沙柳SpsLAS2、SpsLAS3基因的克
發(fā)布時(shí)間:2021-08-07 06:39
分生組織的發(fā)育會(huì)影響植物的形態(tài)建成,而植株形態(tài)會(huì)極大影響園林植物的群落配置與景觀效果。為促進(jìn)沙柳(Salixpsammophila)的分子定向育種,研究其基因調(diào)控機(jī)理,本研究利用同源克隆技術(shù)克隆獲得沙柳SpsLAS2、SpsLAS3基因并做生物信息學(xué)及組織特異性表達(dá)分析,構(gòu)建35s::SpsLAS2與35s::SpsLAS3超量表達(dá)載體。通過(guò)Sitefinding-PCR技術(shù)克隆SpsLAS2基因的5’調(diào)控區(qū)序列片段并做序列分析。具體研究結(jié)果如下:1.通過(guò)同源克隆技術(shù)獲得沙柳SpLAS2與SpsLAS3基因的CDS序列,研究發(fā)現(xiàn)SpsLAS2和SpsLAS3基因序列相似性達(dá)96.69%,氨基酸序列相似性達(dá)97.6%。SpsLAS2和SpsLAS3基因ORF長(zhǎng)分別為1248、1254 bp,分別編碼415和417個(gè)氨基酸殘基。其氨基酸序列具有 GRS(GIBBERELLIN-INSENSITIVE,REPRESSOR of ga1-3,SCARECROW)基因家族典型的五個(gè)結(jié)構(gòu)域[1],屬LS亞家族。2.同源蛋白序列比對(duì)與系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)構(gòu)建表明,沙柳SpsLAS2、SpsLAS3蛋白序列與歐...
【文章來(lái)源】:內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)內(nèi)蒙古自治區(qū)
【文章頁(yè)數(shù)】:75 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
圖1?GARS蛋白分子結(jié)構(gòu)[62]??6
Bolle[66]等對(duì)模式植物擬南芥和水稻的基因家族進(jìn)行進(jìn)化分析,將G兄45??基因家族劃分為8?jìng)(gè)亞家族:L/SCX、別77、SCi3、Z)£XZ^、Sd?*S7/i?、i^和/MM??(如圖2)。他^^[67]等通過(guò)進(jìn)化樹(shù)分析將0反八3基因家族分為13個(gè)亞家族乂_77、??AtSCL4/7、AtSCL9、AtSHR、HAM、AtLAS、AtSCR、A-tSCL3、AtSCL28、DELLA、??尸d?OM和付。其研究結(jié)果表明不同植物中基因家族序列存在高度相??似性,這表明該家族在植物中可能是通過(guò)串聯(lián)復(fù)制產(chǎn)生重復(fù)基因而進(jìn)行進(jìn)化的。由??于序列高度保守,同一亞家族成員在功能上也具有相似性或相關(guān)性。??—r?纖"dim念{5】於??一―—二…?,^?1?■歲?At?????????????......-p::=z:rr:??r-———?& ̄crrz?it?SS??'?{?4??i*獅哪料.:p雄.*貧??一卿—一?n£^cr=??r———————屬|£??'1.…—I?^?jrUI--czzz??l ̄n?r??tm??i^czr:念雜??Mg^jLJk?緣?I?l…..-???…'『一一<?麵務(wù)??-?1?.“、>?、—??L....,,,,...,.,^WOa-^??-.一一一...???一r°—??"?***??〇?#???—??^P1'??f__纖^^娘??xmuu^一????^,r-^C:?-::?:?SS??瞻?L??i?「 ̄?M=nSsi??—?*? ̄7==m
采用?Thermo?Fisher?公司生產(chǎn)的?GeneJET?Plant?RNA?Purification?Kit?試劑盒進(jìn)行??沙柳總RNA的提取。采用紫外分光光度計(jì)進(jìn)行濃度檢測(cè),濃度為2778?ng/pl電泳結(jié)??果顯示28?s條帶亮度約是18?s處的兩倍(如圖3),說(shuō)明RNA提取質(zhì)量較好。??1??28s—i,??18s—??—??圖3沙柳總RNA電泳圖??Fig.3?Total?RNA?electrophoretogram?of?Salix?psammophila??3.?1.2設(shè)計(jì)及測(cè)試引物結(jié)果??提取沙柳全株RNA并進(jìn)行cDNA第一鏈的合成,以cDNA第一鏈為模板,利??用所設(shè)計(jì)的5’端UTR區(qū)引物與3'端UTR區(qū)引物,在20?|il?Pfu高保真酶體系下進(jìn)行??PCR的擴(kuò)增,得到目標(biāo)條帶,利用Trans2K?DNA?Marker進(jìn)行長(zhǎng)度判斷,目標(biāo)條帶??為預(yù)估約為1500?bp左右,實(shí)際亮度條帶在1000?bp與2000?bp之間,約為1500?bp??符合預(yù)估條件(如圖4)。??M?1??2?ooob?p??滅_??圖4目標(biāo)基因擴(kuò)增電泳檢測(cè)??Fig.?4?Electrofhoresis?pattern?of?target?gene??
