喹諾酮類耐藥菌及耐藥基因在羅非魚和雜交鱧養(yǎng)殖中的分布特征
發(fā)布時間:2021-09-02 10:33
作為全球嚴峻的公共衛(wèi)生問題之一,細菌耐藥性問題近年來在水產養(yǎng)殖業(yè)中愈發(fā)受到重視,喹諾酮類藥物是水產養(yǎng)殖中較為常用的抗菌藥物之一,其耐藥性問題也愈發(fā)凸顯。羅非魚和雜交鱧均是我國重要的特色淡水經濟魚類,且均有著養(yǎng)殖產量高、養(yǎng)殖密度大等特點。羅非魚和雜交鱧(斑鱧Channa maculata♀×烏鱧Channa argus♂)養(yǎng)殖中喹諾酮類藥物耐藥現象也較為普遍。目前國內外對水產養(yǎng)殖動物(水產品)或養(yǎng)殖環(huán)境的細菌耐藥性研究,多限于對某一種屬菌株的耐藥性研究,對反映魚體或環(huán)境中細菌耐藥情況不夠全面。本研究旨在通過喹諾酮類藥物(萘啶酸和恩諾沙星)篩選培養(yǎng)的方式,了解不同養(yǎng)殖階段羅非魚和雜交鱧的魚腸道及養(yǎng)殖環(huán)境中喹諾酮類耐藥菌的產生比例及耐藥細菌的種類,同時對羅非魚和雜交鱧養(yǎng)殖中質粒介導的喹諾酮類耐藥基因進行類型與豐度分析,明確喹諾酮類耐藥菌及耐藥基因的分布特征,評估喹諾酮類耐藥傳播風險,從而為建立水產品耐藥防控技術提供數據支撐,以及為抗菌藥物的合理使用和保障水產品質量安全提供理論依據。采用細菌平板計數法計算羅非魚和雜交鱧在不同養(yǎng)殖階段魚腸道及養(yǎng)殖環(huán)境的菌落數量,結果顯示,在各養(yǎng)殖階段可培養(yǎng)菌的菌...
【文章來源】:上海海洋大學上海市
【文章頁數】:72 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
羅非魚及其養(yǎng)殖環(huán)境樣品OUTShannon稀釋曲線
上海海洋大學碩士學位論文282.3雜交鱧及其養(yǎng)殖環(huán)境中細菌群結構特征2.3.1雜交鱧及其養(yǎng)殖環(huán)境樣品的微生物多樣性分析根據不同養(yǎng)殖階段雜交鱧及其養(yǎng)殖環(huán)境樣品的α多樣性指數結果顯示,OTU稀釋曲線趨于平緩并達到平臺期(圖2-6),說明測序量足夠且能對樣品中微生物組成進行較為全面的展示。根據Shannon指數和Simpson指數結果可得,雜交鱧腸道的微生物多樣性高于養(yǎng)殖環(huán)境樣品。不同養(yǎng)殖階段比較,腸道的微生物多樣性,中間階段>上市階段、苗種階段;池塘水樣品,苗種階段、上市階段>養(yǎng)殖中期;底泥樣品,苗種階段>中間階段>上市階段。圖2-6雜交鱧及其養(yǎng)殖環(huán)境樣品OUTShannon稀釋曲線Fig.2-6Rarefactioncurvesbythehybridsnakeheadintestineandenvironmentalsamples注:CH表示雜交鱧;X、Y、Z分別表示為苗種階段、養(yǎng)殖中期和上市階段;F、W、S分別表示為雜交鱧腸道、池塘水和池塘底泥樣品;O表示為無藥物篩選;A、B、C表示為三個不同采樣點Note:CHrepresentshybridsnakehead;X,Y,andZrepresentthefingerlingstage,juvenilestageandadultstages,respectively;F,W,andSrepresentthehybridsnakeheadintestine,pondwater,andpondsedimentsamples;Orepresentsdrug-freeselectedmedium;A,B,Crepresentthreedifferentsamplingsites
上海海洋大學碩士學位論文44圖3-1羅非魚不同養(yǎng)殖階段各類樣品PMQR基因絕對豐度熱圖Fig.3-1HeatmapofabsoluteabundanceofPMQRgenesinvarioussamplesatdifferentculturestagesoftilapia注:T表示羅非魚;X、Y、Z分別表示為苗種階段、養(yǎng)殖中期和上市階段;F、S、W分別表示為魚腸道、池塘水和池塘底泥樣品;A、B、C表示為三個不同采樣點;單位:lg(copies·g-1或copies·mL-1)。Note:Trepresentstilapia;X,Y,andZrepresentthefingerlingstage,juvenilestageandadultstages,respectively;F,W,andSrepresentthehybridsnakeheadintestine,pondwater,andpondsedimentsamples;A,B,Crepresentethreedifferentsamplingsites;Unit:lg(copies·g-1orcopies·mL-1).
