云南省人類?刹《25型的基因特征分析
發(fā)布時(shí)間:2021-08-04 04:37
目的對云南省2006-2014年從急性弛緩型麻痹(acute flaccid paralysis, AFP)、手足口。╤and, foot and mouth disease)、病毒性腦炎(viral meningitis,VM)病例和健康兒童中分離到的15株人類?刹《25型(echovirus 25, E25)VP1區(qū)的基因特征進(jìn)行分析。方法對云南省分離到的15株E25毒株進(jìn)行血清中和試驗(yàn)和基因測序鑒定并對其完整VP1區(qū)基因進(jìn)行逆轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈反應(yīng)及定型,構(gòu)建其親緣性進(jìn)化樹揭示其基因特征。結(jié)果 2006-2014年云南15株E25毒株的基因進(jìn)化分析表明,14株分布在基因型B分支2(lineage 2)的簇1(cluster 1),1株分布在簇2(cluster 2)。云南株與原型株JV-4株的核苷酸差異率為19.91%,氨基酸差異率為5.56%。結(jié)論基因進(jìn)化分析結(jié)果表明15株云南E25病毒株為基因型B,其中14株為分支2的簇1,只有1株為簇2,簇1毒株是云南省主要流行株。
【文章來源】:中國病毒病雜志. 2020,10(05)
【文章頁數(shù)】:4 頁
【部分圖文】:
E25毒株的VP1區(qū)(876 bp)基因進(jìn)化樹
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]2013年云南省元江縣健康兒童腸道病毒病原學(xué)調(diào)查及E6病毒VP1區(qū)3′端基因特征分析[J]. 周永明,徐聞,伏曉慶,向以斌,田炳均. 中國病毒病雜志. 2019(05)
[2]WS 588-2018 手足口病診斷[J]. National Health and Family Planning Commission of The People’s Republic of China;. 中國病毒病雜志. 2018(06)
[3]腸道病毒ECHO25河南分離株基因特征分析[J]. 晁靈,黃學(xué)勇,李幸樂,許汴利. 病毒學(xué)報(bào). 2010(06)
[4]腸道病毒B組山東地方株的基因型分布[J]. 王海巖,劉昆,陶澤新,李巖,劉桂芳,劉堯,馮蕾,樊慶瑩,楊赫,宋立志,徐愛強(qiáng). 病毒學(xué)報(bào). 2010(05)
[5]腸道病毒ECHO13中國分離株的基因特征[J]. 毛乃穎,許文波,楊秀惠,劉中華,嚴(yán)延生,潘偉毅,張勇. 病毒學(xué)報(bào). 2004(04)
本文編號:3321018
【文章來源】:中國病毒病雜志. 2020,10(05)
【文章頁數(shù)】:4 頁
【部分圖文】:
E25毒株的VP1區(qū)(876 bp)基因進(jìn)化樹
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]2013年云南省元江縣健康兒童腸道病毒病原學(xué)調(diào)查及E6病毒VP1區(qū)3′端基因特征分析[J]. 周永明,徐聞,伏曉慶,向以斌,田炳均. 中國病毒病雜志. 2019(05)
[2]WS 588-2018 手足口病診斷[J]. National Health and Family Planning Commission of The People’s Republic of China;. 中國病毒病雜志. 2018(06)
[3]腸道病毒ECHO25河南分離株基因特征分析[J]. 晁靈,黃學(xué)勇,李幸樂,許汴利. 病毒學(xué)報(bào). 2010(06)
[4]腸道病毒B組山東地方株的基因型分布[J]. 王海巖,劉昆,陶澤新,李巖,劉桂芳,劉堯,馮蕾,樊慶瑩,楊赫,宋立志,徐愛強(qiáng). 病毒學(xué)報(bào). 2010(05)
[5]腸道病毒ECHO13中國分離株的基因特征[J]. 毛乃穎,許文波,楊秀惠,劉中華,嚴(yán)延生,潘偉毅,張勇. 病毒學(xué)報(bào). 2004(04)
本文編號:3321018
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