通過生物信息學(xué)鑒定桃基因組中生長(zhǎng)素/吲哚乙酸（Aux/IAA）基因家族,并對(duì)其在溶質(zhì)型和硬質(zhì)型桃果實(shí)成熟階段的表達(dá)水平進(jìn)行q RT-PCR檢測(cè)。結(jié)果表明:桃Aux/IAA基因家族包含22個(gè)成員,這些基因集中分布在5條染色體上,以第1條染色體上含有最多,為8個(gè)。大部分Aux/IAA基因包含高度保守的Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ和Ⅳ功能域,聚類分析表明其分為10類。基因結(jié)構(gòu)分析顯示這些基因包含2⁵個(gè)外顯子。熒光定量PCR分析表明10個(gè)Aux/IAA基因在溶質(zhì)型桃果實(shí)的表達(dá)量高于對(duì)應(yīng)時(shí)期硬質(zhì)型桃果實(shí),其中5個(gè)基因隨著溶質(zhì)型桃果實(shí)的成熟上調(diào)表達(dá),特別是ppa010303m、ppa010871m和ppa020369m。試驗(yàn)結(jié)果表明桃Aux/IAA家族成員在結(jié)構(gòu)上高度保守,其中多個(gè)成員（尤其是ppa010303m、ppa010871m和ppa020369m等）可能參與調(diào)控桃果實(shí)的成熟。 

【文章來源】：園藝學(xué)報(bào). 2017,44(02)北大核心CSCD

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【部分圖文】：

桃Aux/IAA蛋白家族序列比對(duì)Fig.1MultiplealignmentsofpeachAux/IAAproteins

ZengWenfang，WangXiaobei，PanLei，NiuLiang，LuZhenhua，CuiGuochao，WangZhiqiang.IdentificationandexpressionprofilingofAux/IAAfamilygeneduringpeachfruitripening.238ActaHorticulturaeSinica，2017，44(2)：233–244.圖1桃Aux/IAA蛋白家族序列比對(duì)Fig.1MultiplealignmentsofpeachAux/IAAproteins圖2桃Aux/IAA基因在染色體上的分布Fig.2GenomicdistributionofAux/IAAgenesonpeachchromosomes

曾文芳，王小貝，潘磊，牛良，魯振華，崔國(guó)朝，王志強(qiáng).桃Aux/IAA家族基因鑒定及在果實(shí)成熟過程中的表達(dá)分析.園藝學(xué)報(bào)，2017，44(2)：233–244.239圖4AUX/IAA，ACS和YUCCA11在‘黃金蜜3號(hào)’和‘Yumyeong’桃果實(shí)各成熟階段（S3-1、S3-2、S4-1和S4-2）的表達(dá)Fig.4ExpressionofAUX/IAA，ACSandYUCCA11genesin‘Goldhoney3’and‘Yumyeong’peachfruitsweresampledattheS3-1，S3-2，S4-1，andS4-2stages圖3桃Aux/IAA的進(jìn)化關(guān)系和結(jié)構(gòu)進(jìn)化樹由MEGA4.0的鄰接法繪制，參數(shù)設(shè)置在1000次重復(fù)。黃色代表外顯子，細(xì)線代表內(nèi)含子，藍(lán)色代表編碼區(qū)上下游的非翻譯區(qū)。Fig.3StructureandphylogeneticrelationshipofpeachAux/IAAproteinsTheunrootedtreewasgeneratedusingMEGA4.0programbyNeighbor-Joiningmethod.Bootstrapvaluesfrom1000replicatesareindicatedateachbranch.Theexonsarerepresentedbyyellowboxes，theintronsarerepresentedbylines，andupstream/downstreamregionsarerepresentedbyblueboxes.2.3桃Aux/IAA基因在溶質(zhì)型和硬質(zhì)型桃果實(shí)成熟過程中的表達(dá)前期數(shù)據(jù)表明，溶質(zhì)型桃（‘黃金蜜3號(hào)’和‘中油桃13號(hào)’）隨著果實(shí)的成熟，生長(zhǎng)素含量和乙烯釋放量迅速增加，果實(shí)硬度迅速下降；而硬質(zhì)型桃（‘Yumyeong’和‘中油桃16號(hào)’）生長(zhǎng)素含量和乙烯釋放量均處于極低的水平，果實(shí)硬度也沒有明顯改變（Panetal.，2015；Zengetal.，2015）。采用數(shù)字表達(dá)譜對(duì)溶質(zhì)型桃‘黃金蜜3號(hào)’和硬質(zhì)型桃‘Yumyeong’成熟期進(jìn)行測(cè)序，將其Aux/IAA家族基因的reads數(shù)RPKM均一化，繪制熱圖見圖4。同時(shí)將這些基因的RPKM值與乙烯合成限速酶（ACS1，ppa004774m）和生長(zhǎng)素合成限速酶（YUCCA11，ppa008176m）基因的RPKM值進(jìn)行聚類，結(jié)果顯示ppa011821m、ppa

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]生長(zhǎng)素對(duì)油桃‘24-30’果實(shí)軟化和乙烯生物合成的影響[J]. 曾文芳,王志強(qiáng),潘磊,劉慧,牛良,魯振華,崔國(guó)朝.  果樹學(xué)報(bào). 2015(02)
[2]桃果實(shí)采后軟化過程中內(nèi)源IAA、ABA和乙烯的變化[J]. 吳敏,陳昆松,賈惠娟,徐昌杰,張上隆.  果樹學(xué)報(bào). 2003(03)



本文編號(hào)：3383830