Pb 2+ 脅迫下香蒲差異表達(dá)基因的分析及克隆
發(fā)布時(shí)間:2021-09-12 17:00
香蒲(Typha orientalis Presl)為多年生草本植物,具有發(fā)達(dá)的根狀莖,可形成地下莖網(wǎng),是一種新型的Pb富集型植物,但目前有關(guān)香蒲對(duì)Pb2+的耐性機(jī)理尚未明確。因此,本文選取香蒲為實(shí)驗(yàn)材料,采用Hoagland營(yíng)養(yǎng)液水培法,在前期實(shí)驗(yàn)的基礎(chǔ)上,進(jìn)行0.1 mmol·L-1、0.25 mmol·L-lPb2+處理,通過轉(zhuǎn)錄組測(cè)序研究不同Pb2+處理組香蒲根部的差異表達(dá)基因,分析與Pb2+耐性相關(guān)的目的基因;利用qRT-PCR方法驗(yàn)證了 13個(gè)差異表達(dá)基因的表達(dá)量;通過RACE技術(shù)克隆獲得與Pb耐性相關(guān)的谷胱甘肽S轉(zhuǎn)移酶基因(ToGST)全長(zhǎng),并對(duì)該基因進(jìn)行了生物信息學(xué)分析;研究其它非生物脅迫(干旱和鹽脅迫)下ToGST基因表達(dá)量的變化,以期闡明香蒲對(duì)Pb2+的耐性機(jī)理,并為利用香蒲進(jìn)行環(huán)境中的Pb2+污染修復(fù)提供理論依據(jù)。主要研究結(jié)果如下:1.轉(zhuǎn)錄組測(cè)序:通過對(duì)對(duì)照組以及0.1mmol·L-1、0.25mmol·L-1Pb2+處理組的根部樣品進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,拼接組裝后得到84,530條Unigene,平均長(zhǎng)度是806.04 nt,N50長(zhǎng)度為1,422 nt。經(jīng)過Unig...
【文章來(lái)源】:揚(yáng)州大學(xué)江蘇省
【文章頁(yè)數(shù)】:117 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
圖2.1?Unigene長(zhǎng)度分布圖??Fi2.1?Historam?of?lenth?distribute?of?uniene??
據(jù)庫(kù)中有重要位點(diǎn),并且有24677Unigenes至少在GO?terms中得到注釋。??2.3.4基因表達(dá)分析??差異表達(dá)基因數(shù)目統(tǒng)計(jì)如下圖2.2;鹕綀D(Volcano?Plot)可以直觀地展現(xiàn)??所有基因的FDR與Fold?Change之間的關(guān)系(圖2.3),綠色和紅色的點(diǎn)代表有??顯著性表達(dá)差異的基因
2.3.5差異基因表達(dá)水平聚類分析??對(duì)篩選出的差異表達(dá)基因做層次聚類分析,差異基因聚類分析可以快速的選??擇共表達(dá)基因。Heatmap如圖2.5所示,顏色從紅到藍(lán)表示表達(dá)水平從低到高,??紅色代表高表達(dá)基因,綠色代表低表達(dá)基因,從結(jié)果可以看出,T03表達(dá)模式變??化顯著,T01與T02轉(zhuǎn)錄本的表達(dá)模式相似。??
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]火把梨谷胱甘肽S-轉(zhuǎn)移酶基因的克隆與表達(dá)[J]. 劉迪秋,王光勇,王繼磊,葛鋒,陳朝銀. 西北植物學(xué)報(bào). 2012(01)
[2]蘆葦和香蒲對(duì)重金屬鉬的吸收特性研究[J]. 練建軍,許士國(guó),韓成偉. 環(huán)境科學(xué). 2011(11)
[3]東方香蒲(Typha orientalis Presl)對(duì)重度污染土壤中As、Cd、Pb的耐性與累積特征[J]. 王鳳永,郭朝暉,苗旭峰,肖細(xì)元. 農(nóng)業(yè)環(huán)境科學(xué)學(xué)報(bào). 2011(10)
[4]GSTs在植物非生物逆境脅迫中的作用[J]. 王光勇,劉迪秋,葛鋒,方松剛,田榮歡,丁元明. 植物生理學(xué)通訊. 2010(09)
[5]蒲絨纖維的吸油性能[J]. 王泉泉,徐廣標(biāo),王府梅. 東華大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2010(01)
[6]人工濕地污水凈化技術(shù)概述[J]. 付國(guó)楷,張媛,林潔. 三峽環(huán)境與生態(tài). 2008(03)
[7]蒲黃總黃酮對(duì)麻醉犬心肌耗氧量的影響[J]. 毛俊琴,黃曉瑾,李鐵軍,邱彥,陳萬(wàn)生. 中國(guó)醫(yī)院藥學(xué)雜志. 2006(09)
[8]香蒲新苷對(duì)人臍動(dòng)脈血管平滑肌細(xì)胞增殖的影響[J]. 郭淑貞,劉斌,王偉. 北京中醫(yī)藥大學(xué)學(xué)報(bào). 2006(05)
[9]轉(zhuǎn)入鹽地堿蓬谷胱甘肽轉(zhuǎn)移酶和過氧化氫酶基因增強(qiáng)水稻幼苗對(duì)低溫脅迫的抗性[J]. 趙鳳云,王曉云,趙彥修,張慧. 植物生理與分子生物學(xué)學(xué)報(bào). 2006(02)
[10]Na2CO3脅迫下星星草幼苗葉綠體GST活性變化及其與相關(guān)指標(biāo)的關(guān)系[J]. 孫國(guó)榮,王建波,曹文鐘,杜坤,張彪. 西北植物學(xué)報(bào). 2005(12)
博士論文
[1]玉米苗期根系響應(yīng)重金屬鉛脅迫的基因表達(dá)調(diào)控研究[D]. 張永中.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
碩士論文
[1]香蒲對(duì)鉛(Pb2+)脅迫的生理響應(yīng)及差異性基因篩選研究[D]. 徐義昆.揚(yáng)州大學(xué) 2016
[2]RACE初步克隆胡麻β-酮脂酰-CoA合酶基因以及胡麻再生體系建立的研究[D]. 張彥萍.蘭州大學(xué) 2009
[3]RACE技術(shù)克隆大菱鲆蛋白磷酸酶1催化亞基基因和金屬蛋白酶基因及其序列分析[D]. 亓飛.中國(guó)海洋大學(xué) 2006
本文編號(hào):3394604
【文章來(lái)源】:揚(yáng)州大學(xué)江蘇省
【文章頁(yè)數(shù)】:117 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
圖2.1?Unigene長(zhǎng)度分布圖??Fi2.1?Historam?of?lenth?distribute?of?uniene??
