目的了解廈門地區(qū)G9型A組輪狀病毒主要中和抗原VP7的編碼基因進(jìn)化遺傳變異與國內(nèi)外部分地區(qū)VP7基因的差異。方法 4株G9型A組輪狀病毒毒株來自廈門市兒童醫(yī)院腹瀉患兒的糞便樣本,采集時(shí)間分別為2017年10月5日、2017年11月12日、2017年12月7日和2018年1月15日。采用反轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈反應(yīng)檢測(cè)G9型A組輪狀病毒VP7的基因全長序列,并用DNA Star、MEGA等生物學(xué)軟件對(duì)測(cè)序后獲得的基因序列進(jìn)行同源性分析、系統(tǒng)進(jìn)化分析,以及氨基酸序列比對(duì)。結(jié)果進(jìn)化樹分析顯示,廈門地區(qū)Amoy CHINA/2018地方株與成都市human/SC7/CHN/2013/G9地方株聯(lián)系最為密切,與江蘇省Hu/JS2016地方株同源性較遠(yuǎn)。氨基酸序列比對(duì)分析顯示,與參考株WI61相比,廈門地方株在氨基酸一級(jí)結(jié)構(gòu)上存在變異,包括D100N、Y144H,這兩個(gè)位點(diǎn)是進(jìn)化樹Amoy CHINA/2018簇內(nèi)的代表性變異位點(diǎn)。結(jié)論 G9型A組輪狀病毒VP7的基因組全長序列顯示該病毒株在我國存在進(jìn)化變異。 

【文章來源】：中華傳染病雜志. 2020,38(12)CSCD

【文章頁數(shù)】：4 頁


本文編號(hào)：3318109