意大利蜜蜂amPGAM2基因的克
發(fā)布時間:2021-08-04 06:50
【目的】磷酸甘油酸變位酶(PGAM)是糖酵解和葡萄糖異生途徑中一種發(fā)揮重要作用的蛋白酶,本研究擬明確amPGAM2基因的序列特征及表達模式。【方法】以意大利蜜蜂Apismellifera為研究對象,克隆了amPGAM2基因的cDNA序列,分析了其序列特征及其在工蜂、雄蜂、蜂王的不同發(fā)育時期的表達模式!窘Y果】序列特征分析表明,克隆所得序列全長976 bp,包含1個完整的開放閱讀框,共編碼254個氨基酸。該基因核苷酸序列與中華蜜蜂Apiscerana(98.4%)高度相似,并存在15個潛在抗原表位、9個磷酸化位點和5個組氨酸磷酸酶域活性部位,屬于組氨酸磷酸酶超家族,是一種二磷酸甘油酸依賴性的可溶中性穩(wěn)定蛋白。熒光定量PCR結果表明,amPGAM2基因在不同品級、不同發(fā)育時期的表達差異顯著(P<0.05)。工蜂卵期3日齡、幼蟲期5日齡表達最高,雄蜂成蟲期表達最高,蜂王幼蟲期4日齡表達最高,且工蜂、雄蜂及蜂王由卵孵化成幼蟲階段和由紅眼蛹羽化至成蟲階段,其表達都呈上升趨勢!窘Y論】本研究結果推測amPGAM2基因在卵的孵化及精卵發(fā)生過程中具有重要作用,為進一步認識意大利蜜蜂生殖發(fā)育過程中...
【文章來源】:應用昆蟲學報. 2020,57(04)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:9 頁
【部分圖文】:
意大利蜜蜂amPGAM2基因PCR擴增結果
利用DNAstar軟件將amPGAM2基因核苷酸序列與其他同源物種核苷酸序列進行同源性分析,發(fā)現(xiàn)其與中華蜜蜂Apis cerana、大蜜蜂Apis dorsata、小蜜蜂Apis florea、美洲熊蜂Bombus impatiens、歐洲熊蜂Bombus terrestris、苜蓿切葉峰Megachile rotundata、墨西哥蘭花蜂Eufriesea mexicana、回條蜂Habropoda laboriosa和梭魚草蜂Dufourea novaeangliae等物種的序列相似度分別為98.4%、97.6%、96.1%、88.1%、87.8%、87.5%、86.8%、85.9%和83.7%,將各個物種的PGAM2基因核苷酸序列進行多序列比對,并使用MEGA6.0軟件構建系統(tǒng)進化樹,發(fā)現(xiàn)amPGMA2基因在分子進化上首先與中華蜜蜂聚為一支,然后與大蜜蜂和小蜜蜂聚在一起(圖2)。2.4 意大利蜜蜂amPGAM2理化性質分析
利用PredictProtein程序分析amPGAM2蛋白的二級結構,結果顯示該蛋白可能存在α-螺旋(H)10個(42.13%),β-折疊(E)5個(11.02%),無規(guī)則卷曲(L)占46.85%,為混合組成型。通過SWISS-MODEL程序同源建模(模板:4emb.1.A;同源率55.56)預測蛋白三級結構,再經(jīng)Rasmol軟件處理,得出該蛋白三級結構(圖3),圖3中3個綠色區(qū)域為組氨酸磷酸酶催化核心活性部位(10R、11H、62R、187H、188G),且三級結構與二級結構預測結果相符。2.7 意大利蜜蜂amPGAM2蛋白B細胞抗原表位分析
【參考文獻】:
期刊論文
[1]抑制糖酵解活性限制雄性原始生殖細胞的增殖[J]. 徐瑜珊,陳麗,王娜,臧春燕,彭凡珂,張軍. 現(xiàn)代生物醫(yī)學進展. 2019(10)
[2]荷斯坦牛TLR6基因CDS區(qū)的生物信息學分析[J]. 李強子,朱國強,劉吳鑫,劉麗霞,張麗. 江蘇農(nóng)業(yè)學報. 2016(03)
[3]SARS病毒基因組所編碼的E蛋白的二級結構和B細胞表位預測[J]. 呂燕波,萬瑛,吳玉章. 免疫學雜志. 2003(06)
本文編號:3321227
【文章來源】:應用昆蟲學報. 2020,57(04)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:9 頁
【部分圖文】:
意大利蜜蜂amPGAM2基因PCR擴增結果
利用DNAstar軟件將amPGAM2基因核苷酸序列與其他同源物種核苷酸序列進行同源性分析,發(fā)現(xiàn)其與中華蜜蜂Apis cerana、大蜜蜂Apis dorsata、小蜜蜂Apis florea、美洲熊蜂Bombus impatiens、歐洲熊蜂Bombus terrestris、苜蓿切葉峰Megachile rotundata、墨西哥蘭花蜂Eufriesea mexicana、回條蜂Habropoda laboriosa和梭魚草蜂Dufourea novaeangliae等物種的序列相似度分別為98.4%、97.6%、96.1%、88.1%、87.8%、87.5%、86.8%、85.9%和83.7%,將各個物種的PGAM2基因核苷酸序列進行多序列比對,并使用MEGA6.0軟件構建系統(tǒng)進化樹,發(fā)現(xiàn)amPGMA2基因在分子進化上首先與中華蜜蜂聚為一支,然后與大蜜蜂和小蜜蜂聚在一起(圖2)。2.4 意大利蜜蜂amPGAM2理化性質分析
利用PredictProtein程序分析amPGAM2蛋白的二級結構,結果顯示該蛋白可能存在α-螺旋(H)10個(42.13%),β-折疊(E)5個(11.02%),無規(guī)則卷曲(L)占46.85%,為混合組成型。通過SWISS-MODEL程序同源建模(模板:4emb.1.A;同源率55.56)預測蛋白三級結構,再經(jīng)Rasmol軟件處理,得出該蛋白三級結構(圖3),圖3中3個綠色區(qū)域為組氨酸磷酸酶催化核心活性部位(10R、11H、62R、187H、188G),且三級結構與二級結構預測結果相符。2.7 意大利蜜蜂amPGAM2蛋白B細胞抗原表位分析
【參考文獻】:
期刊論文
[1]抑制糖酵解活性限制雄性原始生殖細胞的增殖[J]. 徐瑜珊,陳麗,王娜,臧春燕,彭凡珂,張軍. 現(xiàn)代生物醫(yī)學進展. 2019(10)
[2]荷斯坦牛TLR6基因CDS區(qū)的生物信息學分析[J]. 李強子,朱國強,劉吳鑫,劉麗霞,張麗. 江蘇農(nóng)業(yè)學報. 2016(03)
[3]SARS病毒基因組所編碼的E蛋白的二級結構和B細胞表位預測[J]. 呂燕波,萬瑛,吳玉章. 免疫學雜志. 2003(06)
本文編號:3321227
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