馬尾松NAC基因的克隆及功能分析
發(fā)布時(shí)間:2021-09-04 06:25
目前對(duì)NAC基因的研究集中在脅迫上,實(shí)驗(yàn)材料多是模式植物,如擬南芥、水稻和大豆等,對(duì)木本植物的研究較為薄弱,尤其是馬尾松等針葉樹(shù)種。通過(guò)對(duì)馬尾松苗木進(jìn)行全長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,獲取NAC基因的序列,分析干旱脅迫、低磷脅迫、生殖生長(zhǎng)過(guò)程中NAC基因的表達(dá),初探馬尾松NAC基因在逆境響應(yīng)過(guò)程和生殖生過(guò)程中發(fā)揮的作用,同時(shí)也為NAC基因功能的多樣化研究奠定基礎(chǔ)。主要結(jié)果如下:(1)通過(guò)對(duì)馬尾松正常生長(zhǎng)和干旱脅迫過(guò)程中的1年生幼苗進(jìn)行全長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,共獲得94條NAC基因,利用已公布的擬南芥NAC蛋白和馬尾松NAC蛋白構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)發(fā)現(xiàn),馬尾松NAC蛋白存在于AtNAC3、NAP、NAM、OsNAC7、NAC2、ONAC003、ANAC011、PmATAF8個(gè)亞家族中,其中PmATAF亞家族是馬尾松特有的。馬尾松NAC蛋白保守基序分析,馬尾松NAC蛋白共存在的10個(gè)基序中,其中5、6、1、2、3基序與NAC基因的A、B、C、D、E亞結(jié)構(gòu)域?qū)?yīng)。亞家族內(nèi)大部分成員都具有相同的基序,僅有部分馬尾松NAC蛋白保守基序丟失。(2)通過(guò)對(duì)馬尾松苗木干旱脅迫下二代轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析發(fā)現(xiàn),94條NAC基因中有11條在干...
【文章來(lái)源】:貴州大學(xué)貴州省 211工程院校
【文章頁(yè)數(shù)】:66 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
不同的NAC轉(zhuǎn)錄因子在植物系統(tǒng)中扮演的角色(Elizebeth&Pinky2018)
技術(shù)路線圖
通過(guò)HMM進(jìn)行NAC相關(guān)基因的鑒定,共獲得94條NAC基因,大部分的NAC基因局部的序列相似度較高。本研究利用擬南芥已經(jīng)公布的NAC蛋白和通過(guò)全長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序得到的94條NAC蛋白構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹(shù)(圖2-1),該系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)參考了水稻NAC的分類方法(Ooka H et al.,2003)。分析發(fā)現(xiàn)擬南芥和馬尾松NAC蛋白不均勻的分為17個(gè)亞家族,這可能是馬尾松和擬南芥經(jīng)歷了不同的基因組事件造成的。馬尾松NAC蛋白存在于AtNAC3、NAP、 NAM、 OsNAC7、NAC2、ONAC003、ANAC011、PmATAF分別有5、8、4、2、15、4、46、10條,其中PmATAF屬于馬尾松NAC蛋白獨(dú)立分出來(lái)的亞家族,并把該亞家族命名為PmATAF,馬尾松獨(dú)立出來(lái)的NAC亞家族基因,有可能是由于NAC基因在馬尾松中發(fā)生了特異性分化,也驗(yàn)證了模式植物中的NAC基因并沒(méi)有覆蓋全部植物