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]興安落葉松UDP焦磷酸化酶基因啟動(dòng)子的克隆及雙元載體的構(gòu)建[J]. 梅麗麗,郭鑫,張堯,林曉飛,張文波. 分子植物育種. 2018(22)
[2]沙柳SpsLAS基因超表達(dá)對(duì)擬南芥營(yíng)養(yǎng)生長(zhǎng)的影響[J]. 張磊,路東曄,張國(guó)盛,楊海峰. 西北植物學(xué)報(bào). 2018(02)
[3]植物TCP轉(zhuǎn)錄因子的作用機(jī)理及其應(yīng)用研究進(jìn)展[J]. 馮志娟,徐盛春,劉娜,張古文,胡齊贊,龔亞明. 植物遺傳資源學(xué)報(bào). 2018(01)
[4]北沙柳種質(zhì)資源居群表型多樣性[J]. 郝蕾,張國(guó)盛,穆喜云,韓勝利,王穎,寧瑞些,白玉榮,張磊. 西北植物學(xué)報(bào). 2017(05)
[5]沙柳SpsLAZY1a和SpsLAZY1b基因克隆及生物信息學(xué)分析[J]. 張磊,葉志瑋,趙晨曦,張國(guó)盛,楊海峰. 西北林學(xué)院學(xué)報(bào). 2017(01)
[6]沙柳PNY基因克隆、生物信息學(xué)及組織特異性表達(dá)[J]. 楊海峰,王文娟,劉樂(lè),卜松雪,張雅喃,何麗君. 東北林業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2017(01)
[7]沙柳SpsLAS基因克隆及生物信息學(xué)分析[J]. 路東曄,賀玉嬌,金娜,劉樂(lè),卜松雪,王雷,楊海峰. 分子植物育種. 2017(02)
[8]沙柳組培技術(shù)初探[J]. 敖敦,楊海峰,王雷,馬月林. 福建林業(yè)科技. 2016(01)
[9]毛烏素沙地人工沙柳(Salix psammophila)林平茬復(fù)壯技術(shù)[J]. 海龍,王曉江,張文軍,張雷,洪光宇,李卓凡. 中國(guó)沙漠. 2016(01)
[10]Cd脅迫對(duì)水稻生長(zhǎng)及內(nèi)源激素含量的影響[J]. 游來(lái)勇,王昌全,羅娟,李冰,曾建. 生態(tài)環(huán)境學(xué)報(bào). 2015(05)
博士論文
[1]簸箕柳基因組測(cè)序及功能基因研究[D]. 戴曉港.南京林業(yè)大學(xué) 2017
[2]楊柳分化及其性別決定的基因組學(xué)基礎(chǔ)[D]. 侯靜.南京林業(yè)大學(xué) 2016
[3]煙草腋芽發(fā)育相關(guān)基因的克隆與功能分析[D]. 陳雅瓊.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2015
[4]楊樹(shù)miRNA基因家族進(jìn)化與靶基因研究[D]. 劉志祥.中南林業(yè)科技大學(xué) 2013
[5]楊柳木材纖維增強(qiáng)沙柳材中密度纖維板基礎(chǔ)理論與關(guān)鍵技術(shù)研究[D]. 李奇.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
[6]沙柳沙障腐蝕過(guò)程及防腐抗蝕效果研究[D]. 龔萍.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
[7]北沙柳種質(zhì)資源的多樣性分析與優(yōu)良無(wú)性系篩選[D]. 張瑋.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
[8]甘藍(lán)型油菜GRAS家族基因BnLAS的分離和功能分析[D]. 楊明貴.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010
[9]庫(kù)布齊沙漠沙柳培育關(guān)鍵技術(shù)研究[D]. 米志英.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2008
碩士論文
[1]沙柳SpsFUCT基因的克隆、組織特異性表達(dá)及表達(dá)載體構(gòu)建[D]. 楊楊.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[2]沙柳SpsLAS基因克隆、組織特異性表達(dá)及表達(dá)載體構(gòu)建[D]. 路東曄.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[3]不同平茬高度對(duì)沙柳生長(zhǎng)狀況的影響研究[D]. 馬天琴.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[4]8種柳屬植物微體快繁關(guān)鍵技術(shù)的研究[D]. 崔敏.中國(guó)林業(yè)科學(xué)研究院 2017
