鰻草（Zostera marina）作為適應(yīng)在海洋環(huán)境中生長(zhǎng)和繁殖的多年生被子植物,是研究海洋高等植物分子進(jìn)化的理想物種。熱激轉(zhuǎn)錄因子（HSF）在植物細(xì)胞的修復(fù)、蛋白的轉(zhuǎn)錄修飾以及信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)中具有重要的作用。為全面了解鰻草基因組中HSF基因家族信息,本文采用生物信息學(xué)手段,在鰻草基因組中鑒定了11個(gè)ZmHSFs基因,基因長(zhǎng)度差異較大,但均不含有內(nèi)含子。系統(tǒng)發(fā)育結(jié)果顯示11個(gè)基因分為HSFA和HSFB兩大分支。順式作用元件分析表明ZmHSFs基因很可能同時(shí)受到溫度和光照等多種非生物因素的調(diào)節(jié)。此外,鰻草HSF基因家族數(shù)目明顯小于其他高等植物,二次入海過(guò)程可能導(dǎo)致部分ZmHSFs基因丟失。轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)表明HSF基因在3種不同器官中均有表達(dá),且存在一定的器官表達(dá)差異。 

【文章來(lái)源】：中國(guó)海洋大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2020,50(09)北大核心CSCD

【文章頁(yè)數(shù)】：10 頁(yè)

【部分圖文】：

鰻草HSF基因結(jié)構(gòu)示意圖

鰻草HSF蛋白保守基序分析

系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)分析結(jié)果顯示,HSF基因可以劃分為兩大分支,其中HSFB基因組成一支,HSFA和HSFC組成一支(見(jiàn)圖3)。其中,AtHSFC1與HSFA基因家族聚到一起,并未單獨(dú)聚為一支;鰻草各HSF基因與擬南芥和Z.muelleri各亞家族基因聚到一起;在各亞家族內(nèi)部,大部分鰻草HSF基因與ZmuHSF聚到一起,部分ZmuHSF與AtHSF聚到一起。2.4 鰻草HSF基因家族啟動(dòng)子順式作用元件分析


本文編號(hào)：3348789