甘薯SPW5基因克
發(fā)布時(shí)間:2021-08-24 23:05
近年來,由于生產(chǎn)水平的提高和農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)結(jié)構(gòu)的優(yōu)化,以及人們膳食結(jié)構(gòu)的調(diào)整,甘薯(Ipomoea batatas L.)作為重要的糧食、飼料、工業(yè)原料及新能源,種植的面積日益加大,人們對(duì)甘薯的需求也日益增高。甘薯是一種無性繁殖作物,極易在代代繁殖中累積病毒,從而導(dǎo)致產(chǎn)量大減,品質(zhì)變差。深入研究甘薯抗病機(jī)制,可以為甘薯的優(yōu)質(zhì)育種提供依據(jù)。本實(shí)驗(yàn)室前期通過轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析,篩選出一些與甘薯抗病毒病相關(guān)的基因,其中包括SPW5基因。本研究從甘薯品種徐薯22中克隆出了SPW5基因,并對(duì)其核苷酸序列進(jìn)行了分析,證明SPW5屬于WRKY轉(zhuǎn)錄因子,成功構(gòu)建了該基因過表達(dá)載體SPW5-p101-GV3101。對(duì)甘薯的再生體系進(jìn)行了探索:以無菌試管苗為材料,分別將4個(gè)甘薯品種的莖尖、葉片、葉柄、側(cè)芽作為外植體建立再生體系,并對(duì)離體再生培養(yǎng)基進(jìn)行了優(yōu)化,成功誘導(dǎo)出愈傷組織,并進(jìn)行懸浮培養(yǎng),成功誘導(dǎo)出體細(xì)胞胚。并且對(duì)農(nóng)桿菌介導(dǎo)的SPW5基因表達(dá)載體遺傳轉(zhuǎn)化體系進(jìn)行了探索。主要研究結(jié)果如下:1.基因克隆及載體構(gòu)建:根據(jù)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序得到的序列設(shè)計(jì)SPW5基因引物,從甘薯品種徐薯22中克隆了SPW5基因CDS序列。然后利...
【文章來源】:西南大學(xué)重慶市 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:73 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
WRKY轉(zhuǎn)錄因子參與植物逆境脅迫應(yīng)答作用模式圖
第 2 章 甘薯 SPW5 基因克隆及生物信息學(xué)分析設(shè)計(jì),正向引物和反向引物分別是 F:5’-cgcagcagcccagccaagaaagatatatga-3’,R3’-atggagaacaaatttgatgacctcatcat-5’,預(yù)計(jì)克隆的基因片段為 1182bp,PCR 擴(kuò)增產(chǎn)進(jìn)行 1%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)(圖 2-1a),擴(kuò)增后產(chǎn)物連接 TOPO-pENTR 載體,轉(zhuǎn)大腸桿菌感受態(tài) DH5 ,涂 LB+Kan 抗性平板,37°C 培養(yǎng) 13-16h 出現(xiàn)單菌落,擇 12 個(gè)單菌落在 LB+Kan 液體培養(yǎng)基中搖菌,200r/min 過夜培養(yǎng),然后采用擴(kuò)引物進(jìn)行 PCR 檢測(cè)(圖 2-1b)并送測(cè)序。電泳檢測(cè)與目的片段大小相同,測(cè)序結(jié)序列與目的序列對(duì)比相同,則表明成功克隆了該基因。
