高通量測序技術(shù)的出現(xiàn)為從整體水平上了解一個物種或特殊組織器官的基因轉(zhuǎn)錄情況成為可能,并且目前已經(jīng)成為研究缺乏基因組信息物種mRNA的主流技術(shù);同時,也為這些物種的功能基因的快速鑒定提供了一條途徑。本論文完成了粘蟲（Mythimna separate）成蟲頭部的de novo轉(zhuǎn)錄組測序,揭示了粘蟲成蟲頭部的基因表達情況,鑒定了粘蟲的生物鐘基因、黑色素合成途徑相關(guān)基因、嗅覺相關(guān)的非受體蛋白基因家族。同時,基于轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù),鑒定了參與柞蠶（Antheraea pernyi）蛻皮激素合成途徑的相關(guān)基因。粘蟲是一種分布廣泛、遷飛能力強的重要農(nóng)業(yè)害蟲。然而,關(guān)于粘蟲遷飛的生理上和行為上應激反應的分子調(diào)控機制的知識仍所知甚少。本論文進行了粘蟲成蟲頭部的轉(zhuǎn)錄組測序。測序共產(chǎn)生了63499個轉(zhuǎn)錄本,進一步組裝成了46459個unigene（N50為1153 bp）,其中有22334個在數(shù)據(jù)庫中具有注釋信息。我們發(fā)現(xiàn),在成蟲頭部的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)中,參與信號轉(zhuǎn)導機制的基因最為豐富,總計有937個信號轉(zhuǎn)導相關(guān)基因被注釋到22個信號通路中�；讷@得的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),我們鑒定了粘蟲的生物鐘相關(guān)基因、黑色素合成途徑相關(guān)基... 

【文章來源】：沈陽農(nóng)業(yè)大學遼寧省

【文章頁數(shù)】：99 頁

【學位級別】：碩士

【部分圖文】：

粘蟲及其對玉米、小麥的破壞Fig.1-1Mythimnaseparataanditsdamagetocropsandmaizecorning

有 4 次大范圍的遷飛活動。遷飛與生殖行為的調(diào)控機制也有了一定的進展，包括明的神經(jīng)肽（AT 和 AST）和保幼激素酯酶（JHE）以及體（Vg 和 VgR）、性信息素合成激活肽及其受體（PBA的發(fā)生與調(diào)控中起重要作用（張蕾 2006；江幸福和羅我們對粘蟲遷飛的生理調(diào)節(jié)和行為反應的調(diào)控機制方面粘蟲成蟲的頭部為材料進行了轉(zhuǎn)錄組測序分析，并鑒定應的重要生理功能基因，為進一步的功能研究提供基因raea pernyi）屬鱗翅目大蠶蛾科，以蛹滯育，這也是柞的以胚胎滯育的典型特征之一。特色昆蟲，繭（蛹）的年產(chǎn)量近 8 萬噸，占世界產(chǎn)量的柞蠶還被用作昆蟲食品（幼蟲、蛹、蛾）。

沈陽農(nóng)業(yè)大學碩士學位論文ene 的功能注釋蟲頭部轉(zhuǎn)錄組的功能注釋中，我們利用 Blastx 工具在 NCBI 中對 46,459列進行了檢索，其中 E 值設(shè)置為 10-5。使用這種方法，在 Nr 數(shù)據(jù)庫的總共有 19,973 條 unigene 序列有功能注釋（在所有序列中占 42.99%），t 數(shù)據(jù)庫中有 12,703 條（27.34%）有匹配，在 Pfam 數(shù)據(jù)庫中具有 13,46體上，至少有 22,334（48.07%）條 unigene 在至少一個數(shù)據(jù)庫中具有功能 Nr 數(shù)據(jù)庫后，我們發(fā)現(xiàn)家蠶是具有最高的匹配率（46.3%）的物種，黑二（30.0%）（圖 2-2）。

【參考文獻】：
期刊論文
[1]生物鐘:基因和環(huán)境決定的行為——2017年諾貝爾生理學或醫(yī)學獎簡介[J]. 俞強.  自然雜志. 2017(06)
[2]光周期和溫度對生物鐘基因cwo在棉鈴蟲幼蟲節(jié)律表達的影響[J]. 劉孝明,張松斗,馬木提·賽麗蔓,鄒馳,李貞,張青文,劉小俠.  應用昆蟲學報. 2016(05)
[3]昆蟲鐘基因研究進展[J]. 任爽,魏慧敏,郝友進,陳斌.  昆蟲學報. 2016(03)
[4]家蠶晝夜節(jié)律生物鐘基因的生物信息學分析[J]. 王文棟,束梅影,張達艷,徐世清.  四川動物. 2016(02)
[5]粘蟲轉(zhuǎn)錄組中SSR位點的信息分析[J]. 胡艷華,李敏,張虎芳,李生才,王青,趙惠玲.  山西農(nóng)業(yè)大學學報(自然科學版). 2015(05)
[6]高通量轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)及其在鱗翅目昆蟲上的應用[J]. 楊帆,黃立華,張愛兵.  昆蟲學報. 2014(08)
[7]我國粘蟲研究現(xiàn)狀及發(fā)展趨勢[J]. 江幸福,張蕾,程云霞,羅禮智.  應用昆蟲學報. 2014(04)
[8]基于新一代測序技術(shù)的昆蟲轉(zhuǎn)錄組學研究進展[J]. 張棋麟,袁明龍.  昆蟲學報. 2013(12)
[9]溫度與光照節(jié)律對家蠶成蟲生物鐘基因Cry1和Cry2表達的影響[J]. 張達燕,梁輝,司馬楊虎,徐世清.  蠶業(yè)科學. 2013(03)
[10]2012年黏蟲暴發(fā)特點分析與監(jiān)測預警建議[J]. 曾娟,姜玉英,劉杰.  植物保護. 2013(02)

博士論文
[1]粘蟲遷飛型轉(zhuǎn)為居留型的關(guān)鍵時期和調(diào)控基礎(chǔ)[D]. 張蕾.中國農(nóng)業(yè)科學院 2006

碩士論文
[1]柞蠶與家蠶前胸腺的比較轉(zhuǎn)錄組分析[D]. 鄭茜茜.沈陽農(nóng)業(yè)大學 2017



本文編號：3369180