松墨天牛是松材線蟲病的主要傳播媒介。利用病原微生物和寄生性天敵防治松墨天牛已是生產(chǎn)實踐中常用的手段。然而,對于松墨天牛幼蟲不同齡期的轉(zhuǎn)錄組信息仍知之甚少,阻礙了松墨天牛分子生物學(xué)研究的進(jìn)一步深入和生物防治新技術(shù)的開發(fā)。本文利用第三代測序技術(shù),測定了 1齡-4齡松墨天牛幼蟲的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)。在轉(zhuǎn)錄組中挖掘出了殺蟲劑抗性相關(guān)基因、RNAi、Bt受體、腸道消化酶、潛在昆蟲靶標(biāo)、免疫相關(guān)分子、木質(zhì)纖維素和嗅覺基因家族等相關(guān)基因,構(gòu)建了腸道消化酶、木質(zhì)纖維素和嗅覺基因家族的系統(tǒng)進(jìn)化樹。最后,分析了腸道消化酶的基因差異表達(dá),并篩選出穩(wěn)定表達(dá)的腸道消化酶進(jìn)行生物信息學(xué)分析。本研究篩選出了大量與生物防治相關(guān)的基因,并獲得了穩(wěn)定表達(dá)的腸道消化酶,為后期開發(fā)新的分子工具和生物防治技術(shù)奠定了理論基礎(chǔ)。 

【文章來源】：福建農(nóng)林大學(xué)福建省

【文章頁數(shù)】：68 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖１功能基因長度分布（Ｙ軸數(shù)值已被轉(zhuǎn)換成對數(shù)比例）??３．２預(yù)測蛋白質(zhì)的注釋??

注釋的ｕｎｉｇｅｎｅｓ有４０，?９４３個，Ｅ值分布顯示５６．１４％的比對序列與其他物種具有??較強的同源性（小于１．（＾％），４３．８６％的序列同源性介于１．０￡＿５至１．｛＾４９之??間（圖２Ａ）。以Ｅ值最小的結(jié)果為準(zhǔn)，松墨天牛分別有４７．?７７％和１３．?８２％的序??列與同屬銷翅目（Ｃｏｌｅｏｐｔｅｒａｎ）的赤擬谷盜（７＞／６〇／／膽ａｗ／ｃ／ｒｔｅｗｍ）和中歐山松??大小蠹如７Ｗ５７；ｗ？ｃ／ｅｍｒａ￡〇具有同源性，而比對到其他昆蟲的序列所占比??例少于２３％?（圖２）。??如圖２所不，Ａ中每個獨特序列的ＢＬＡＳＴ命中率的Ｅ值分布的截止Ｅ值為??１－０Ｅ－５；?Ｂ表示ＢＬＡＳＴＸ結(jié)果的物種分布。每個序列的第一個命中被用于進(jìn)一步??的計算機分析。??１０??

?結(jié)果與分析???部分與質(zhì)體和線粒體有關(guān)的基因治分子功能類別中，基因主要聚集在結(jié)合??（ｂｉｎｄｉｎｇ）?（４２．?００％）和催化活性（ｃａｔａｌｙｔｉｃ?ａｃｔｉｖｉｔｙ）?（３９．?６２％）；另夕卜也有??基因與轉(zhuǎn)運蛋白活性（ｔｒａｎｓｐｏｒｔｅｒ?ａｃｔｉｖｉｔｙ）?（５．?２１％）和結(jié)構(gòu)分子活性（ｓｔｒｕｃｔｕｒａｌ??ｍｏｌｅｃｕｌｅ?ａｃｔｉｖｉｔｙ）?（２．７８％）等有關(guān)。在云南切梢小蠢的轉(zhuǎn)錄組研究中也報道了??相似的涉及新陳代謝過程的基因分類。綜上，ＧＯ注釋描述了松墨天�；虮磉_(dá)??基因總體表達(dá)的特征，闡述了多種結(jié)構(gòu)蛋白，調(diào)節(jié)蛋白和應(yīng)激蛋白的表達(dá)基因。??圖３表示分配給松墨天牛轉(zhuǎn)錄組的ＧＯ類別的分布。功能基因被分為三類：??細(xì)胞組分、分子功能和生物過程。右ｙ軸表示一個類別中的基因數(shù)；左ｙ軸表示??特定基因的百分比。??ＧＯ?Ｃｌａｓｓｉｆｉｃａｔｉｏｎ??１Ｍ？??＇—：?＿?１?????—?２０２０９??

【參考文獻(xiàn)】：
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本文編號：3356340