【目的】通過對馬鈴薯StCDPKs基因家族成員的鑒定與表達(dá)模式分析,初步闡明該基因家族在馬鈴薯脅迫響應(yīng)中的功能.【方法】用隱馬爾科夫模型鑒定馬鈴薯StCDPKs基因家族成員,MEGA6.0構(gòu)建StCDPKs蛋白序列的系統(tǒng)進(jìn)化樹,qRT-PCR分析StCDPKs基因在組織特異性和鹽脅迫下的表達(dá)情況.【結(jié)果】本研究共鑒定出27個(gè)馬鈴薯StCDPKs基因家族成員,它們均包含CDPKs蛋白鈣離子結(jié)合域最保守的結(jié)構(gòu)域EF-hand;其中StCDPK2/421/22/25基因在馬鈴薯不同組織中表達(dá)差異顯著,StCDPK8/10/11/18/22基因在鹽脅迫下表達(dá)量明顯升高.【結(jié)論】共鑒定獲得27個(gè)馬鈴薯StCDPKs基因家族成員,其中StCDPK8/10/11/18/22基因與馬鈴薯響應(yīng)鹽脅迫相關(guān),研究結(jié)果可為進(jìn)一步闡明馬鈴薯StCDPKs基因的功能提供基礎(chǔ). 

【文章來源】：甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2020,55(05)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：11 頁

【部分圖文】：

25個(gè)StCDPKs基因的結(jié)構(gòu)(A)和Motif分布模式(B)

36個(gè)擬南芥、29個(gè)番茄和27個(gè)馬鈴薯CDPKs

用馬鈴薯數(shù)據(jù)庫PGSC中的RNA測序數(shù)據(jù)制作不同組織和不同脅迫下StCDPKs基因表達(dá)的可視化熱圖(圖3～4).結(jié)果顯示,StCDPK2基因在葉和葉柄中有較高的表達(dá)水平,果實(shí)和花中基本不表達(dá).StCDPK4基因在根、葉片、萼片、心皮中表達(dá)較高,在塊莖中表達(dá)較低,而在其他組織中有中等表達(dá)水平.StCDPK22基因在芽、葉柄、匍匐莖、心皮和未成熟果實(shí)中有較高的表達(dá)水平,而在花中有較低的表達(dá)水平.StCDPK25基因在塊莖和匍匐莖中表達(dá)較高,其余組織為中下表達(dá)水平.StCDPK13和23基因在成熟花中有較高表達(dá)水平,這表明馬鈴薯StCDPKs基因家族可能參與調(diào)控馬鈴薯的生長發(fā)育.StCDPK22基因在生物和非生物脅迫中的表達(dá)量高于其他基因,StCDPK2/4/6/21/25基因表現(xiàn)出較高的表達(dá)水平,而7個(gè)基因(StCDPK1/7/9/17/18/23/24)的表達(dá)水平偏低,其余的12個(gè)StCDPKs基因在不同脅迫中基本不表達(dá),這表明StCDPKs基因家族成員可能與馬鈴薯響應(yīng)各種應(yīng)激脅迫有關(guān).圖4 StCDPKs基因在不同處理下的表達(dá)模式

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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