水稻溫敏核不育系HD9802S不育基因的定位
發(fā)布時(shí)間:2021-08-28 00:41
糧食的增產(chǎn)方向有種質(zhì)資源的發(fā)掘、新的基因和雜種優(yōu)勢的利用。水稻的自花授粉給水稻雜交帶來了難題,而水稻雄性不育很好地解決了這個(gè)問題。兩系法很好地利用了雜種優(yōu)勢,它的優(yōu)點(diǎn)在于:一、一系兩用。二、充分利用遺傳資源,更易于篩選出優(yōu)勢組合。三、不育性狀易于轉(zhuǎn)育。四、核不育系簡化了繁殖程序。湖北大學(xué)遺傳學(xué)研究室的HD9802S為本研究中所用到的溫敏核不育系,其不育基因在之前的研究中被命名為HDtms。本研究采用兩種不同的方法對不育基因HDtms進(jìn)行定位:第一種方法是以HD9802S/(HD9802S/R287)BC1群體為材料結(jié)合SSR標(biāo)記法進(jìn)行遺傳圖譜的構(gòu)建,并且篩選出與不育基因緊密連鎖可以運(yùn)用于分子標(biāo)記輔助選擇的SSR標(biāo)記。第二種方法是以HD9802S/R287F2群體為材料結(jié)合BSA重測序法,對候選區(qū)間內(nèi)可以引起功能突變的SNP或者InDel進(jìn)行篩選與分析。具體的研究結(jié)果有以下幾點(diǎn):1、對HD9802S/(HD9802S/R287)BC1群體進(jìn)行花粉育性鑒定,采用了兩種標(biāo)準(zhǔn)劃分不育株與可育株,經(jīng)卡方檢驗(yàn),不育株與可育株的分離均符合1:l的理論比例,表明HD9802S的不育性由一對主效隱性核基...
【文章來源】:湖北大學(xué)湖北省
【文章頁數(shù)】:81 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖2-1?HD9802S/?(HD9802S/R287)?BC!群體花粉可染率分布??注:橫坐標(biāo)為花粉可染率,縱坐標(biāo)為每個(gè)花粉可染區(qū)間分布的植株數(shù)量
2.2結(jié)果與分析??2.2.1育性分離模式分析??根據(jù)BC!群體中589個(gè)單株的花粉鏡檢結(jié)果,以花粉可染率來劃分區(qū)間。由圖2-1??可以明顯看到出現(xiàn)了兩個(gè)育性峰值,其中“0”和“<5%”區(qū)間組成第一峰,“70%-80%”和??“?>?80%”區(qū)間組成第二峰,表示主效基因發(fā)揮重要作用;“5%-10%”、“?10%-20%”、??“20%-30%”、“30%-40%”、“40%-50%”、“50%-60%”、“60%-70%”七個(gè)區(qū)間組成峰谷,??每個(gè)區(qū)間均有植株分布,表示HD9802S的不育性受到微效基因的影響。??本研究采取兩種不同劃分方法來分析:1.以花粉可染率<5%區(qū)間分布的植株作為??不育株,以花粉可染率>5%區(qū)間分布的植株作為可育株;2.仍以花粉可染率<5%區(qū)間??分布的植株作為不育株,以花粉可染率>40%區(qū)間分布的植株作為可育株,花粉可染率??5%?40%區(qū)間分布的植株作為過渡帶不整合入統(tǒng)計(jì)。將以上兩種劃分方法的統(tǒng)計(jì)結(jié)果列??于表2-1,當(dāng)x2<X2〇.〇5時(shí),則:6(:1花粉育性分離比例符合1:?1,當(dāng)P值為0.05時(shí),對??應(yīng)的X2g.〇5山=3.84。通過卡方檢驗(yàn)發(fā)現(xiàn)兩種劃分方法的卡方值分別為0.890和2.250
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【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]高通量轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)在植物雄性不育研究中的應(yīng)用[J]. 劉永明,張玲,邱濤,趙卓凡,曹墨菊. 遺傳. 2016(08)
[2]測序技術(shù)的研究進(jìn)展及三代測序的應(yīng)用[J]. 烏日拉嘎,徐海燕,馮淑貞,孫志宏,孟和畢力格,張和平. 中國乳品工業(yè). 2016(04)
[3]小麥生理型雄性不育系中反式烯脂酰-CoA還原酶基因(TaECR)的克隆及表達(dá)分析[J]. 巴青松,張改生,車會(huì)學(xué),劉紅占,張龍雨,王書平. 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報(bào). 2013(07)
[4]第三代測序基本原理[J]. 李明爽,趙敏. 現(xiàn)代生物醫(yī)學(xué)進(jìn)展. 2012(10)
[5]Fine mapping and candidate gene prediction of the photoperiod and thermo-sensitive genic male sterile gene pms1(t) in rice[J]. Yuan-fei ZHOU,Xian-yin ZHANG,Qing-zhong XUE (Department of Agronomy,College of Agriculture and Biotechnology,Zhejiang University,Hangzhou 310029,China). Journal of Zhejiang University-Science B(Biomedicine & Biotechnology). 2011(06)