[5]沙柳TAC1基因克隆與生物信息學(xué)及組織表達(dá)特性分析[D]. 馬月林.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[6]兩種芋蘭分枝發(fā)育相關(guān)基因LS及其調(diào)控區(qū)的克隆與表達(dá)分析[D]. 陳秀珍.廣州中醫(yī)藥大學(xué) 2016
[7]沙柳基活性炭對(duì)水體中染料和酚類物質(zhì)的吸附研究[D]. 劉靜萱.鄭州大學(xué) 2016
[8]沙柳組培快繁和再生體系建立的初步研究[D]. 敖敦.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[9]不同生境對(duì)園林植物構(gòu)型的影響[D]. 陳夢(mèng)依.福建農(nóng)林大學(xué) 2015
[10]AtNAC1轉(zhuǎn)錄因子的分子建模和鐵皮石斛NAC家族基因的克隆及表達(dá)分析[D]. 朱乾坤.西南交通大學(xué) 2014
本文編號(hào):3327282
【文章來(lái)源】:內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)內(nèi)蒙古自治區(qū)
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【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
圖1?GARS蛋白分子結(jié)構(gòu)[62]??6
Bolle[66]等對(duì)模式植物擬南芥和水稻的基因家族進(jìn)行進(jìn)化分析,將G兄45??基因家族劃分為8?jìng)(gè)亞家族:L/SCX、別77、SCi3、Z)£XZ^、Sd?*S7/i?、i^和/MM??(如圖2)。他^^[67]等通過(guò)進(jìn)化樹(shù)分析將0反八3基因家族分為13個(gè)亞家族乂_77、??AtSCL4/7、AtSCL9、AtSHR、HAM、AtLAS、AtSCR、A-tSCL3、AtSCL28、DELLA、??尸d?OM和付。其研究結(jié)果表明不同植物中基因家族序列存在高度相??似性,這表明該家族在植物中可能是通過(guò)串聯(lián)復(fù)制產(chǎn)生重復(fù)基因而進(jìn)行進(jìn)化的。由??于序列高度保守,同一亞家族成員在功能上也具有相似性或相關(guān)性。??—r?纖"dim念{5】於??一―—二…?,^?1?■歲?At?????????????......-p::=z:rr:??r-———?& ̄crrz?it?SS??'?{?4??i*獅哪料.:p雄.*貧??一卿—一?n£^cr=??r———————屬|£??'1.…—I?^?jrUI--czzz??l ̄n?r??tm??i^czr:念雜??Mg^jLJk?緣?I?l…..-???…'『一一<?麵務(wù)??-?1?.“、>?、—??L....,,,,...,.,^WOa-^??-.一一一...???一r°—??"?***??〇?#???—??^P1'??f__纖^^娘??xmuu^一????^,r-^C:?-::?:?SS??瞻?L??i?「 ̄?M=nSsi??—?*? ̄7==m
采用?Thermo?Fisher?公司生產(chǎn)的?GeneJET?Plant?RNA?Purification?Kit?試劑盒進(jìn)行??沙柳總RNA的提取。采用紫外分光光度計(jì)進(jìn)行濃度檢測(cè),濃度為2778?ng/pl電泳結(jié)??果顯示28?s條帶亮度約是18?s處的兩倍(如圖3),說(shuō)明RNA提取質(zhì)量較好。??1??28s—i,??18s—??—??圖3沙柳總RNA電泳圖??Fig.3?Total?RNA?electrophoretogram?of?Salix?psammophila??3.?1.2設(shè)計(jì)及測(cè)試引物結(jié)果??提取沙柳全株RNA并進(jìn)行cDNA第一鏈的合成,以cDNA第一鏈為模板,利??用所設(shè)計(jì)的5’端UTR區(qū)引物與3'端UTR區(qū)引物,在20?|il?Pfu高保真酶體系下進(jìn)行??PCR的擴(kuò)增,得到目標(biāo)條帶,利用Trans2K?DNA?Marker進(jìn)行長(zhǎng)度判斷,目標(biāo)條帶??為預(yù)估約為1500?bp左右,實(shí)際亮度條帶在1000?bp與2000?bp之間,約為1500?bp??符合預(yù)估條件(如圖4)。??M?1??2?ooob?p??滅_??圖4目標(biāo)基因擴(kuò)增電泳檢測(cè)??Fig.?4?Electrofhoresis?pattern?of?target?gene??
