馬鈴薯StWRKY57基因響應(yīng)干旱脅迫的功能鑒定
發(fā)布時間:2021-08-03 04:52
WRKY轉(zhuǎn)錄因子是高等植物中最大的轉(zhuǎn)錄因子家族之一,它可以與靶基因的順式作用元件互作后對目標(biāo)基因進(jìn)行調(diào)控。WRKY轉(zhuǎn)錄因子可以調(diào)控植物的生長發(fā)育、生物學(xué)代謝以及抗逆過程,研究發(fā)現(xiàn)過表達(dá)WRKY基因可以提高植物對于干旱、鹽堿、高溫的耐受性以及對病菌的耐受性,但目前對于馬鈴薯WRKY轉(zhuǎn)錄因子介導(dǎo)的信號轉(zhuǎn)導(dǎo)研究較少,因此本研究通過構(gòu)建馬鈴薯WRKY基因的過表達(dá)與干擾表達(dá)載體以及酵母雙雜技術(shù)篩選與WRKY基因互作的蛋白,來研究WRKY基因的生物學(xué)特性和響應(yīng)馬鈴薯抗干旱脅迫的機制,為進(jìn)一步研究WRKY基因在馬鈴薯抗干旱脅迫方面的代謝途徑提供理論基礎(chǔ)。主要研究結(jié)果如下:1.馬鈴薯StWRKY57基因的生物信息學(xué)分析:StWRKY57基因位于8號染色體上,CDS區(qū)長762 bp,含有4個外顯子,該基因共編碼253個氨基酸,其編碼的蛋白相對分子量為28.72 kDa,理論等電點為8.84,不穩(wěn)定系數(shù)為57.47,脂肪系數(shù)為75.53,總平均親水性為-0.653,說明該蛋白為疏水性蛋白且該蛋白具有跨膜結(jié)構(gòu)。利用同源重組法成功構(gòu)建瞬時表達(dá)載體pEGFP-WRKY,并使用農(nóng)桿菌介導(dǎo)的轉(zhuǎn)化法轉(zhuǎn)染煙草,通過激光...
【文章來源】:甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)甘肅省
【文章頁數(shù)】:78 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
酵母雙雜交原理
圖 1.2 酵母雙雜交系統(tǒng)中報告基因的構(gòu)建系統(tǒng)ig.1.2 Reporter gene construction system in yeast two-hybrid syste用的是 Y2HGold 和 Y187 這兩種經(jīng)過改造的酵母菌株株不含可以編碼轉(zhuǎn)錄因子的基因,保留了特定的報告基C 和 MEL1)及其上游活化序列,因此它們不具有可以1.2)[164,165]。將轉(zhuǎn)入不同外源轉(zhuǎn)錄因子的酵母菌株雜交以激活報告基因的轉(zhuǎn)錄[166,167]。BD 結(jié)合目的基因(誘誘餌蛋白,AD 結(jié)合靶基因成為獵物蛋白,將 BD-誘餌交后的酵母細(xì)胞中表達(dá),若這兩個蛋白能夠互作,則可錄因子從而激活下游報告基因的表達(dá),若兩個蛋白不互復(fù)合體與上游的活化序列結(jié)合,從而不能激活下游報告
圖 2.1 StWRKY57 的基因結(jié)構(gòu)Fig.2.1 The structures of StWRKY57 gene注: 內(nèi)含子和外顯子分別用細(xì)線條和粗線條表示Note: Introns and exons were represented by lines and filled boxes, respectivelyWRKY57 蛋白質(zhì)特性在線軟件 ProtParam 對馬鈴薯 StWRKY57 所編碼的蛋白的理化性質(zhì)進(jìn)行果表明該基因可以編碼 253 個氨基酸,蛋白的相對分子量為 28.72 kDa,點為 8.84,負(fù)電荷殘基總數(shù)(Asp+Glu)為 28 個,正電荷殘基總數(shù)s)為 33 個,分子式為 C1259H2015N353O396S9,原子總數(shù)為 4032,不穩(wěn)定.47,脂肪系數(shù)為 75.53,總平均親水性為-0.653,說明該蛋白為疏水性圖 2.2)。利用 TMAP 分析顯示該蛋白具有跨膜結(jié)構(gòu)(圖 2.3)。