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]沙冬青AmNAC6基因的克隆與功能初步分析[J]. 唐寬剛,任美艷,張文君,龐新躍,薛敏,王茅雁. 植物科學(xué)學(xué)報(bào). 2018(05)
[2]基于馬尾松干旱轉(zhuǎn)錄組的抗旱功能SSR位點(diǎn)分析[J]. 杜明鳳,丁貴杰. 林業(yè)科學(xué)研究. 2018(05)
[3]杉木NAC轉(zhuǎn)錄因子基因ClNAC1的克隆、表達(dá)及單核苷酸多態(tài)性分析[J]. 魏明科,俞金健,黃曉龍,劉瓊瑤,黃華宏,林二培,童再康. 林業(yè)科學(xué). 2018(09)
[4]馬尾松不同葉型幼苗對(duì)干旱及復(fù)水的生長(zhǎng)及生理響應(yīng)[J]. 王好運(yùn),吳峰,吳昌明,于淞,朱小坤,謝維斌. 東北林業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2018(01)
[5]NAC轉(zhuǎn)錄因子在植物對(duì)生物和非生物脅迫響應(yīng)中的功能[J]. 周鴻慧,黃紅,徐彬磊,蘇醒,鄧蓉,洪永波,蔣明,宋鳳鳴,張慧娟. 植物生理學(xué)報(bào). 2017(08)
[6]不同家系馬尾松對(duì)持續(xù)干旱的響應(yīng)及抗旱性[J]. 杜明鳳,丁貴杰,趙熙州. 林業(yè)科學(xué). 2017(06)
[7]干旱脅迫下馬尾松幼苗針葉揮發(fā)性物質(zhì)與內(nèi)源激素的變化[J]. 全文選,丁貴杰. 林業(yè)科學(xué). 2017(04)
[8]馬尾松谷胱甘肽過(guò)氧化物酶PmGPX6基因cDNA克隆及轉(zhuǎn)化擬南芥耐旱性初步研究[J]. 蔡瓊,丁貴杰,文曉鵬. 林業(yè)科學(xué)研究. 2016(06)
[9]油松小孢子葉球性反轉(zhuǎn)異常繁殖行為研究[J]. 張喜順,劉世界. 吉林農(nóng)業(yè). 2015(16)
[10]植物NAC轉(zhuǎn)錄因子功能研究新進(jìn)展[J]. 陳娜,蔣晶,曹必好,雷建軍,陳長(zhǎng)明. 分子植物育種. 2015(06)
博士論文
[1]馬尾松抗旱相關(guān)基因的克隆及表達(dá)分析[D]. 蔡瓊.貴州大學(xué) 2017
[2]蘋(píng)果屬觀賞海棠類黃酮種類、代謝及生物活性分析[D]. 秦曉曉.西南大學(xué) 2016
碩士論文
[1]“多球果”馬尾松孢子葉球分化及發(fā)育研究[D]. 陳庭巧.貴州大學(xué) 2016
[2]番茄SlNAM1轉(zhuǎn)錄因子的分離與功能分析[D]. 李曉東.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[3]杉木NAC基因的克隆、表達(dá)和SNP分析[D]. 劉瓊瑤.浙江農(nóng)林大學(xué) 2015
[4]馬尾松CAD和CCoAOMT基因的克隆與表達(dá)分析[D]. 張逢凱.南京林業(yè)大學(xué) 2014
本文編號(hào):3382744
【文章來(lái)源】:貴州大學(xué)貴州省 211工程院校
【文章頁(yè)數(shù)】:66 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
不同的NAC轉(zhuǎn)錄因子在植物系統(tǒng)中扮演的角色(Elizebeth&Pinky2018)
技術(shù)路線圖
通過(guò)HMM進(jìn)行NAC相關(guān)基因的鑒定,共獲得94條NAC基因,大部分的NAC基因局部的序列相似度較高。本研究利用擬南芥已經(jīng)公布的NAC蛋白和通過(guò)全長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序得到的94條NAC蛋白構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹(shù)(圖2-1),該系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)參考了水稻NAC的分類方法(Ooka H et al.,2003)。