發(fā)布時(shí)間：2021-08-14 15:54

　　線粒體磷酸轉(zhuǎn)運(yùn)體（mitochondrial phosphate transporter, MPT）基因家族是位于線粒體內(nèi)膜上的一種重要的功能蛋白,負(fù)責(zé)將重要代謝底物無機(jī)磷酸通過線粒體內(nèi)膜從細(xì)胞質(zhì)轉(zhuǎn)移到線粒體基質(zhì)中,在細(xì)胞維持正常功能中起到了關(guān)鍵的生理作用。本研究利用生物信息學(xué)工具,系統(tǒng)地分析了葡萄MPT基因家族成員的進(jìn)化關(guān)系、基因結(jié)構(gòu)、蛋白質(zhì)理化性質(zhì)和保守基序,以及組織特異性表達(dá)和同源基因的相關(guān)性。結(jié)果表明,葡萄全基因組中鑒定出64個(gè)MPT家族基因。根據(jù)系統(tǒng)發(fā)育樹可以分為7組,分布于19條染色體上,其中兩對基因存在串聯(lián)復(fù)制現(xiàn)象。保守基序分析表明,所有MPT家族成員都含有保守的Mito_carr結(jié)構(gòu)域。組織特異性表達(dá)表明,VvMPT基因在果皮、花、葉中高表達(dá)。同源基因分析表明,葡萄VvMPT基因家族可能在花器官發(fā)育、維持離子濃度中起到了重要作用。 

【文章來源】：浙江農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2020,32(12)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：13 頁

【部分圖文】：

MPT基因家族的進(jìn)化分析

葡萄和擬南芥的MPT基因家族同源性分析

基因名稱 標(biāo)簽/基因ID 氨基酸數(shù)量 蛋白質(zhì)分子質(zhì)量 理論等電位 親疏水性均值 亞細(xì)胞定位 Gene nameLocus Tag/Gene ID Number ofamino acids Molecularweight/u pI Gravy value Subcellularlocalization VvMPT54 VIT_216s0050g02360.1 413 44 954.75 9.60 -0.032 C,M VvMPT55 VIT_217s0000g00030.1 548 60 729.36 5.96 -0.208 C,N VvMPT56 VIT_217s0000g00400.1 366 39 178.85 9.32 0.247 E.R,G VvMPT57 VIT_217s0000g04970.1 310 34 472.99 9.87 0.039 M,C VvMPT58 VIT_217s0000g07290.1 327 35 814.88 8.91 -0.122 C,M VvMPT59 VIT_218s0001g05620.1 443 48 408.71 8.77 0.067 C,M VvMPT60 VIT_218s0001g07320.1 323 34 154.83 9.85 0.166 C VvMPT61 VIT_218s0122g00010.1 355 38 718.47 9.98 0.117 C,M VvMPT62 VIT_218s0157g00180.1 311 33 341.80 9.48 0.145 C,M VvMPT63 VIT_218s0166g00130.1 401 42 669.29 9.40 0.155 C,M VvMPT64 VIT_219s0177g00370.1 64 7 041.23 7.89 -0.013 M,C P，質(zhì)膜;C，細(xì)胞質(zhì);N，細(xì)胞核;E.R，內(nèi)質(zhì)網(wǎng);M，線粒體;CW，細(xì)胞壁;G，高爾基體。P,Plasma membrane;C,Cytosol;N,Nuclear;E.R,Endoplasmic reticulum;M,Mitochondrion;CW,Cell wall;G,Golgi apparatus.依據(jù)擬南芥AtMPT的分類標(biāo)準(zhǔn),稍作改動(dòng)后將MPT分為7組并用GroupⅠ-GroupⅦ 表示(圖2)[6]。由圖可將MPT基因分為7類,分別為Group Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ、Ⅴ、Ⅵ和Ⅶ。其中Group Ⅰ 有5個(gè)VvMPT基因,Group Ⅱ有10個(gè)VvMPT基因,GroupⅢ有7個(gè)VvMPT基因,Group Ⅳ有22個(gè)VvMPT基因,Group Ⅴ有3個(gè)VvMPT基因,Group Ⅵ有5個(gè)VvMPT基因,Group Ⅶ有11個(gè)VvMPT基因。在Group Ⅵ中只有擬南芥和葡萄家族基因,且包含兩對同源基因。

【參考文獻(xiàn)】：
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博士論文
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碩士論文
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本文編號：3342752