鰻草（Zostera marina）作為適應在海洋環(huán)境中生長和繁殖的多年生被子植物,是研究海洋高等植物分子進化的理想物種。熱激轉錄因子（HSF）在植物細胞的修復、蛋白的轉錄修飾以及信號轉導中具有重要的作用。為全面了解鰻草基因組中HSF基因家族信息,本文采用生物信息學手段,在鰻草基因組中鑒定了11個ZmHSFs基因,基因長度差異較大,但均不含有內含子。系統發(fā)育結果顯示11個基因分為HSFA和HSFB兩大分支。順式作用元件分析表明ZmHSFs基因很可能同時受到溫度和光照等多種非生物因素的調節(jié)。此外,鰻草HSF基因家族數目明顯小于其他高等植物,二次入海過程可能導致部分ZmHSFs基因丟失。轉錄組數據表明HSF基因在3種不同器官中均有表達,且存在一定的器官表達差異。 

【文章來源】：中國海洋大學學報(自然科學版). 2020,50(09)北大核心CSCD

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【部分圖文】：

鰻草HSF基因結構示意圖

鰻草HSF蛋白保守基序分析

系統發(fā)育樹分析結果顯示,HSF基因可以劃分為兩大分支,其中HSFB基因組成一支,HSFA和HSFC組成一支(見圖3)。其中,AtHSFC1與HSFA基因家族聚到一起,并未單獨聚為一支;鰻草各HSF基因與擬南芥和Z.muelleri各亞家族基因聚到一起;在各亞家族內部,大部分鰻草HSF基因與ZmuHSF聚到一起,部分ZmuHSF與AtHSF聚到一起。2.4 鰻草HSF基因家族啟動子順式作用元件分析


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