表 2.1 馬鈴薯 StWRKY57 蛋白氨基酸種類和數(shù)量Table 2.1 StWRKY57 of potato protein amino acid types and quantities殘基數(shù)量百分比(%)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]氮素對馬鈴薯品種東農(nóng)311產(chǎn)量及品質(zhì)的影響[J]. 田洵,魏峭嶸,梁曉麗,祁馳恒,石瑛. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2015(09)
[2]植物WRKY轉(zhuǎn)錄因子家族GroupⅡa基因研究進(jìn)展[J]. 羅昌國,袁啟鳳,裴曉紅,吳亞維,鄭偉,章鎮(zhèn). 熱帶作物學(xué)報. 2015(03)
[3]WRKY轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子在植物與病原體互作中的功能[J]. 伍林濤,萬謙,韓宏仕,奉斌,康公平,曾章麗. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2014(06)
[4]CryⅢA基因植物表達(dá)載體構(gòu)建及馬鈴薯遺傳轉(zhuǎn)化[J]. 尤佳,張寧,文義凱,吳家和,司懷軍,王蒂. 草業(yè)學(xué)報. 2014(01)
[5]苧麻WRKY轉(zhuǎn)錄因子的序列分析[J]. 付莉莉,劉頭明,朱四元,湯清明,唐守偉. 中國麻業(yè)科學(xué). 2013(03)
[6]植物MYB轉(zhuǎn)錄因子功能及調(diào)控機制研究進(jìn)展[J]. 左然,徐美玲,柴國華,周功克. 生命科學(xué). 2012(10)
[7]植物WRKY轉(zhuǎn)錄因子的結(jié)構(gòu)特點及其在植物防衛(wèi)反應(yīng)中的作用[J]. 賈翠玲,侯和勝. 天津農(nóng)業(yè)科學(xué). 2010(02)
[8]WRKY轉(zhuǎn)錄因子功能研究進(jìn)展[J]. 張娟. 西北植物學(xué)報. 2009(10)
[9]AP2/EREBP轉(zhuǎn)錄因子在植物發(fā)育和脅迫應(yīng)答中的作用[J]. 趙利鋒,柴團耀. 植物學(xué)通報. 2008(01)
[10]干旱脅迫對玉米幼苗生理特性的影響[J]. 張艷馥,沙偉,徐忠文. 種子. 2007(06)
博士論文
[1]馬鈴薯抗逆相關(guān)基因SnRK2家族的克隆與功能分析[D]. 毛娟.甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
碩士論文
[1]津田蕪菁花青素調(diào)控基因的克隆及轉(zhuǎn)化菊花的研究[D]. 劉振華.東北林業(yè)大學(xué) 2010
本文編號:3318971
【文章來源】:甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)甘肅省
【文章頁數(shù)】:78 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
酵母雙雜交原理
圖 1.2 酵母雙雜交系統(tǒng)中報告基因的構(gòu)建系統(tǒng)ig.1.2 Reporter gene construction system in yeast two-hybrid syste用的是 Y2HGold 和 Y187 這兩種經(jīng)過改造的酵母菌株株不含可以編碼轉(zhuǎn)錄因子的基因,保留了特定的報告基C 和 MEL1)及其上游活化序列,因此它們不具有可以1.2)[164,165]。將轉(zhuǎn)入不同外源轉(zhuǎn)錄因子的酵母菌株雜交以激活報告基因的轉(zhuǎn)錄[166,167]。BD 結(jié)合目的基因(誘誘餌蛋白,AD 結(jié)合靶基因成為獵物蛋白,將 BD-誘餌交后的酵母細(xì)胞中表達(dá),若這兩個蛋白能夠互作,則可錄因子從而激活下游報告基因的表達(dá),若兩個蛋白不互復(fù)合體與上游的活化序列結(jié)合,從而不能激活下游報告
