226個氨基酸(圖2-2),??其中含量最高的兩種氨基酸分別是甘氨酸(Gly?35.4%)和半胱氨酸(Cys?35.1%),蛋白??分子式為Ci90gH312iN681〇78〇S239,相對分子量大小為24.6kDa,等電點為4.9,不穩(wěn)定指數(shù)為??50.68?(>40),總平均疏水指數(shù)為0.907,推測為不穩(wěn)定的疏水性蛋白。NCBI保守結(jié)構(gòu)域??在線預(yù)測結(jié)果表明,該基因編碼的蛋白有一個保守的AP2結(jié)構(gòu)域(E-ValueiSASe-11),在??其上、下游含有DREB1類基因的特征性序列PKKPAGRTKFRETRH和DSAW,因而屬于??中的A-1亞組。??17??
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