意大利蜜蜂amPGAM2基因的克
發(fā)布時(shí)間:2021-08-04 06:50
【目的】磷酸甘油酸變位酶(PGAM)是糖酵解和葡萄糖異生途徑中一種發(fā)揮重要作用的蛋白酶,本研究擬明確amPGAM2基因的序列特征及表達(dá)模式!痉椒ā恳砸獯罄鄯銩pismellifera為研究對(duì)象,克隆了amPGAM2基因的cDNA序列,分析了其序列特征及其在工蜂、雄蜂、蜂王的不同發(fā)育時(shí)期的表達(dá)模式!窘Y(jié)果】序列特征分析表明,克隆所得序列全長(zhǎng)976 bp,包含1個(gè)完整的開放閱讀框,共編碼254個(gè)氨基酸。該基因核苷酸序列與中華蜜蜂Apiscerana(98.4%)高度相似,并存在15個(gè)潛在抗原表位、9個(gè)磷酸化位點(diǎn)和5個(gè)組氨酸磷酸酶域活性部位,屬于組氨酸磷酸酶超家族,是一種二磷酸甘油酸依賴性的可溶中性穩(wěn)定蛋白。熒光定量PCR結(jié)果表明,amPGAM2基因在不同品級(jí)、不同發(fā)育時(shí)期的表達(dá)差異顯著(P<0.05)。工蜂卵期3日齡、幼蟲期5日齡表達(dá)最高,雄蜂成蟲期表達(dá)最高,蜂王幼蟲期4日齡表達(dá)最高,且工蜂、雄蜂及蜂王由卵孵化成幼蟲階段和由紅眼蛹羽化至成蟲階段,其表達(dá)都呈上升趨勢(shì)。【結(jié)論】本研究結(jié)果推測(cè)amPGAM2基因在卵的孵化及精卵發(fā)生過(guò)程中具有重要作用,為進(jìn)一步認(rèn)識(shí)意大利蜜蜂生殖發(fā)育過(guò)程中...
【文章來(lái)源】:應(yīng)用昆蟲學(xué)報(bào). 2020,57(04)北大核心CSCD
【文章頁(yè)數(shù)】:9 頁(yè)
【部分圖文】:
意大利蜜蜂amPGAM2基因PCR擴(kuò)增結(jié)果
利用DNAstar軟件將amPGAM2基因核苷酸序列與其他同源物種核苷酸序列進(jìn)行同源性分析,發(fā)現(xiàn)其與中華蜜蜂Apis cerana、大蜜蜂Apis dorsata、小蜜蜂Apis florea、美洲熊蜂Bombus impatiens、歐洲熊蜂Bombus terrestris、苜蓿切葉峰Megachile rotundata、墨西哥蘭花蜂Eufriesea mexicana、回條蜂Habropoda laboriosa和梭魚草蜂Dufourea novaeangliae等物種的序列相似度分別為98.4%、97.6%、96.1%、88.1%、87.8%、87.5%、86.8%、85.9%和83.7%,將各個(gè)物種的PGAM2基因核苷酸序列進(jìn)行多序列比對(duì),并使用MEGA6.0軟件構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹,發(fā)現(xiàn)amPGMA2基因在分子進(jìn)化上首先與中華蜜蜂聚為一支,然后與大蜜蜂和小蜜蜂聚在一起(圖2)。2.4 意大利蜜蜂amPGAM2理化性質(zhì)分析
利用PredictProtein程序分析amPGAM2蛋白的二級(jí)結(jié)構(gòu),結(jié)果顯示該蛋白可能存在α-螺旋(H)10個(gè)(42.13%),β-折疊(E)5個(gè)(11.02%),無(wú)規(guī)則卷曲(L)占46.85%,為混合組成型。通過(guò)SWISS-MODEL程序同源建模(模板:4emb.1.A;同源率55.56)預(yù)測(cè)蛋白三級(jí)結(jié)構(gòu),再經(jīng)Rasmol軟件處理,得出該蛋白三級(jí)結(jié)構(gòu)(圖3),圖3中3個(gè)綠色區(qū)域?yàn)榻M氨酸磷酸酶催化核心活性部位(10R、11H、62R、187H、188G),且三級(jí)結(jié)構(gòu)與二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)結(jié)果相符。2.7 意大利蜜蜂amPGAM2蛋白B細(xì)胞抗原表位分析
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]抑制糖酵解活性限制雄性原始生殖細(xì)胞的增殖[J]. 徐瑜珊,陳麗,王娜,臧春燕,彭凡珂,張軍. 現(xiàn)代生物醫(yī)學(xué)進(jìn)展. 2019(10)
