廈門地區(qū)G9型A組輪狀病毒7基因序列特征的分析
發(fā)布時間:2021-08-02 19:06
目的了解廈門地區(qū)G9型A組輪狀病毒主要中和抗原VP7的編碼基因進化遺傳變異與國內(nèi)外部分地區(qū)VP7基因的差異。方法 4株G9型A組輪狀病毒毒株來自廈門市兒童醫(yī)院腹瀉患兒的糞便樣本,采集時間分別為2017年10月5日、2017年11月12日、2017年12月7日和2018年1月15日。采用反轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈反應(yīng)檢測G9型A組輪狀病毒VP7的基因全長序列,并用DNA Star、MEGA等生物學(xué)軟件對測序后獲得的基因序列進行同源性分析、系統(tǒng)進化分析,以及氨基酸序列比對。結(jié)果進化樹分析顯示,廈門地區(qū)Amoy CHINA/2018地方株與成都市human/SC7/CHN/2013/G9地方株聯(lián)系最為密切,與江蘇省Hu/JS2016地方株同源性較遠。氨基酸序列比對分析顯示,與參考株WI61相比,廈門地方株在氨基酸一級結(jié)構(gòu)上存在變異,包括D100N、Y144H,這兩個位點是進化樹Amoy CHINA/2018簇內(nèi)的代表性變異位點。結(jié)論 G9型A組輪狀病毒VP7的基因組全長序列顯示該病毒株在我國存在進化變異。
【文章來源】:中華傳染病雜志. 2020,38(12)CSCD
【文章頁數(shù)】:4 頁
本文編號:3318109
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