通過同源比對茶樹[Camellia sinensis（Linn.） Kuntze]基因組和轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),獲得2個茶樹隱花色素（CRY）基因。利用PCR克隆技術(shù),從茶樹品種‘福鼎大白茶’（‘Fuding Dabaicha’）中克隆得到這2個隱花色素基因,分別命名為CsCRY1和CsCRY2。采用生物信息學(xué)方法,對茶樹CsCRY1和CsCRY2基因編碼蛋白的結(jié)構(gòu)域、系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系、二級結(jié)構(gòu)和PHR結(jié)構(gòu)域的三級結(jié)構(gòu)進(jìn)行分析,對CsCRY1和CsCRY2基因的啟動子順式作用元件及其功能進(jìn)行了預(yù)測分析。結(jié)果顯示:茶樹CsCRY1基因開放閱讀框長度為2 055 bp,編碼684個氨基酸;CsCRY2基因開放閱讀框長度為1 944 bp,編碼647個氨基酸;CsCRY1和CsCRY2蛋白均在N端含有保守的PHR結(jié)構(gòu)域,在C端含有保守的CCE結(jié)構(gòu)域,這2個結(jié)構(gòu)域在擬南芥[Arabidopsis thaliana（Linn.） Heynh.]中具有傳導(dǎo)藍(lán)光信號的功能。系統(tǒng)進(jìn)化分析結(jié)果顯示:CsCRY1和CsCRY2蛋白屬于Plant CRY類隱花色素,其進(jìn)化樹分支距離與同目（杜鵑花目）植物滇山茶（Camel... 

【文章來源】：植物資源與環(huán)境學(xué)報. 2020,29(06)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：12 頁

【部分圖文】：

茶樹CsCRY1和CsCRY2基因的PCR產(chǎn)物電泳圖

以擬南芥AtCRY1的PHR晶體結(jié)構(gòu)1u3d.1.A為參照模型,利用SWISS-MODEL在線軟件預(yù)測茶樹CsCRY1和CsCRY2蛋白PHR結(jié)構(gòu)域的三級結(jié)構(gòu),結(jié)果(圖5)顯示:茶樹CsCRY1和CsCRY2蛋白的PHR結(jié)構(gòu)域與參照模型相似,主要由α螺旋、無規(guī)則卷曲和β折疊組成,且在N端具有α螺旋和β折疊結(jié)構(gòu)域,與二級結(jié)構(gòu)預(yù)測結(jié)果相吻合。圖4 茶樹Cs CRY1(A)和Cs CRY2(B)蛋白二級結(jié)構(gòu)預(yù)測

茶樹CsCRY1和CsCRY2蛋白PHR結(jié)構(gòu)域的三級結(jié)構(gòu)預(yù)測

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]中國茶樹遺傳育種40年[J]. 王新超,王璐,郝心愿,曾建明,楊亞軍.  中國茶葉. 2019(05)
[2]光對茶樹生產(chǎn)與茶葉品質(zhì)影響及其應(yīng)用研究進(jìn)展[J]. 俞少娟,王婷婷,陳壽松,林宏政,金心怡.  福建茶葉. 2016(05)
[3]擬南芥中光信號系統(tǒng)中關(guān)鍵基因CRY1、CRY2和COP1啟動子的表達(dá)模式分析[J]. 湯淼,楊洪全.  植物生理學(xué)通訊. 2010(06)



本文編號：3319971