[2]荷斯坦牛TLR6基因CDS區(qū)的生物信息學(xué)分析[J]. 李強(qiáng)子,朱國(guó)強(qiáng),劉吳鑫,劉麗霞,張麗. 江蘇農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2016(03)
[3]SARS病毒基因組所編碼的E蛋白的二級(jí)結(jié)構(gòu)和B細(xì)胞表位預(yù)測(cè)[J]. 呂燕波,萬(wàn)瑛,吳玉章. 免疫學(xué)雜志. 2003(06)
本文編號(hào):3321227
【文章來(lái)源】:應(yīng)用昆蟲學(xué)報(bào). 2020,57(04)北大核心CSCD
【文章頁(yè)數(shù)】:9 頁(yè)
【部分圖文】:
意大利蜜蜂amPGAM2基因PCR擴(kuò)增結(jié)果
利用DNAstar軟件將amPGAM2基因核苷酸序列與其他同源物種核苷酸序列進(jìn)行同源性分析,發(fā)現(xiàn)其與中華蜜蜂Apis cerana、大蜜蜂Apis dorsata、小蜜蜂Apis florea、美洲熊蜂Bombus impatiens、歐洲熊蜂Bombus terrestris、苜蓿切葉峰Megachile rotundata、墨西哥蘭花蜂Eufriesea mexicana、回條蜂Habropoda laboriosa和梭魚草蜂Dufourea novaeangliae等物種的序列相似度分別為98.4%、97.6%、96.1%、88.1%、87.8%、87.5%、86.8%、85.9%和83.7%,將各個(gè)物種的PGAM2基因核苷酸序列進(jìn)行多序列比對(duì),并使用MEGA6.0軟件構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹,發(fā)現(xiàn)amPGMA2基因在分子進(jìn)化上首先與中華蜜蜂聚為一支,然后與大蜜蜂和小蜜蜂聚在一起(圖2)。2.4 意大利蜜蜂amPGAM2理化性質(zhì)分析
利用PredictProtein程序分析amPGAM2蛋白的二級(jí)結(jié)構(gòu),結(jié)果顯示該蛋白可能存在α-螺旋(H)10個(gè)(42.13%),β-折疊(E)5個(gè)(11.02%),無(wú)規(guī)則卷曲(L)占46.85%,為混合組成型。通過(guò)SWISS-MODEL程序同源建模(模板:4emb.1.A;同源率55.56)預(yù)測(cè)蛋白三級(jí)結(jié)構(gòu),再經(jīng)Rasmol軟件處理,得出該蛋白三級(jí)結(jié)構(gòu)(圖3),圖3中3個(gè)綠色區(qū)域?yàn)榻M氨酸磷酸酶催化核心活性部位(10R、11H、62R、187H、188G),且三級(jí)結(jié)構(gòu)與二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)結(jié)果相符。2.7 意大利蜜蜂amPGAM2蛋白B細(xì)胞抗原表位分析
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]抑制糖酵解活性限制雄性原始生殖細(xì)胞的增殖[J]. 徐瑜珊,陳麗,王娜,臧春燕,彭凡珂,張軍. 現(xiàn)代生物醫(yī)學(xué)進(jìn)展. 2019(10)
[2]荷斯坦牛TLR6基因CDS區(qū)的生物信息學(xué)分析[J]. 李強(qiáng)子,朱國(guó)強(qiáng),劉吳鑫,劉麗霞,張麗. 江蘇農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2016(03)
[3]SARS病毒基因組所編碼的E蛋白的二級(jí)結(jié)構(gòu)和B細(xì)胞表位預(yù)測(cè)[J]. 呂燕波,萬(wàn)瑛,吳玉章. 免疫學(xué)雜志. 2003(06)
本文編號(hào):3321227
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