【參考文獻】:
期刊論文
[1]類志賀鄰單胞菌的檢測方法概述[J]. 陳美群,扎西拉姆,潘瑛子. 西藏農業(yè)科技. 2019(04)
[2]廣東主要水產養(yǎng)殖地區(qū)氣單胞菌耐藥狀況的調查分析[J]. 鄧玉婷,譚愛萍,張瑞泉,趙飛,姜蘭. 南方農業(yè)學報. 2019(11)
[3]豆粕對烏鱧腸道菌群組成及微生物氨基酸代謝酶活性的影響[J]. 朱錦裕,韓蓓,卜弘毅,胡俊濤,張鑫,劉令軍,苗淑彥. 水產學報. 2020(04)
[4]自然感染無乳鏈球菌羅非魚的比較病理學及毒力基因譜分析[J]. 謝云丹,馮娟,劉嬋,鄧益琴,王江勇,蘇友祿. 南方水產科學. 2019(02)
[5]羅非魚水產品中的喹諾酮類藥物耐藥菌和耐藥基因檢測分析[J]. 郭學中,張瑞泉,姜蘭,譚愛萍,鄧玉婷,李金祥,趙飛,劉付翠,何山. 中國水產科學. 2018(05)
[6]腸道感染氣單胞菌、鄰單胞菌的流行病學分布與耐藥性分析[J]. 李世榮,蔣曉飛. 檢驗醫(yī)學. 2018(08)
[7]不同養(yǎng)殖階段羅非魚腸道微生物多樣性的動態(tài)分析[J]. 佟延南,李芳遠,李忠琴,趙光軍,李高俊,王德強. 南方農業(yè)學報. 2018(07)
[8]應用高通量測序技術分析大菱鲆幼魚腸道及其養(yǎng)殖環(huán)境的微生物群落結構[J]. 吳歡歡,王偉繼,呂丁,胡玉龍,孔杰. 漁業(yè)科學進展. 2019(04)
[9]2008~2017年間北京進出口水產品中副溶血性弧菌耐藥性分析[J]. 付溥博,張西萌,馬丹,徐蕾蕊,魏海燕,魏詠新,曾靜. 食品安全質量檢測學報. 2018(14)
[10]食品動物養(yǎng)殖環(huán)境中細菌耐藥性研究進展[J]. 史曉敏,王少林. 生物工程學報. 2018(08)
博士論文
[1]aac(6’)-Ib-cr基因對氟喹諾酮類藥物耐藥的作用研究[D]. 張文慧.華南農業(yè)大學 2016
碩士論文
[1]海水養(yǎng)殖源弧菌耐藥性調查與外排泵抑制劑對其耐藥性的影響[D]. 李健.上海海洋大學 2017
[2]中國羅非魚源無乳鏈球菌流行特征及耐藥性研究[D]. 袁偉.上海海洋大學 2017
[3]鴨-魚混養(yǎng)場養(yǎng)殖環(huán)境抗菌藥物耐藥基因污染及微生物群落特征[D]. 鐘曉霞.華南農業(yè)大學 2016
[4]江蘇省沿海地區(qū)水產養(yǎng)殖主要致病菌耐藥性研究[D]. 喬毅.上海海洋大學 2015
[5]四川地區(qū)斑點叉尾鮰源維氏氣單胞菌的耐藥性以及耐藥基因檢測分析[D]. 趙敏.四川農業(yè)大學 2013
本文編號:3378852
【文章來源】:上海海洋大學上海市
【文章頁數】:72 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
羅非魚及其養(yǎng)殖環(huán)境樣品OUTShannon稀釋曲線
上海海洋大學碩士學位論文282.3雜交鱧及其養(yǎng)殖環(huán)境中細菌群結構特征2.3.1雜交鱧及其養(yǎng)殖環(huán)境樣品的微生物多樣性分析根據不同養(yǎng)殖階段雜交鱧及其養(yǎng)殖環(huán)境樣品的α多樣性指數結果顯示,OTU稀釋曲線趨于平緩并達到平臺期(圖2-6),說明測序量足夠且能對樣品中微生物組成進行較為全面的展示。根據Shannon指數和Simpson指數結果可得,雜交鱧腸道的微生物多樣性高于養(yǎng)殖環(huán)境樣品。不同養(yǎng)殖階段比較,腸道的微生物多樣性,中間階段>上市階段、苗種階段;池塘水樣品,苗種階段、上市階段>養(yǎng)殖中期;底泥樣品,苗種階段>中間階段>上市階段。圖2-6雜交鱧及其養(yǎng)殖環(huán)境樣品OUTShannon稀釋曲線Fig.2-6Rarefactioncurvesbythehybridsnakeheadintestineandenvironmentalsamples注:CH表示雜交鱧;X、Y、Z分別表示為苗種階段、養(yǎng)殖中期和上市階段;F、W、S分別表示為雜交鱧腸道、池塘水和池塘底泥樣品;O表示為無藥物篩選;A、B、C表示為三個不同采樣點Note:CHrepresentshybridsnakehead;X,Y,andZrepresentthefingerlingstage,juvenilestageandadultstages,respectively;F,W,andSrepresentthehybridsnakeheadintestine,pondwater,andpondsedimentsamples;Orepresentsdrug-freeselectedmedium;A,B,Crepresentthreedifferentsamplingsites
上海海洋大學碩士學位論文44圖3-1羅非魚不同養(yǎng)殖階段各類樣品PMQR基因絕對豐度熱圖Fig.3-1HeatmapofabsoluteabundanceofPMQRgenesinvarioussamplesatdifferentculturestagesoftilapia注:T表示羅非魚;X、Y、Z分別表示為苗種階段、養(yǎng)殖中期和上市階段;F、S、W分別表示為魚腸道、池塘水和池塘底泥樣品;A、B、C表示為三個不同采樣點;單位:lg(copies·g-1或copies·mL-1)。Note:Trepresentstilapia;X,Y,andZrepresentthefingerlingstage,juvenilestageandadultstages,respectively;F,W,andSrepresentthehybridsnakeheadintestine,pondwater,andpondsedimentsamples;A,B,Crepresentethreedifferentsamplingsites;Unit:lg(copies·g-1orcopies·mL-1).
