發(fā)布時(shí)間：2021-08-18 18:25

　　該研究以擬南芥AtEIN3基因?yàn)樘结?從陸地棉TM-1全基因組測序數(shù)據(jù)庫中篩選其同源序列,序列分析得到16條具有EIN3結(jié)構(gòu)域的基因序列。對陸地棉EIN3/EIL家族基因的基因結(jié)構(gòu)、系統(tǒng)進(jìn)化、序列相似性及結(jié)構(gòu)域分布情況進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)它們與擬南芥EIN3/EIL家族基因在N端具有較高相似度,其中15條基因序列包含5個(gè)保守結(jié)構(gòu),1條包含4個(gè)保守結(jié)構(gòu)。在此基礎(chǔ)上,采用RT-PCR方法從抗枯萎病的陸地棉品種‘中棉所12’中克隆得到一個(gè)新的EIN3/EIL家族基因,命名為GhEIL3（GenBank登錄號為KY072936）。序列分析表明:GhEIL3基因開放閱讀框長1 092bp,編碼363個(gè)氨基酸,含有一個(gè)EIN3結(jié)構(gòu)域。實(shí)時(shí)熒光定量PCR（qRT-PCR）結(jié)果顯示,GhEIL3基因在枯萎病菌誘導(dǎo)后呈上調(diào)表達(dá),誘導(dǎo)后1h其相對表達(dá)量達(dá)到最大值,推測GhEIL3基因可能參與棉花對枯萎病菌的防御反應(yīng)。 

【文章來源】：西北植物學(xué)報(bào). 2017,37(03)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：8 頁

【文章目錄】：
1材料和方法
    1.1實(shí)驗(yàn)材料
    1.2方法
        1.2.1棉花EIN3/EIL基因家族生物信息學(xué)分析
        1.2.2棉花根部總RNA提取及cDNA合成
        1.2.3 GhEIL3基因克隆及序列分析
        1.2.4實(shí)時(shí)熒光定量PCR
2結(jié)果與分析
    2.1棉花EIN3/EIL基因家族生物信息學(xué)分析
        2.1.1棉花EIN3/EIL家族基因鑒定
        2.1.2擬南芥與棉花EIN3/EIL基因家族系統(tǒng)關(guān)系分析
        2.1.3棉花EIN3/EIL蛋白保守基序分析
        2.1.4擬南芥與棉花EIN3/EIL家族基因多序列比對
    2.2棉花GhEIL3基因克隆
    2.3棉花GhEIL3基因編碼蛋白分析及結(jié)構(gòu)預(yù)測
    2.4枯萎病菌誘導(dǎo)棉花GhEIL3表達(dá)模式分析
3討論


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]甜瓜EIN3/EILs基因家族全基因組鑒定與進(jìn)化分析[J]. 馬勇,莘少紅,巴德仁貴,哈斯阿古拉.  基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2014(01)
[2]一種新的棉花黃、枯萎病快速接種方法的研究[J]. 彭姍,呂學(xué)蓮,高峰,李國英,李暉.  棉花學(xué)報(bào). 2008(03)
[3]利用改良的CTAB法提取棉花葉片總RNA[J]. 胡根海,喻樹迅.  棉花學(xué)報(bào). 2007(01)
[4]反義LeEIL2基因表達(dá)載體的構(gòu)建及在番茄中的轉(zhuǎn)化[J]. 薛印革,朱本忠,薛萍,田慧琴,羅云波.  河南農(nóng)業(yè)科學(xué). 2003(10)

博士論文
[1]擬南芥中EIN3EIL1通過抑制SA信號途徑負(fù)調(diào)控植物的先天免疫反應(yīng)[D]. 陳華民.上海交通大學(xué) 2008

碩士論文
[1]大豆疫霉根腐病抗性相關(guān)基因EIN3-1、EIN3-2的克隆及功能初步研究[D]. 方東鵬.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014



本文編號：3350399