杜仲橡膠生物合成相關(guān)microRNA及其靶基因的鑒定與功能分析
發(fā)布時間:2021-08-02 14:58
天然橡膠是一種類異戊二烯聚合物。據(jù)2019年統(tǒng)計,全球?qū)μ烊幌鹉z的年需求量已達到3000萬噸,且仍在穩(wěn)步增長。巴西橡膠樹(Hevea brasiliensis Mull.Arg.)作為天然橡膠的主要來源,由于其易受病蟲害危害且分布范圍窄的缺點,導致橡膠產(chǎn)業(yè)面臨著嚴峻挑戰(zhàn)。杜仲橡膠是一種具有橡膠和塑料雙重特性的反式聚異戊二烯,其開發(fā)的新型材料具有高絕緣性和耐酸堿腐蝕等優(yōu)點。并且杜仲(Eucommia ulmoides Oliver)的適應(yīng)性強,分布范圍廣、種植面積大,生產(chǎn)的反式膠質(zhì)量好,是國際上公認的可以替代巴西橡膠樹的膠源樹種,是我國橡膠工業(yè)持續(xù)發(fā)展的重要保障。弄清楚杜仲橡膠合成的分子調(diào)控機理有利于使用分子育種技術(shù)提高杜仲中杜仲橡膠的含量。然而,杜仲橡膠生物合成機制非常復雜,相關(guān)的研究還非常有限。本研究利用高通量測序技術(shù)對高產(chǎn)膠杜仲品種“秦仲2號”和低產(chǎn)膠杜仲品種“小葉”的葉片進行轉(zhuǎn)錄組測序、sRNA測序及降解組測序和分析,從全基因組范圍內(nèi)分析miRNA與mRNA之間的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。利用RLM-5’RACE技術(shù)和農(nóng)桿菌介導的煙草瞬時共轉(zhuǎn)化技術(shù)分別證實了n-eu-miR15與其靶基因GGPS...
【文章來源】:西北農(nóng)林科技大學陜西省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:143 頁
【學位級別】:博士
【部分圖文】:
植物miRNA的生物合成(Barteletal.2004)
圖 2-1 11 個候選內(nèi)參基因的 PCR 擴增產(chǎn)物注:泳道 1 ~ 12:50 bp Maker、TUA、18S rRNA、ACT97、ACT、HIS4、HIS2B、TUB、UBC、UBA52、UB和 UBC E2。Fig. 2-1 PCR amplification products of eleven candidate reference genes.Note: Lane 1 ~ 12:50 bp Maker, TUA, 18S rRNA, ACT97, ACT, HIS4, HIS2B, TUB, UBC, UBA52, UBA80, and UE2.
圖 2-1 11 個候選內(nèi)參基因的 PCR 擴增產(chǎn)物注:泳道 1 ~ 12:50 bp Maker、TUA、18S rRNA、ACT97、ACT、HIS4、HIS2B、TUB、UBC、UBA52、UBA和 UBC E2。Fig. 2-1 PCR amplification products of eleven candidate reference genes.Note: Lane 1 ~ 12:50 bp Maker, TUA, 18S rRNA, ACT97, ACT, HIS4, HIS2B, TUB, UBC, UBA52, UBA80, and UBE2.