分析發(fā)現(xiàn)擬南芥和馬尾松NAC蛋白不均勻的分為17個(gè)亞家族,這可能是馬尾松和擬南芥經(jīng)歷了不同的基因組事件造成的。馬尾松NAC蛋白存在于AtNAC3、NAP、 NAM、 OsNAC7、NAC2、ONAC003、ANAC011、PmATAF分別有5、8、4、2、15、4、46、10條,其中PmATAF屬于馬尾松NAC蛋白獨(dú)立分出來(lái)的亞家族,并把該亞家族命名為PmATAF,馬尾松獨(dú)立出來(lái)的NAC亞家族基因,有可能是由于NAC基因在馬尾松中發(fā)生了特異性分化,也驗(yàn)證了模式植物中的NAC基因并沒(méi)有覆蓋全部植物
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]沙冬青AmNAC6基因的克隆與功能初步分析[J]. 唐寬剛,任美艷,張文君,龐新躍,薛敏,王茅雁. 植物科學(xué)學(xué)報(bào). 2018(05)
[2]基于馬尾松干旱轉(zhuǎn)錄組的抗旱功能SSR位點(diǎn)分析[J]. 杜明鳳,丁貴杰. 林業(yè)科學(xué)研究. 2018(05)
[3]杉木NAC轉(zhuǎn)錄因子基因ClNAC1的克隆、表達(dá)及單核苷酸多態(tài)性分析[J]. 魏明科,俞金健,黃曉龍,劉瓊瑤,黃華宏,林二培,童再康. 林業(yè)科學(xué). 2018(09)
[4]馬尾松不同葉型幼苗對(duì)干旱及復(fù)水的生長(zhǎng)及生理響應(yīng)[J]. 王好運(yùn),吳峰,吳昌明,于淞,朱小坤,謝維斌. 東北林業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2018(01)
[5]NAC轉(zhuǎn)錄因子在植物對(duì)生物和非生物脅迫響應(yīng)中的功能[J]. 周鴻慧,黃紅,徐彬磊,蘇醒,鄧蓉,洪永波,蔣明,宋鳳鳴,張慧娟. 植物生理學(xué)報(bào). 2017(08)
[6]不同家系馬尾松對(duì)持續(xù)干旱的響應(yīng)及抗旱性[J]. 杜明鳳,丁貴杰,趙熙州. 林業(yè)科學(xué). 2017(06)
[7]干旱脅迫下馬尾松幼苗針葉揮發(fā)性物質(zhì)與內(nèi)源激素的變化[J]. 全文選,丁貴杰. 林業(yè)科學(xué). 2017(04)
[8]馬尾松谷胱甘肽過(guò)氧化物酶PmGPX6基因cDNA克隆及轉(zhuǎn)化擬南芥耐旱性初步研究[J]. 蔡瓊,丁貴杰,文曉鵬. 林業(yè)科學(xué)研究. 2016(06)
[9]油松小孢子葉球性反轉(zhuǎn)異常繁殖行為研究[J]. 張喜順,劉世界. 吉林農(nóng)業(yè). 2015(16)
[10]植物NAC轉(zhuǎn)錄因子功能研究新進(jìn)展[J]. 陳娜,蔣晶,曹必好,雷建軍,陳長(zhǎng)明. 分子植物育種. 2015(06)
博士論文
[1]馬尾松抗旱相關(guān)基因的克隆及表達(dá)分析[D]. 蔡瓊.貴州大學(xué) 2017
[2]蘋(píng)果屬觀賞海棠類黃酮種類、代謝及生物活性分析[D]. 秦曉曉.西南大學(xué) 2016
碩士論文
[1]“多球果”馬尾松孢子葉球分化及發(fā)育研究[D]. 陳庭巧.貴州大學(xué) 2016
[2]番茄SlNAM1轉(zhuǎn)錄因子的分離與功能分析[D]. 李曉東.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[3]杉木NAC基因的克隆、表達(dá)和SNP分析[D]. 劉瓊瑤.浙江農(nóng)林大學(xué) 2015
[4]馬尾松CAD和CCoAOMT基因的克隆與表達(dá)分析[D]. 張逢凱.南京林業(yè)大學(xué) 2014
本文編號(hào):3382744
本文鏈接:http://sikaile.net/kejilunwen/jiyingongcheng/3382744.html
最近更新
教材專著