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]興安落葉松UDP焦磷酸化酶基因啟動(dòng)子的克隆及雙元載體的構(gòu)建[J]. 梅麗麗,郭鑫,張堯,林曉飛,張文波. 分子植物育種. 2018(22)
[2]沙柳SpsLAS基因超表達(dá)對(duì)擬南芥營(yíng)養(yǎng)生長(zhǎng)的影響[J]. 張磊,路東曄,張國(guó)盛,楊海峰. 西北植物學(xué)報(bào). 2018(02)
[3]植物TCP轉(zhuǎn)錄因子的作用機(jī)理及其應(yīng)用研究進(jìn)展[J]. 馮志娟,徐盛春,劉娜,張古文,胡齊贊,龔亞明. 植物遺傳資源學(xué)報(bào). 2018(01)
[4]北沙柳種質(zhì)資源居群表型多樣性[J]. 郝蕾,張國(guó)盛,穆喜云,韓勝利,王穎,寧瑞些,白玉榮,張磊. 西北植物學(xué)報(bào). 2017(05)
[5]沙柳SpsLAZY1a和SpsLAZY1b基因克隆及生物信息學(xué)分析[J]. 張磊,葉志瑋,趙晨曦,張國(guó)盛,楊海峰. 西北林學(xué)院學(xué)報(bào). 2017(01)
[6]沙柳PNY基因克隆、生物信息學(xué)及組織特異性表達(dá)[J]. 楊海峰,王文娟,劉樂(lè),卜松雪,張雅喃,何麗君. 東北林業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2017(01)
[7]沙柳SpsLAS基因克隆及生物信息學(xué)分析[J]. 路東曄,賀玉嬌,金娜,劉樂(lè),卜松雪,王雷,楊海峰. 分子植物育種. 2017(02)
[8]沙柳組培技術(shù)初探[J]. 敖敦,楊海峰,王雷,馬月林. 福建林業(yè)科技. 2016(01)
[9]毛烏素沙地人工沙柳(Salix psammophila)林平茬復(fù)壯技術(shù)[J]. 海龍,王曉江,張文軍,張雷,洪光宇,李卓凡. 中國(guó)沙漠. 2016(01)
[10]Cd脅迫對(duì)水稻生長(zhǎng)及內(nèi)源激素含量的影響[J]. 游來(lái)勇,王昌全,羅娟,李冰,曾建. 生態(tài)環(huán)境學(xué)報(bào). 2015(05)
博士論文
[1]簸箕柳基因組測(cè)序及功能基因研究[D]. 戴曉港.南京林業(yè)大學(xué) 2017
[2]楊柳分化及其性別決定的基因組學(xué)基礎(chǔ)[D]. 侯靜.南京林業(yè)大學(xué) 2016
[3]煙草腋芽發(fā)育相關(guān)基因的克隆與功能分析[D]. 陳雅瓊.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2015
[4]楊樹(shù)miRNA基因家族進(jìn)化與靶基因研究[D]. 劉志祥.中南林業(yè)科技大學(xué) 2013
[5]楊柳木材纖維增強(qiáng)沙柳材中密度纖維板基礎(chǔ)理論與關(guān)鍵技術(shù)研究[D]. 李奇.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
[6]沙柳沙障腐蝕過(guò)程及防腐抗蝕效果研究[D]. 龔萍.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
[7]北沙柳種質(zhì)資源的多樣性分析與優(yōu)良無(wú)性系篩選[D]. 張瑋.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
[8]甘藍(lán)型油菜GRAS家族基因BnLAS的分離和功能分析[D]. 楊明貴.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010
[9]庫(kù)布齊沙漠沙柳培育關(guān)鍵技術(shù)研究[D]. 米志英.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2008
碩士論文
[1]沙柳SpsFUCT基因的克隆、組織特異性表達(dá)及表達(dá)載體構(gòu)建[D]. 楊楊.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[2]沙柳SpsLAS基因克隆、組織特異性表達(dá)及表達(dá)載體構(gòu)建[D]. 路東曄.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[3]不同平茬高度對(duì)沙柳生長(zhǎng)狀況的影響研究[D]. 馬天琴.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[4]8種柳屬植物微體快繁關(guān)鍵技術(shù)的研究[D]. 崔敏.中國(guó)林業(yè)科學(xué)研究院 2017
[5]沙柳TAC1基因克隆與生物信息學(xué)及組織表達(dá)特性分析[D]. 馬月林.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[6]兩種芋蘭分枝發(fā)育相關(guān)基因LS及其調(diào)控區(qū)的克隆與表達(dá)分析[D]. 陳秀珍.廣州中醫(yī)藥大學(xué) 2016
[7]沙柳基活性炭對(duì)水體中染料和酚類物質(zhì)的吸附研究[D]. 劉靜萱.鄭州大學(xué) 2016
[8]沙柳組培快繁和再生體系建立的初步研究[D]. 敖敦.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[9]不同生境對(duì)園林植物構(gòu)型的影響[D]. 陳夢(mèng)依.福建農(nóng)林大學(xué) 2015
[10]AtNAC1轉(zhuǎn)錄因子的分子建模和鐵皮石斛NAC家族基因的克隆及表達(dá)分析[D]. 朱乾坤.西南交通大學(xué) 2014
本文編號(hào):3327282
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