據(jù)庫(kù)中有重要位點(diǎn),并且有24677Unigenes至少在GO?terms中得到注釋。??2.3.4基因表達(dá)分析??差異表達(dá)基因數(shù)目統(tǒng)計(jì)如下圖2.2;鹕綀D(Volcano?Plot)可以直觀地展現(xiàn)??所有基因的FDR與Fold?Change之間的關(guān)系(圖2.3),綠色和紅色的點(diǎn)代表有??顯著性表達(dá)差異的基因
2.3.5差異基因表達(dá)水平聚類分析??對(duì)篩選出的差異表達(dá)基因做層次聚類分析,差異基因聚類分析可以快速的選??擇共表達(dá)基因。Heatmap如圖2.5所示,顏色從紅到藍(lán)表示表達(dá)水平從低到高,??紅色代表高表達(dá)基因,綠色代表低表達(dá)基因,從結(jié)果可以看出,T03表達(dá)模式變??化顯著,T01與T02轉(zhuǎn)錄本的表達(dá)模式相似。??
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]火把梨谷胱甘肽S-轉(zhuǎn)移酶基因的克隆與表達(dá)[J]. 劉迪秋,王光勇,王繼磊,葛鋒,陳朝銀. 西北植物學(xué)報(bào). 2012(01)
[2]蘆葦和香蒲對(duì)重金屬鉬的吸收特性研究[J]. 練建軍,許士國(guó),韓成偉. 環(huán)境科學(xué). 2011(11)
[3]東方香蒲(Typha orientalis Presl)對(duì)重度污染土壤中As、Cd、Pb的耐性與累積特征[J]. 王鳳永,郭朝暉,苗旭峰,肖細(xì)元. 農(nóng)業(yè)環(huán)境科學(xué)學(xué)報(bào). 2011(10)
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[5]蒲絨纖維的吸油性能[J]. 王泉泉,徐廣標(biāo),王府梅. 東華大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2010(01)
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[7]蒲黃總黃酮對(duì)麻醉犬心肌耗氧量的影響[J]. 毛俊琴,黃曉瑾,李鐵軍,邱彥,陳萬(wàn)生. 中國(guó)醫(yī)院藥學(xué)雜志. 2006(09)
[8]香蒲新苷對(duì)人臍動(dòng)脈血管平滑肌細(xì)胞增殖的影響[J]. 郭淑貞,劉斌,王偉. 北京中醫(yī)藥大學(xué)學(xué)報(bào). 2006(05)
[9]轉(zhuǎn)入鹽地堿蓬谷胱甘肽轉(zhuǎn)移酶和過氧化氫酶基因增強(qiáng)水稻幼苗對(duì)低溫脅迫的抗性[J]. 趙鳳云,王曉云,趙彥修,張慧. 植物生理與分子生物學(xué)學(xué)報(bào). 2006(02)
[10]Na2CO3脅迫下星星草幼苗葉綠體GST活性變化及其與相關(guān)指標(biāo)的關(guān)系[J]. 孫國(guó)榮,王建波,曹文鐘,杜坤,張彪. 西北植物學(xué)報(bào). 2005(12)
博士論文
[1]玉米苗期根系響應(yīng)重金屬鉛脅迫的基因表達(dá)調(diào)控研究[D]. 張永中.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
碩士論文
[1]香蒲對(duì)鉛(Pb2+)脅迫的生理響應(yīng)及差異性基因篩選研究[D]. 徐義昆.揚(yáng)州大學(xué) 2016
[2]RACE初步克隆胡麻β-酮脂酰-CoA合酶基因以及胡麻再生體系建立的研究[D]. 張彥萍.蘭州大學(xué) 2009
[3]RACE技術(shù)克隆大菱鲆蛋白磷酸酶1催化亞基基因和金屬蛋白酶基因及其序列分析[D]. 亓飛.中國(guó)海洋大學(xué) 2006
本文編號(hào):3394604
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