[6]光溫敏核不育水稻的研究進(jìn)展[J]. 陳云風(fēng). 宜春學(xué)院學(xué)報(bào). 2010(08)
[7]水稻光溫敏雄性核不育系廣占63S不育基因PTGMS2-1的遺傳分析與分子定位[J]. 王寶和,徐建軍,吳銀慧,朱金燕,李生強(qiáng),周勇,程小濤,梁國華. 中國水稻科學(xué). 2010(04)
[8]SNP標(biāo)記技術(shù)及其在農(nóng)作物育種中的應(yīng)用[J]. 李兆波,吳禹,王巖,汪由,王光霞. 遼寧農(nóng)業(yè)職業(yè)技術(shù)學(xué)院學(xué)報(bào). 2010(03)
[9]水稻光溫敏核不育機(jī)理設(shè)想及光溫敏核不育系選育策略[J]. 陳立云,肖應(yīng)輝. 中國水稻科學(xué). 2010(02)
[10]ISSR分子標(biāo)記技術(shù)在植物種質(zhì)資源研究中的應(yīng)用[J]. 朱巖芳,祝水金,李永平,馬文廣,鄭昀曄,胡晉. 種子. 2010(02)
博士論文
[1]白背飛虱基因組測序及其受南方水稻黑條矮縮病毒侵染的轉(zhuǎn)錄組分析[D]. 唐楠.中國科學(xué)技術(shù)大學(xué) 2017
[2]水稻光敏感雄性核不育基因pms1的克隆與功能分析[D]. 范優(yōu)榮.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[3]水稻溫敏雄性不育基因tms9-1的定位及單糖轉(zhuǎn)運(yùn)體基因?qū)τ院凸酀{的影響[D]. 祁永斌.浙江大學(xué) 2014
[4]利用高通量測序技術(shù)研究基因組復(fù)制與關(guān)系以及可變剪切[D]. 王海峰.復(fù)旦大學(xué) 2014
[5]水稻光溫敏核雄性不育遺傳及基因定位研究[D]. 周元飛.浙江大學(xué) 2007
碩士論文
[1]基于HRM技術(shù)的水稻全基因組SNP標(biāo)記開發(fā)及其初步應(yīng)用[D]. 郭海洋.華南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[2]水稻光溫敏核不育綿9S的遺傳分析與基因定位[D]. 趙敏會(huì).四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
[3]水稻野栽遠(yuǎn)源雜交來源的溫敏核雄性不育基因tms7的精細(xì)定位[D]. 鄒丹妮.海南大學(xué) 2011
[4]利用SSR分子標(biāo)記定位水稻短光敏雄性不育基因[D]. 馬棟.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010
[5]水稻雄性不育系和保持系花培的比較研究[D]. 張保蘭.西南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2003
[6]光敏核不育水稻基因pms1物理圖譜的構(gòu)建及候選基因的確定[D]. 劉南.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2000
本文編號:3367432
【文章來源】:湖北大學(xué)湖北省
【文章頁數(shù)】:81 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖2-1?HD9802S/?(HD9802S/R287)?BC!群體花粉可染率分布??注:橫坐標(biāo)為花粉可染率,縱坐標(biāo)為每個(gè)花粉可染區(qū)間分布的植株數(shù)量
2.2結(jié)果與分析??2.2.1育性分離模式分析??根據(jù)BC!群體中589個(gè)單株的花粉鏡檢結(jié)果,以花粉可染率來劃分區(qū)間。由圖2-1??可以明顯看到出現(xiàn)了兩個(gè)育性峰值,其中“0”和“<5%”區(qū)間組成第一峰,“70%-80%”和??“?>?80%”區(qū)間組成第二峰,表示主效基因發(fā)揮重要作用;“5%-10%”、“?10%-20%”、??“20%-30%”、“30%-40%”、“40%-50%”、“50%-60%”、“60%-70%”七個(gè)區(qū)間組成峰谷,??每個(gè)區(qū)間均有植株分布,表示HD9802S的不育性受到微效基因的影響。??本研究采取兩種不同劃分方法來分析:1.以花粉可染率<5%區(qū)間分布的植株作為??不育株,以花粉可染率>5%區(qū)間分布的植株作為可育株;2.仍以花粉可染率<5%區(qū)間??分布的植株作為不育株,以花粉可染率>40%區(qū)間分布的植株作為可育株,花粉可染率??5%?40%區(qū)間分布的植株作為過渡帶不整合入統(tǒng)計(jì)。將以上兩種劃分方法的統(tǒng)計(jì)結(jié)果列??于表2-1,當(dāng)x2<X2〇.〇5時(shí),則:6(:1花粉育性分離比例符合1:?1,當(dāng)P值為0.05時(shí),對??應(yīng)的X2g.〇5山=3.84。通過卡方檢驗(yàn)發(fā)現(xiàn)兩種劃分方法的卡方值分別為0.890和2.250
