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麝鼠PIK3cb基因的生物信息學(xué)分析及表達分析

發(fā)布時間:2021-08-03 08:39
  為了了解麝鼠PIK3cb基因及其所編碼蛋白的性質(zhì)功能,研究PIK3cb基因在麝鼠香腺周期變化中的作用,試驗利用生物信息學(xué)分析方法對麝鼠PIK3cb基因編碼蛋白的理化性質(zhì)、跨膜結(jié)構(gòu)、亞細胞定位、磷酸化位點、信號肽、結(jié)構(gòu)域及其高級結(jié)構(gòu)進行了分析,并利用RT-q PCR技術(shù)比較了PIK3cb基因在2—9月份麝鼠香腺中的轉(zhuǎn)錄水平差異。結(jié)果表明:PIK3cb基因的編碼序列(CDS)區(qū)編碼1 070個氨基酸,是不穩(wěn)定的親水性蛋白;有76個磷酸化位點;該蛋白的亞細胞定位主要位于細胞質(zhì);預(yù)測該蛋白由5個結(jié)構(gòu)域組成,即p85蛋白結(jié)合域(p85B)、Ras結(jié)合域(RBD)、脂質(zhì)結(jié)合域C2(PI3K-C2)、PIK域(PI3Ka)和催化核心域(PI3Kc);在2—9月份的麝鼠香腺中,PIK3cb基因的表達量呈下調(diào)趨勢。說明該基因在麝鼠的香腺發(fā)育或萎縮中可能起到重要調(diào)控作用。 

【文章來源】:黑龍江畜牧獸醫(yī). 2020,(20)北大核心

【文章頁數(shù)】:7 頁

【部分圖文】:

麝鼠PIK3cb基因的生物信息學(xué)分析及表達分析


麝鼠PIK3cb基因編碼蛋白親/疏水性分析

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RT-q PCR檢測結(jié)果表明:PIK3cb基因在2—9月份的麝鼠香腺中均有表達。將9月份作為對照時,PIK3cb基因在2,3,4,5,6,7,8月份的麝鼠香腺中的相對表達量分別是9月的54.71,29.47,29.75,5.31,6.18,2.11,1.22倍,其中5—7月份的相對表達量顯著高于9月份(P<0.05),2—4月份的相對表達量極顯著高于9月份(P<0.01),而8月份與9月份差異不顯著(P>0.05)。見圖7。由圖7還可以看出,2—9月份,麝鼠PIK3cb基因在香腺中的表達量呈下調(diào)趨勢。

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PIK3cb基因熔解曲線

【參考文獻】:
期刊論文
[1]PI3K/AKT信號傳導(dǎo)通路在惡性腫瘤中的研究進展[J]. 郭威,張沖,鐘先榮.  河北醫(yī)科大學(xué)學(xué)報. 2018(06)
[2]麝鼠泌香機制研究進展[J]. 竭航,趙貴軍,封孝蘭,張承露,陳強,曾德軍.  特產(chǎn)研究. 2015(03)
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[4]結(jié)直腸癌組織中PI3KCB蛋白表達及其與多藥耐藥基因產(chǎn)物的相關(guān)性[J]. 高向前,吳淑華,紀洪,李揚揚,燕偉,孟曉.  山東醫(yī)藥. 2012(14)

碩士論文
[1]性類固醇激素對麝鼠泌香腺功能的調(diào)節(jié)作用[D]. 陸路.北京林業(yè)大學(xué) 2014
[2]IA型磷脂酰肌醇-3-激酶(PI3K)及相關(guān)蛋白質(zhì)復(fù)合物結(jié)構(gòu)與功能的研究[D]. 劉穎.山東大學(xué) 2013



本文編號:3319308

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