【參考文獻】:
期刊論文
[1]類志賀鄰單胞菌的檢測方法概述[J]. 陳美群,扎西拉姆,潘瑛子. 西藏農業(yè)科技. 2019(04)
[2]廣東主要水產養(yǎng)殖地區(qū)氣單胞菌耐藥狀況的調查分析[J]. 鄧玉婷,譚愛萍,張瑞泉,趙飛,姜蘭. 南方農業(yè)學報. 2019(11)
[3]豆粕對烏鱧腸道菌群組成及微生物氨基酸代謝酶活性的影響[J]. 朱錦裕,韓蓓,卜弘毅,胡俊濤,張鑫,劉令軍,苗淑彥. 水產學報. 2020(04)
[4]自然感染無乳鏈球菌羅非魚的比較病理學及毒力基因譜分析[J]. 謝云丹,馮娟,劉嬋,鄧益琴,王江勇,蘇友祿. 南方水產科學. 2019(02)
[5]羅非魚水產品中的喹諾酮類藥物耐藥菌和耐藥基因檢測分析[J]. 郭學中,張瑞泉,姜蘭,譚愛萍,鄧玉婷,李金祥,趙飛,劉付翠,何山. 中國水產科學. 2018(05)
[6]腸道感染氣單胞菌、鄰單胞菌的流行病學分布與耐藥性分析[J]. 李世榮,蔣曉飛. 檢驗醫(yī)學. 2018(08)
[7]不同養(yǎng)殖階段羅非魚腸道微生物多樣性的動態(tài)分析[J]. 佟延南,李芳遠,李忠琴,趙光軍,李高俊,王德強. 南方農業(yè)學報. 2018(07)
[8]應用高通量測序技術分析大菱鲆幼魚腸道及其養(yǎng)殖環(huán)境的微生物群落結構[J]. 吳歡歡,王偉繼,呂丁,胡玉龍,孔杰. 漁業(yè)科學進展. 2019(04)
[9]2008~2017年間北京進出口水產品中副溶血性弧菌耐藥性分析[J]. 付溥博,張西萌,馬丹,徐蕾蕊,魏海燕,魏詠新,曾靜. 食品安全質量檢測學報. 2018(14)
[10]食品動物養(yǎng)殖環(huán)境中細菌耐藥性研究進展[J]. 史曉敏,王少林. 生物工程學報. 2018(08)
博士論文
[1]aac(6’)-Ib-cr基因對氟喹諾酮類藥物耐藥的作用研究[D]. 張文慧.華南農業(yè)大學 2016
碩士論文
[1]海水養(yǎng)殖源弧菌耐藥性調查與外排泵抑制劑對其耐藥性的影響[D]. 李健.上海海洋大學 2017
[2]中國羅非魚源無乳鏈球菌流行特征及耐藥性研究[D]. 袁偉.上海海洋大學 2017
[3]鴨-魚混養(yǎng)場養(yǎng)殖環(huán)境抗菌藥物耐藥基因污染及微生物群落特征[D]. 鐘曉霞.華南農業(yè)大學 2016
[4]江蘇省沿海地區(qū)水產養(yǎng)殖主要致病菌耐藥性研究[D]. 喬毅.上海海洋大學 2015
[5]四川地區(qū)斑點叉尾鮰源維氏氣單胞菌的耐藥性以及耐藥基因檢測分析[D]. 趙敏.四川農業(yè)大學 2013
本文編號:3378852
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