18圖 2-2 SPW5 氨基酸序列Figure 2-2 Amino acid sequence of SPW5紅色方框表示 WRKY 基序2.4.2.2 氨基酸的預(yù)測(cè)分析(1)氨基酸理化性質(zhì)的分析:將甘薯 SPW5 的氨基酸序列輸入 Expasy 網(wǎng)站中進(jìn)行預(yù)測(cè)其理化性質(zhì),結(jié)果表明 SPW5 基因編碼的蛋白質(zhì)分子量為 43301.21Da;分子式為 C1896H2963N527O613S11,原子總數(shù)為 6010;等電點(diǎn) pI 為 6.36,共編碼 393 個(gè)氨基酸;其中帶負(fù)電荷的殘基總數(shù)(Asp + Glu)為 41;帶正電荷的殘基總數(shù)(Arg + Lys)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]Micro-Tom番茄轉(zhuǎn)基因植株再生體系的優(yōu)化[J]. 邱實(shí),張文舉,許馥慧,鄧志瑞. 上海大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2018(02)
[2]病原菌誘發(fā)的植物先天免疫研究進(jìn)展[J]. 嚴(yán)霞,牛曉磊,陶均. 分子植物育種. 2018(03)
[3]甘薯莖腐病癥狀及其病原鑒定[J]. 沈肖玲,林釵,錢俊婷,仇智靈,陳江彬,孫超,易建平,樓兵干. 植物病理學(xué)報(bào). 2018(01)
[4]AtSARK關(guān)鍵自磷酸化位點(diǎn)Tyr-350的點(diǎn)突變及其功能分析[J]. 龔雅茹,郭朝霞,王丹,梅圓圓,王寧寧. 植物生理學(xué)報(bào). 2017(01)
[5]玉米PDE191基因全長(zhǎng)cDNA的克隆及其生物信息學(xué)分析[J]. 熊偉,劉久東,楊飛,孫美濤,張海洋. 井岡山大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2016(05)
[6]重慶市甘薯病毒病種類及為害[J]. 羅勇,傅玉凡,曾令玲,魏文均. 植物醫(yī)生. 2015(06)
[7]甘薯抗病基因的相關(guān)研究[J]. 趙琳,詹生華. 農(nóng)業(yè)科技通訊. 2015(11)
[8]甘薯病毒病[J]. 黃艷嵐. 湖南農(nóng)業(yè). 2015(11)
[9]甘薯懸浮細(xì)胞系的建立及對(duì)抗草甘膦基因的遺傳轉(zhuǎn)化[J]. 張聰,蒲志剛,張婷,李明,屈會(huì)娟,譚文芳,楊松濤,王大一,閻文昭. 西南農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2015(01)
[10]甘薯新品種吉徐薯2號(hào)的選育及栽培技術(shù)[J]. 王鳳,劉峰,王忠偉,王洋,張海,李闖. 遼寧農(nóng)業(yè)科學(xué). 2014(05)
博士論文
[1]納米甘薯渣纖維素降血糖血脂的功效及其分子機(jī)理的研究[D]. 陸紅佳.西南大學(xué) 2015
[2]基于發(fā)根體系的甘薯莖線蟲病研究及甘薯遺傳轉(zhuǎn)化體系建立[D]. 阮龍.安徽農(nóng)業(yè)大學(xué) 2007
碩士論文
[1]特異表達(dá)甘薯蔗糖轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白基因IbSUT對(duì)煙草淀粉合成的影響[D]. 李倩.電子科技大學(xué) 2014
本文編號(hào):3360895
【文章來源】:西南大學(xué)重慶市 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:73 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
WRKY轉(zhuǎn)錄因子參與植物逆境脅迫應(yīng)答作用模式圖
第 2 章 甘薯 SPW5 基因克隆及生物信息學(xué)分析設(shè)計(jì),正向引物和反向引物分別是 F:5’-cgcagcagcccagccaagaaagatatatga-3’,R3’-atggagaacaaatttgatgacctcatcat-5’,預(yù)計(jì)克隆的基因片段為 1182bp,PCR 擴(kuò)增產(chǎn)進(jìn)行 1%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)(圖 2-1a),擴(kuò)增后產(chǎn)物連接 TOPO-pENTR 載體,轉(zhuǎn)大腸桿菌感受態(tài) DH5 ,涂 LB+Kan 抗性平板,37°C 培養(yǎng) 13-16h 出現(xiàn)單菌落,擇 12 個(gè)單菌落在 LB+Kan 液體培養(yǎng)基中搖菌,200r/min 過夜培養(yǎng),然后采用擴(kuò)引物進(jìn)行 PCR 檢測(cè)(圖 2-1b)并送測(cè)序。電泳檢測(cè)與目的片段大小相同,測(cè)序結(jié)序列與目的序列對(duì)比相同,則表明成功克隆了該基因。
