玉米ZmENA1基因的克隆及其對金屬離子的應(yīng)答分析
發(fā)布時間:2021-09-12 11:25
煙酰胺(NA)是重要的植物鐵載體麥根酸(MA)的前體物質(zhì),煙酰胺外排轉(zhuǎn)運(yùn)體 ENA 是植物體介導(dǎo) NA 轉(zhuǎn)運(yùn)的重要蛋白。探究 ZmENA1 的基本功能可為闡明玉米中金屬離子的轉(zhuǎn)運(yùn)及儲存機(jī)制提供依據(jù)。本研究同源克隆了 ZmENA1 基因,并通過生物信息學(xué)方法分析了該蛋白的基本特征,同時運(yùn)用實(shí)時熒光定量技術(shù)分析了該基因在籽粒發(fā)育過程及在不同金屬離子濃度下的表達(dá)模式。結(jié)果表明,ZmENA1 的 ORF 長 1 356 bp,預(yù)測其編碼蛋白等電點(diǎn)為 8.06,蛋白質(zhì)大小為 48.998 kD,在蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)中α螺旋占比達(dá) 53.98%;該蛋白有 4 個磷酸化位點(diǎn)、10 個跨膜區(qū)且 N 端含有 1 個信號肽。表達(dá)分析發(fā)現(xiàn),ZmENA1 在胚乳和種皮混合物中的表達(dá)量高于胚,并在 16 DAP達(dá)到高峰,然后隨著發(fā)育進(jìn)程逐漸降低。此外,ZmENA1 的表達(dá)可應(yīng)答于 Zn2+、Mn2+ 和 Cu2+ 的缺乏以及過量的 Zn2+、Mn2+ 和 Cd2+,推測 ZmENA1 ...
【文章來源】:生物技術(shù)通報. 2020,36(11)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:8 頁
【部分圖文】:
ZmENA1基因的克隆
通過 ExPASy 的 NetPhos 在線工具對蛋白質(zhì)磷酸化位點(diǎn)進(jìn)行預(yù)測,圖3 中可以觀察到該蛋白具有 2 個酪氨酸位點(diǎn),蘇氨酸和絲氨酸位點(diǎn)各一個。推測這些位點(diǎn)的磷酸化可能影響 ZmENA1 蛋白質(zhì)的活性。2.2.4 跨膜結(jié)構(gòu)域和信號肽分析
2.2.3 磷酸化位點(diǎn)分析通過 ExPASy 的 NetPhos 在線工具對蛋白質(zhì)磷酸化位點(diǎn)進(jìn)行預(yù)測,圖3 中可以觀察到該蛋白具有 2 個酪氨酸位點(diǎn),蘇氨酸和絲氨酸位點(diǎn)各一個。推測這些位點(diǎn)的磷酸化可能影響 ZmENA1 蛋白質(zhì)的活性。
本文編號:3394140
【文章來源】:生物技術(shù)通報. 2020,36(11)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:8 頁
【部分圖文】:
ZmENA1基因的克隆
通過 ExPASy 的 NetPhos 在線工具對蛋白質(zhì)磷酸化位點(diǎn)進(jìn)行預(yù)測,圖3 中可以觀察到該蛋白具有 2 個酪氨酸位點(diǎn),蘇氨酸和絲氨酸位點(diǎn)各一個。推測這些位點(diǎn)的磷酸化可能影響 ZmENA1 蛋白質(zhì)的活性。2.2.4 跨膜結(jié)構(gòu)域和信號肽分析
2.2.3 磷酸化位點(diǎn)分析通過 ExPASy 的 NetPhos 在線工具對蛋白質(zhì)磷酸化位點(diǎn)進(jìn)行預(yù)測,圖3 中可以觀察到該蛋白具有 2 個酪氨酸位點(diǎn),蘇氨酸和絲氨酸位點(diǎn)各一個。推測這些位點(diǎn)的磷酸化可能影響 ZmENA1 蛋白質(zhì)的活性。
本文編號:3394140
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