圖 2.1 StWRKY57 的基因結(jié)構(gòu)Fig.2.1 The structures of StWRKY57 gene注: 內(nèi)含子和外顯子分別用細(xì)線條和粗線條表示Note: Introns and exons were represented by lines and filled boxes, respectivelyWRKY57 蛋白質(zhì)特性在線軟件 ProtParam 對馬鈴薯 StWRKY57 所編碼的蛋白的理化性質(zhì)進(jìn)行果表明該基因可以編碼 253 個氨基酸,蛋白的相對分子量為 28.72 kDa,點為 8.84,負(fù)電荷殘基總數(shù)(Asp+Glu)為 28 個,正電荷殘基總數(shù)s)為 33 個,分子式為 C1259H2015N353O396S9,原子總數(shù)為 4032,不穩(wěn)定.47,脂肪系數(shù)為 75.53,總平均親水性為-0.653,說明該蛋白為疏水性圖 2.2)。利用 TMAP 分析顯示該蛋白具有跨膜結(jié)構(gòu)(圖 2.3)。表 2.1 馬鈴薯 StWRKY57 蛋白氨基酸種類和數(shù)量Table 2.1 StWRKY57 of potato protein amino acid types and quantities殘基數(shù)量百分比(%)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]氮素對馬鈴薯品種東農(nóng)311產(chǎn)量及品質(zhì)的影響[J]. 田洵,魏峭嶸,梁曉麗,祁馳恒,石瑛. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2015(09)
[2]植物WRKY轉(zhuǎn)錄因子家族GroupⅡa基因研究進(jìn)展[J]. 羅昌國,袁啟鳳,裴曉紅,吳亞維,鄭偉,章鎮(zhèn). 熱帶作物學(xué)報. 2015(03)
[3]WRKY轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子在植物與病原體互作中的功能[J]. 伍林濤,萬謙,韓宏仕,奉斌,康公平,曾章麗. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2014(06)
[4]CryⅢA基因植物表達(dá)載體構(gòu)建及馬鈴薯遺傳轉(zhuǎn)化[J]. 尤佳,張寧,文義凱,吳家和,司懷軍,王蒂. 草業(yè)學(xué)報. 2014(01)
[5]苧麻WRKY轉(zhuǎn)錄因子的序列分析[J]. 付莉莉,劉頭明,朱四元,湯清明,唐守偉. 中國麻業(yè)科學(xué). 2013(03)
[6]植物MYB轉(zhuǎn)錄因子功能及調(diào)控機制研究進(jìn)展[J]. 左然,徐美玲,柴國華,周功克. 生命科學(xué). 2012(10)
[7]植物WRKY轉(zhuǎn)錄因子的結(jié)構(gòu)特點及其在植物防衛(wèi)反應(yīng)中的作用[J]. 賈翠玲,侯和勝. 天津農(nóng)業(yè)科學(xué). 2010(02)
[8]WRKY轉(zhuǎn)錄因子功能研究進(jìn)展[J]. 張娟. 西北植物學(xué)報. 2009(10)
[9]AP2/EREBP轉(zhuǎn)錄因子在植物發(fā)育和脅迫應(yīng)答中的作用[J]. 趙利鋒,柴團耀. 植物學(xué)通報. 2008(01)
[10]干旱脅迫對玉米幼苗生理特性的影響[J]. 張艷馥,沙偉,徐忠文. 種子. 2007(06)
博士論文
[1]馬鈴薯抗逆相關(guān)基因SnRK2家族的克隆與功能分析[D]. 毛娟.甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
碩士論文
[1]津田蕪菁花青素調(diào)控基因的克隆及轉(zhuǎn)化菊花的研究[D]. 劉振華.東北林業(yè)大學(xué) 2010
本文編號:3318971
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