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青魚nanog和oct4基因的鑒定及青鳉肌肉細(xì)胞系的建立

發(fā)布時間:2021-09-11 18:48
  作為“四大家魚”之首,青魚(Mylopharyngodon piceus)是我國主要的養(yǎng)殖品種之一,具有重要的經(jīng)濟(jì)價值和科研意義。目前,有關(guān)青魚的研究主要集中在人工養(yǎng)殖、營養(yǎng)與飼料和疾病防控等方向而缺乏分子水平上的一些基礎(chǔ)研究數(shù)據(jù)。誘導(dǎo)多功能干細(xì)胞(iPS)是一類具有無限自我更新能力且能在特定條件下定向分化的細(xì)胞,Nanog和Oct4基因是哺乳動物中維持胚胎干細(xì)胞多能性以及自我更新能力的關(guān)鍵性基因,也是成功誘導(dǎo)多功能干細(xì)胞的關(guān)鍵因子。為了成功誘導(dǎo)魚類iPS,本研究分離和鑒定了青魚nanog和oct4基因及nanog上游啟動子序列,初步分析了它們的基因結(jié)構(gòu)、在不同成體組織和早期胚胎發(fā)育中的表達(dá)模式,證明了它們的表達(dá)模式有別于哺乳動物,具有母源性表達(dá)特征。此外,本研究還建立了青鳉肌肉細(xì)胞系(OLM),分析和鑒定了它的基本生物學(xué)特征,并且通過熒光素酶實(shí)驗(yàn)測定了不同區(qū)段nanog啟動子在OLM中的活性。其主要研究結(jié)果如下:1)Mpnanog基因組DNA(genomic DNA,gDNA)全長3295 bp,cDNA全長1550 bp,包括4個外顯子,預(yù)計編碼具有390個氨基酸殘基的蛋白;多物種... 

【文章來源】:華中農(nóng)業(yè)大學(xué)湖北省 211工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】:81 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【部分圖文】:

青魚nanog和oct4基因的鑒定及青鳉肌肉細(xì)胞系的建立


Mpnanog基因的核苷酸與氨基酸序列

序列,基因組結(jié)構(gòu),物種,青魚


青魚 nanog 和 oct4 基因的鑒定及青鳉肌肉細(xì)胞系的建立以青魚基因組 DNA 為模板獲得全長 3276 bp 的 nanog gDNA 序列,GenBank上登錄號為 MF280403,共包含 4 個外顯子和 3 個內(nèi)含子,內(nèi)含子與外顯子交界處均符合 GT-AG 規(guī)則。除了基因組大小不同,青魚 gDNA 的基本結(jié)構(gòu)與各部分長度比例與其它已知物種的 Nanog gDNA 均保持一致,且 HD 所在的位置也都橫跨第二個和第三個外顯子(圖 2-2)。

方框,團(tuán)頭魴,多物種,氨基酸


26圖 2-3 多物種 Nanog 蛋白序列比對相同氨基酸顯示藍(lán)色,HD 結(jié)構(gòu)域由黑色方框標(biāo)識,NLS 由黃色方框標(biāo)識,相較于團(tuán)頭魴多出的四個氨基酸 PAPS 由紅色方框標(biāo)識,物種名、序列號、蛋白大小、全長和 HD 一致性比對結(jié)果在右側(cè)列出Fig 2-3. Multiple sequence alignment of Nanog proteinsIdentical residues are indicated in dark blue, the Hox domain, putative nuclear localizationsignal and additional 12 bp encoding 4 amino acids (PAPS) are noted with black, yellow and redframes, respectively. The species’name, accession numbers, protein size and identity scores of FLand HD are represented on the right

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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本文編號:3393525

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