茶樹(shù)隱花色素基因CsCRY1和CsCRY2的克隆及表達(dá)模式分析
發(fā)布時(shí)間:2021-08-03 16:46
通過(guò)同源比對(duì)茶樹(shù)[Camellia sinensis(Linn.) Kuntze]基因組和轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),獲得2個(gè)茶樹(shù)隱花色素(CRY)基因。利用PCR克隆技術(shù),從茶樹(shù)品種‘福鼎大白茶’(‘Fuding Dabaicha’)中克隆得到這2個(gè)隱花色素基因,分別命名為CsCRY1和CsCRY2。采用生物信息學(xué)方法,對(duì)茶樹(shù)CsCRY1和CsCRY2基因編碼蛋白的結(jié)構(gòu)域、系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系、二級(jí)結(jié)構(gòu)和PHR結(jié)構(gòu)域的三級(jí)結(jié)構(gòu)進(jìn)行分析,對(duì)CsCRY1和CsCRY2基因的啟動(dòng)子順式作用元件及其功能進(jìn)行了預(yù)測(cè)分析。結(jié)果顯示:茶樹(shù)CsCRY1基因開(kāi)放閱讀框長(zhǎng)度為2 055 bp,編碼684個(gè)氨基酸;CsCRY2基因開(kāi)放閱讀框長(zhǎng)度為1 944 bp,編碼647個(gè)氨基酸;CsCRY1和CsCRY2蛋白均在N端含有保守的PHR結(jié)構(gòu)域,在C端含有保守的CCE結(jié)構(gòu)域,這2個(gè)結(jié)構(gòu)域在擬南芥[Arabidopsis thaliana(Linn.) Heynh.]中具有傳導(dǎo)藍(lán)光信號(hào)的功能。系統(tǒng)進(jìn)化分析結(jié)果顯示:CsCRY1和CsCRY2蛋白屬于Plant CRY類隱花色素,其進(jìn)化樹(shù)分支距離與同目(杜鵑花目)植物滇山茶(Camel...
【文章來(lái)源】:植物資源與環(huán)境學(xué)報(bào). 2020,29(06)北大核心CSCD
【文章頁(yè)數(shù)】:12 頁(yè)
【部分圖文】:
茶樹(shù)CsCRY1和CsCRY2基因的PCR產(chǎn)物電泳圖
以擬南芥AtCRY1的PHR晶體結(jié)構(gòu)1u3d.1.A為參照模型,利用SWISS-MODEL在線軟件預(yù)測(cè)茶樹(shù)CsCRY1和CsCRY2蛋白PHR結(jié)構(gòu)域的三級(jí)結(jié)構(gòu),結(jié)果(圖5)顯示:茶樹(shù)CsCRY1和CsCRY2蛋白的PHR結(jié)構(gòu)域與參照模型相似,主要由α螺旋、無(wú)規(guī)則卷曲和β折疊組成,且在N端具有α螺旋和β折疊結(jié)構(gòu)域,與二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)結(jié)果相吻合。圖4 茶樹(shù)Cs CRY1(A)和Cs CRY2(B)蛋白二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
茶樹(shù)CsCRY1和CsCRY2蛋白PHR結(jié)構(gòu)域的三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]中國(guó)茶樹(shù)遺傳育種40年[J]. 王新超,王璐,郝心愿,曾建明,楊亞軍. 中國(guó)茶葉. 2019(05)
[2]光對(duì)茶樹(shù)生產(chǎn)與茶葉品質(zhì)影響及其應(yīng)用研究進(jìn)展[J]. 俞少娟,王婷婷,陳壽松,林宏政,金心怡. 福建茶葉. 2016(05)
[3]擬南芥中光信號(hào)系統(tǒng)中關(guān)鍵基因CRY1、CRY2和COP1啟動(dòng)子的表達(dá)模式分析[J]. 湯淼,楊洪全. 植物生理學(xué)通訊. 2010(06)
本文編號(hào):3319971
【文章來(lái)源】:植物資源與環(huán)境學(xué)報(bào). 2020,29(06)北大核心CSCD
【文章頁(yè)數(shù)】:12 頁(yè)
【部分圖文】:
茶樹(shù)CsCRY1和CsCRY2基因的PCR產(chǎn)物電泳圖
以擬南芥AtCRY1的PHR晶體結(jié)構(gòu)1u3d.1.A為參照模型,利用SWISS-MODEL在線軟件預(yù)測(cè)茶樹(shù)CsCRY1和CsCRY2蛋白PHR結(jié)構(gòu)域的三級(jí)結(jié)構(gòu),結(jié)果(圖5)顯示:茶樹(shù)CsCRY1和CsCRY2蛋白的PHR結(jié)構(gòu)域與參照模型相似,主要由α螺旋、無(wú)規(guī)則卷曲和β折疊組成,且在N端具有α螺旋和β折疊結(jié)構(gòu)域,與二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)結(jié)果相吻合。圖4 茶樹(shù)Cs CRY1(A)和Cs CRY2(B)蛋白二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
茶樹(shù)CsCRY1和CsCRY2蛋白PHR結(jié)構(gòu)域的三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]中國(guó)茶樹(shù)遺傳育種40年[J]. 王新超,王璐,郝心愿,曾建明,楊亞軍. 中國(guó)茶葉. 2019(05)
[2]光對(duì)茶樹(shù)生產(chǎn)與茶葉品質(zhì)影響及其應(yīng)用研究進(jìn)展[J]. 俞少娟,王婷婷,陳壽松,林宏政,金心怡. 福建茶葉. 2016(05)
[3]擬南芥中光信號(hào)系統(tǒng)中關(guān)鍵基因CRY1、CRY2和COP1啟動(dòng)子的表達(dá)模式分析[J]. 湯淼,楊洪全. 植物生理學(xué)通訊. 2010(06)
本文編號(hào):3319971
本文鏈接:http://sikaile.net/kejilunwen/jiyingongcheng/3319971.html
最近更新
教材專著