??-??圖2-2農(nóng)業(yè)部水稻品種鑒定推薦的48個(gè)位點(diǎn)的SSR標(biāo)記在HD9802S和R287間的多態(tài)??性??注:泳道卜96為以農(nóng)業(yè)部水稻品種鑒定推薦的48個(gè)位點(diǎn)的SSR標(biāo)記為引物分別對HD9802S和R287的DNA進(jìn)行??擴(kuò)增的條帶?,1-48為48對SSR標(biāo)記的編號,紅色編號及藍(lán)色劃線標(biāo)注對應(yīng)的是有明顯多態(tài)性的SSR標(biāo)記。??為了得到涵蓋水稻12條染色體長臂短臂上的SSR標(biāo)記,從GRAMENE數(shù)據(jù)庫??(http:?//www.gramene.org/)和?RAP?數(shù)據(jù)庫(http:?//rapdb.dna.affrc.go.jp/index.htmL)補(bǔ)??充7個(gè)SSR標(biāo)記:位于第2號染色體上的RM5707、RM5897,位于第3號染色體上的??RM231、RM168,位于第7號染色體上的RM481,位于第8號染色體上的RM152,位??于第9號染色體上RM105。結(jié)果如
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]高通量轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)在植物雄性不育研究中的應(yīng)用[J]. 劉永明,張玲,邱濤,趙卓凡,曹墨菊. 遺傳. 2016(08)
[2]測序技術(shù)的研究進(jìn)展及三代測序的應(yīng)用[J]. 烏日拉嘎,徐海燕,馮淑貞,孫志宏,孟和畢力格,張和平. 中國乳品工業(yè). 2016(04)
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[4]第三代測序基本原理[J]. 李明爽,趙敏. 現(xiàn)代生物醫(yī)學(xué)進(jìn)展. 2012(10)
[5]Fine mapping and candidate gene prediction of the photoperiod and thermo-sensitive genic male sterile gene pms1(t) in rice[J]. Yuan-fei ZHOU,Xian-yin ZHANG,Qing-zhong XUE (Department of Agronomy,College of Agriculture and Biotechnology,Zhejiang University,Hangzhou 310029,China). Journal of Zhejiang University-Science B(Biomedicine & Biotechnology). 2011(06)
[6]光溫敏核不育水稻的研究進(jìn)展[J]. 陳云風(fēng). 宜春學(xué)院學(xué)報(bào). 2010(08)
[7]水稻光溫敏雄性核不育系廣占63S不育基因PTGMS2-1的遺傳分析與分子定位[J]. 王寶和,徐建軍,吳銀慧,朱金燕,李生強(qiáng),周勇,程小濤,梁國華. 中國水稻科學(xué). 2010(04)
[8]SNP標(biāo)記技術(shù)及其在農(nóng)作物育種中的應(yīng)用[J]. 李兆波,吳禹,王巖,汪由,王光霞. 遼寧農(nóng)業(yè)職業(yè)技術(shù)學(xué)院學(xué)報(bào). 2010(03)
[9]水稻光溫敏核不育機(jī)理設(shè)想及光溫敏核不育系選育策略[J]. 陳立云,肖應(yīng)輝. 中國水稻科學(xué). 2010(02)
[10]ISSR分子標(biāo)記技術(shù)在植物種質(zhì)資源研究中的應(yīng)用[J]. 朱巖芳,祝水金,李永平,馬文廣,鄭昀曄,胡晉. 種子. 2010(02)
博士論文
[1]白背飛虱基因組測序及其受南方水稻黑條矮縮病毒侵染的轉(zhuǎn)錄組分析[D]. 唐楠.中國科學(xué)技術(shù)大學(xué) 2017
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[4]利用高通量測序技術(shù)研究基因組復(fù)制與關(guān)系以及可變剪切[D]. 王海峰.復(fù)旦大學(xué) 2014
[5]水稻光溫敏核雄性不育遺傳及基因定位研究[D]. 周元飛.浙江大學(xué) 2007
碩士論文
[1]基于HRM技術(shù)的水稻全基因組SNP標(biāo)記開發(fā)及其初步應(yīng)用[D]. 郭海洋.華南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[2]水稻光溫敏核不育綿9S的遺傳分析與基因定位[D]. 趙敏會(huì).四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
[3]水稻野栽遠(yuǎn)源雜交來源的溫敏核雄性不育基因tms7的精細(xì)定位[D]. 鄒丹妮.海南大學(xué) 2011
[4]利用SSR分子標(biāo)記定位水稻短光敏雄性不育基因[D]. 馬棟.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010
[5]水稻雄性不育系和保持系花培的比較研究[D]. 張保蘭.西南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2003
[6]光敏核不育水稻基因pms1物理圖譜的構(gòu)建及候選基因的確定[D]. 劉南.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2000
本文編號:3367432
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