【參考文獻】:
期刊論文
[1]2019全球橡膠需求增至3000萬噸[J]. 錢伯章. 現(xiàn)代橡膠技術(shù). 2019(04)
[2]利用geNorm、NormFinder和BestKeeper軟件進行內(nèi)參基因穩(wěn)定性分析的方法[J]. 吳建陽,何冰,杜玉潔,李偉才,魏永贊. 現(xiàn)代農(nóng)業(yè)科技. 2017(05)
[3]杜仲膠累積與異戊二烯代謝途徑相關(guān)基因表達關(guān)系研究[J]. 莫俊,趙德剛. 山地農(nóng)業(yè)生物學報. 2014(03)
[4]雷公藤1-脫氧-D-木酮糖-5-磷酸還原酶基因(TwDXR)的克隆與表達分析[J]. 祝傳書,陳欣,郭嘉,繆國鵬,馮俊濤,張興. 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學報. 2014(03)
[5]基于杜仲轉(zhuǎn)錄組序列的SSR分子標記的開發(fā)[J]. 黃海燕,杜紅巖,烏云塔娜,劉攀峰. 林業(yè)科學. 2013(05)
[6]杜仲膠在杜仲葉發(fā)育過程中的含量變化研究[J]. 趙紅艷,藺芳,王太霞. 湖北農(nóng)業(yè)科學. 2012(18)
[7]Conservation and Diversity of MicroRNA-associated Copper-regulatory Networks in Populus trichocarpa[J]. Vincent L.Chiang. Journal of Integrative Plant Biology. 2011(11)
[8]油茶乙酰CoA;D(zhuǎn)移酶基因cDNA克隆及序列特征分析[J]. 張琳,譚曉風,胡姣,姚小華,林萍. 中南林業(yè)科技大學學報. 2011(08)
[9]一個樹種的國家戰(zhàn)略[J]. 黎云昆. 中國林業(yè)產(chǎn)業(yè). 2011(07)
[10]32種果樹microRNA的生物信息學預測與分析[J]. 宋長年,賈啟東,王晨,李飛,章鎮(zhèn),房經(jīng)貴. 園藝學報. 2010(06)
博士論文
[1]早實核桃雌花芽分化關(guān)鍵microRNA及其靶基因的識別、鑒定與表達分析[D]. 周麗.石河子大學 2019
[2]黃瓜響應(yīng)棒孢葉斑病菌侵染的轉(zhuǎn)錄組和microRNAs解析[D]. 王翔宇.沈陽農(nóng)業(yè)大學 2018
[3]杜仲膠生物合成的關(guān)鍵基因作用模式及非編碼RNA調(diào)控研究[D]. 劉慧敏.中國林業(yè)科學研究院 2018
[4]馬鈴薯光誘導糖苷生物堿代謝相關(guān)miRNAs的鑒定與功能分析[D]. 喬巖.甘肅農(nóng)業(yè)大學 2017
[5]受松—楊柵銹菌侵染的楊樹miRNA表達特征及其調(diào)控作用[D]. 陳敏.西北農(nóng)林科技大學 2017
[6]杜仲基因組分析及適應(yīng)性和橡膠生物合成的分子基礎(chǔ)研究[D]. 王淋.中國林業(yè)科學研究院 2017
[7]參與柑橘果實發(fā)育的miRNA和靶基因的挖掘與分析[D]. 劉元龍.華中農(nóng)業(yè)大學 2015
[8]白菜花粉發(fā)育相關(guān)microRNA的篩選鑒定與功能研究[D]. 江建霞.浙江大學 2014
[9]‘金冠’蘋果miRNA克隆分析及Md-miRLn11靶向調(diào)控Md-NBS基因表達影響斑點落葉病抗性研究[D]. 馬超.中國農(nóng)業(yè)大學 2013
[10]葡萄microRNA及其靶基因的識別、鑒定及作用方式研究[D]. 王晨.南京農(nóng)業(yè)大學 2012
碩士論文
[1]受落葉松-楊柵銹菌侵染的川楊novel miRNA靶基因克隆及功能研究[D]. 劉欣.西北農(nóng)林科技大學 2019
[2]橡膠草GGPPS基因的克隆和功能分析[D]. 李永梅.石河子大學 2016
[3]杜仲基因組中橡膠合成相關(guān)基因的鑒定[D]. 劉慧敏.中南林業(yè)科技大學 2015
[4]華東葡萄‘白河-35-1’抗白粉病相關(guān)miRNA的鑒定[D]. 韓麗娟.西北農(nóng)林科技大學 2015
[5]杜仲橡膠合成相關(guān)酶基因的克隆及功能研究[D]. 王淋.中南林業(yè)科技大學 2014
[6]杜仲法尼基焦磷酸合成酶基因超量表達對含膠細胞的影響研究[D]. 趙丹.貴州大學 2009
[7]杜仲葉內(nèi)膠含量及分子質(zhì)量動態(tài)變化研究[D]. 張付遠.西北農(nóng)林科技大學 2008
本文編號:3317771
【文章來源】:西北農(nóng)林科技大學陜西省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:143 頁
【學位級別】:博士
【部分圖文】:
植物miRNA的生物合成(Barteletal.2004)
圖 2-1 11 個候選內(nèi)參基因的 PCR 擴增產(chǎn)物注:泳道 1 ~ 12:50 bp Maker、TUA、18S rRNA、ACT97、ACT、HIS4、HIS2B、TUB、UBC、UBA52、UB和 UBC E2。Fig. 2-1 PCR amplification products of eleven candidate reference genes.Note: Lane 1 ~ 12:50 bp Maker, TUA, 18S rRNA, ACT97, ACT, HIS4, HIS2B, TUB, UBC, UBA52, UBA80, and UE2.
