為研究高山植物水母雪蓮對強(qiáng)紫外輻射的分子適應(yīng)機(jī)制,采用RT-PCR結(jié)合RACE技術(shù)從水母雪蓮中克隆了參與調(diào)控花青素合成的相關(guān)基因（SmMYB1）,并采用hi-TAIL PCR方法擴(kuò)增了該基因的啟動(dòng)子序列。結(jié)果表明:（1）序列分析顯示,SmMYB1基因cDNA序列（GenBank登錄號MT188353）全長1 011 bp,編碼269個(gè)氨基酸,gDNA序列含有2個(gè)內(nèi)含子和3個(gè)外顯子。（2）生物信息學(xué)分析顯示,SmMYB1基因編碼蛋白和菊科MYB蛋白親緣關(guān)系最近,含有保守的[DE]Lx（2）[RK] x（3）Lx（6）Lx（3）R和ANDV兩個(gè)模體,屬于擬南芥MYB第六亞族。SmMYB1基因啟動(dòng)子（GenBank登錄號MT188354）全長1 407 bp,含有多個(gè)光響應(yīng)元件。（3）熒光定量分析發(fā)現(xiàn),SmMYB1基因在根、莖、葉和花中均表達(dá),且在花中的表達(dá)量最高;在紫外脅迫下,SmMYB1基因的表達(dá)量在4 h達(dá)到最高,隨后逐漸降低。研究推測SmMYB1基因可能參與調(diào)控水母雪蓮花青素的合成以及對紫外輻射的響應(yīng)過程。 

【文章來源】：西北植物學(xué)報(bào). 2020,40(11)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：7 頁

【部分圖文】：

SmMYB1基因的克隆

通過hiTAIL-PCR的辦法擴(kuò)增出1 407 bp(圖1)的SmMYB1啟動(dòng)子序列(GenBank登錄號為MT188354),與該基因mRNA的5′-UTR序列一致。PlantCREA在線預(yù)測均發(fā)現(xiàn)在啟動(dòng)子區(qū)域有大量光響應(yīng)元件(AE-box、Box 4、G-Box和I-box),另外還存在應(yīng)答低氧(ARE)、脫落酸(ABRE)、干旱(MBS)、病原菌(AT-rich sequence)等順式作用元件(表2)。推測SmMYB1基因的表達(dá)主要受到了光信號的誘導(dǎo)。圖3 菊科第六亞族MYB蛋白多序列比對

圖2 不同物種MYB蛋白的進(jìn)化關(guān)系分析表2 SmMYB1啟動(dòng)子中的順式元件Table 2 The cis-acting elements in the SmMYB1 promoter 元件Element 功能Function 位置Position 序列Sequence 光應(yīng)答 Light responsiveness AE-box 部分光應(yīng)答組件 Part of a module for light response 485(+)、857(+) AGAAACAA I-box 部分光應(yīng)答元件 Part of a light responsive element 820(-) CCATATCCAAT Box 4 部分光應(yīng)答保守DNA組件 Part of a conserved DNA module involved in light responsiveness 1069(-)、1131(-) ATTAAT G-Box 光應(yīng)答順式作用元件 Cis-acting regulatory element involved in light responsiveness 1191(-)、1222(-)、1343(-) CACGTT/CACGTG/TACGTG 其他脅迫應(yīng)答和發(fā)育相關(guān)Other stress response and development-related ARE 低氧誘導(dǎo)必需的順式作用元件 Cis-acting regulatory element essential for the anaerobic induction 198(-)、503(+)、1333(+) AAACCA ABRE 脫落酸相應(yīng)順式作用元件 Cis-acting element involved in the abscisic acid responsiveness 1192(+)、1222(-)、1344(+) ACGTG MBS 干旱誘導(dǎo)MYB結(jié)合位點(diǎn) MYB binding site involved in drought-inducibility 223(+) CAACTG AT-rich sequence 植物病原菌防御反應(yīng) Cis-acting regulatory element related to pathogen response 1112(-) TAAAATACT AT-rich element 富集AT的DNA結(jié)合蛋白(ATBP-1)作用元件 Binding site of AT-rich DNA binding protein (ATBP-1) 559(+)、619(+)、679(+) ATAGAAATCAA CAT-box 分生組織相關(guān) Cis-acting regulatory element related to meristem expression 176(+)、1024(-) GCCACT

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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本文編號：3333446