18圖 2-2 SPW5 氨基酸序列Figure 2-2 Amino acid sequence of SPW5紅色方框表示 WRKY 基序2.4.2.2 氨基酸的預(yù)測(cè)分析(1)氨基酸理化性質(zhì)的分析:將甘薯 SPW5 的氨基酸序列輸入 Expasy 網(wǎng)站中進(jìn)行預(yù)測(cè)其理化性質(zhì),結(jié)果表明 SPW5 基因編碼的蛋白質(zhì)分子量為 43301.21Da;分子式為 C1896H2963N527O613S11,原子總數(shù)為 6010;等電點(diǎn) pI 為 6.36,共編碼 393 個(gè)氨基酸;其中帶負(fù)電荷的殘基總數(shù)(Asp + Glu)為 41;帶正電荷的殘基總數(shù)(Arg + Lys)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]Micro-Tom番茄轉(zhuǎn)基因植株再生體系的優(yōu)化[J]. 邱實(shí),張文舉,許馥慧,鄧志瑞. 上海大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2018(02)
[2]病原菌誘發(fā)的植物先天免疫研究進(jìn)展[J]. 嚴(yán)霞,牛曉磊,陶均. 分子植物育種. 2018(03)
[3]甘薯莖腐病癥狀及其病原鑒定[J]. 沈肖玲,林釵,錢俊婷,仇智靈,陳江彬,孫超,易建平,樓兵干. 植物病理學(xué)報(bào). 2018(01)
[4]AtSARK關(guān)鍵自磷酸化位點(diǎn)Tyr-350的點(diǎn)突變及其功能分析[J]. 龔雅茹,郭朝霞,王丹,梅圓圓,王寧寧. 植物生理學(xué)報(bào). 2017(01)
[5]玉米PDE191基因全長(zhǎng)cDNA的克隆及其生物信息學(xué)分析[J]. 熊偉,劉久東,楊飛,孫美濤,張海洋. 井岡山大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2016(05)
[6]重慶市甘薯病毒病種類及為害[J]. 羅勇,傅玉凡,曾令玲,魏文均. 植物醫(yī)生. 2015(06)
[7]甘薯抗病基因的相關(guān)研究[J]. 趙琳,詹生華. 農(nóng)業(yè)科技通訊. 2015(11)
[8]甘薯病毒病[J]. 黃艷嵐. 湖南農(nóng)業(yè). 2015(11)
[9]甘薯懸浮細(xì)胞系的建立及對(duì)抗草甘膦基因的遺傳轉(zhuǎn)化[J]. 張聰,蒲志剛,張婷,李明,屈會(huì)娟,譚文芳,楊松濤,王大一,閻文昭. 西南農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2015(01)
[10]甘薯新品種吉徐薯2號(hào)的選育及栽培技術(shù)[J]. 王鳳,劉峰,王忠偉,王洋,張海,李闖. 遼寧農(nóng)業(yè)科學(xué). 2014(05)
博士論文
[1]納米甘薯渣纖維素降血糖血脂的功效及其分子機(jī)理的研究[D]. 陸紅佳.西南大學(xué) 2015
[2]基于發(fā)根體系的甘薯莖線蟲病研究及甘薯遺傳轉(zhuǎn)化體系建立[D]. 阮龍.安徽農(nóng)業(yè)大學(xué) 2007
碩士論文
[1]特異表達(dá)甘薯蔗糖轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白基因IbSUT對(duì)煙草淀粉合成的影響[D]. 李倩.電子科技大學(xué) 2014
本文編號(hào):3360895
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