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甘薯SPW5基因克

發(fā)布時(shí)間:2021-08-24 23:05
  近年來,由于生產(chǎn)水平的提高和農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)結(jié)構(gòu)的優(yōu)化,以及人們膳食結(jié)構(gòu)的調(diào)整,甘薯(Ipomoea batatas L.)作為重要的糧食、飼料、工業(yè)原料及新能源,種植的面積日益加大,人們對(duì)甘薯的需求也日益增高。甘薯是一種無性繁殖作物,極易在代代繁殖中累積病毒,從而導(dǎo)致產(chǎn)量大減,品質(zhì)變差。深入研究甘薯抗病機(jī)制,可以為甘薯的優(yōu)質(zhì)育種提供依據(jù)。本實(shí)驗(yàn)室前期通過轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析,篩選出一些與甘薯抗病毒病相關(guān)的基因,其中包括SPW5基因。本研究從甘薯品種徐薯22中克隆出了SPW5基因,并對(duì)其核苷酸序列進(jìn)行了分析,證明SPW5屬于WRKY轉(zhuǎn)錄因子,成功構(gòu)建了該基因過表達(dá)載體SPW5-p101-GV3101。對(duì)甘薯的再生體系進(jìn)行了探索:以無菌試管苗為材料,分別將4個(gè)甘薯品種的莖尖、葉片、葉柄、側(cè)芽作為外植體建立再生體系,并對(duì)離體再生培養(yǎng)基進(jìn)行了優(yōu)化,成功誘導(dǎo)出愈傷組織,并進(jìn)行懸浮培養(yǎng),成功誘導(dǎo)出體細(xì)胞胚。并且對(duì)農(nóng)桿菌介導(dǎo)的SPW5基因表達(dá)載體遺傳轉(zhuǎn)化體系進(jìn)行了探索。主要研究結(jié)果如下:1.基因克隆及載體構(gòu)建:根據(jù)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序得到的序列設(shè)計(jì)SPW5基因引物,從甘薯品種徐薯22中克隆了SPW5基因CDS序列。然后利... 

【文章來源】:西南大學(xué)重慶市 211工程院校 教育部直屬院校

【文章頁(yè)數(shù)】:73 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

甘薯SPW5基因克


WRKY轉(zhuǎn)錄因子參與植物逆境脅迫應(yīng)答作用模式圖

序列,基因克隆


第 2 章 甘薯 SPW5 基因克隆及生物信息學(xué)分析設(shè)計(jì),正向引物和反向引物分別是 F:5’-cgcagcagcccagccaagaaagatatatga-3’,R3’-atggagaacaaatttgatgacctcatcat-5’,預(yù)計(jì)克隆的基因片段為 1182bp,PCR 擴(kuò)增產(chǎn)進(jìn)行 1%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)(圖 2-1a),擴(kuò)增后產(chǎn)物連接 TOPO-pENTR 載體,轉(zhuǎn)大腸桿菌感受態(tài) DH5 ,涂 LB+Kan 抗性平板,37°C 培養(yǎng) 13-16h 出現(xiàn)單菌落,擇 12 個(gè)單菌落在 LB+Kan 液體培養(yǎng)基中搖菌,200r/min 過夜培養(yǎng),然后采用擴(kuò)引物進(jìn)行 PCR 檢測(cè)(圖 2-1b)并送測(cè)序。電泳檢測(cè)與目的片段大小相同,測(cè)序結(jié)序列與目的序列對(duì)比相同,則表明成功克隆了該基因。

氨基酸序列,氨基酸序列,氨基酸,理化性質(zhì)


18圖 2-2 SPW5 氨基酸序列Figure 2-2 Amino acid sequence of SPW5紅色方框表示 WRKY 基序2.4.2.2 氨基酸的預(yù)測(cè)分析(1)氨基酸理化性質(zhì)的分析:將甘薯 SPW5 的氨基酸序列輸入 Expasy 網(wǎng)站中進(jìn)行預(yù)測(cè)其理化性質(zhì),結(jié)果表明 SPW5 基因編碼的蛋白質(zhì)分子量為 43301.21Da;分子式為 C1896H2963N527O613S11,原子總數(shù)為 6010;等電點(diǎn) pI 為 6.36,共編碼 393 個(gè)氨基酸;其中帶負(fù)電荷的殘基總數(shù)(Asp + Glu)為 41;帶正電荷的殘基總數(shù)(Arg + Lys)

【參考文獻(xiàn)】:
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博士論文
[1]納米甘薯渣纖維素降血糖血脂的功效及其分子機(jī)理的研究[D]. 陸紅佳.西南大學(xué) 2015
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碩士論文
[1]特異表達(dá)甘薯蔗糖轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白基因IbSUT對(duì)煙草淀粉合成的影響[D]. 李倩.電子科技大學(xué) 2014



本文編號(hào):3360895

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