圖 2-1 11 個候選內(nèi)參基因的 PCR 擴增產(chǎn)物注:泳道 1 ~ 12:50 bp Maker、TUA、18S rRNA、ACT97、ACT、HIS4、HIS2B、TUB、UBC、UBA52、UBA和 UBC E2。Fig. 2-1 PCR amplification products of eleven candidate reference genes.Note: Lane 1 ~ 12:50 bp Maker, TUA, 18S rRNA, ACT97, ACT, HIS4, HIS2B, TUB, UBC, UBA52, UBA80, and UBE2.
【參考文獻】:
期刊論文
[1]2019全球橡膠需求增至3000萬噸[J]. 錢伯章. 現(xiàn)代橡膠技術(shù). 2019(04)
[2]利用geNorm、NormFinder和BestKeeper軟件進行內(nèi)參基因穩(wěn)定性分析的方法[J]. 吳建陽,何冰,杜玉潔,李偉才,魏永贊. 現(xiàn)代農(nóng)業(yè)科技. 2017(05)
[3]杜仲膠累積與異戊二烯代謝途徑相關(guān)基因表達關(guān)系研究[J]. 莫俊,趙德剛. 山地農(nóng)業(yè)生物學報. 2014(03)
[4]雷公藤1-脫氧-D-木酮糖-5-磷酸還原酶基因(TwDXR)的克隆與表達分析[J]. 祝傳書,陳欣,郭嘉,繆國鵬,馮俊濤,張興. 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學報. 2014(03)
[5]基于杜仲轉(zhuǎn)錄組序列的SSR分子標記的開發(fā)[J]. 黃海燕,杜紅巖,烏云塔娜,劉攀峰. 林業(yè)科學. 2013(05)
[6]杜仲膠在杜仲葉發(fā)育過程中的含量變化研究[J]. 趙紅艷,藺芳,王太霞. 湖北農(nóng)業(yè)科學. 2012(18)
[7]Conservation and Diversity of MicroRNA-associated Copper-regulatory Networks in Populus trichocarpa[J]. Vincent L.Chiang. Journal of Integrative Plant Biology. 2011(11)
[8]油茶乙酰CoA;D(zhuǎn)移酶基因cDNA克隆及序列特征分析[J]. 張琳,譚曉風,胡姣,姚小華,林萍. 中南林業(yè)科技大學學報. 2011(08)
[9]一個樹種的國家戰(zhàn)略[J]. 黎云昆. 中國林業(yè)產(chǎn)業(yè). 2011(07)
[10]32種果樹microRNA的生物信息學預測與分析[J]. 宋長年,賈啟東,王晨,李飛,章鎮(zhèn),房經(jīng)貴. 園藝學報. 2010(06)
博士論文
[1]早實核桃雌花芽分化關(guān)鍵microRNA及其靶基因的識別、鑒定與表達分析[D]. 周麗.石河子大學 2019
[2]黃瓜響應(yīng)棒孢葉斑病菌侵染的轉(zhuǎn)錄組和microRNAs解析[D]. 王翔宇.沈陽農(nóng)業(yè)大學 2018
[3]杜仲膠生物合成的關(guān)鍵基因作用模式及非編碼RNA調(diào)控研究[D]. 劉慧敏.中國林業(yè)科學研究院 2018
[4]馬鈴薯光誘導糖苷生物堿代謝相關(guān)miRNAs的鑒定與功能分析[D]. 喬巖.甘肅農(nóng)業(yè)大學 2017
[5]受松—楊柵銹菌侵染的楊樹miRNA表達特征及其調(diào)控作用[D]. 陳敏.西北農(nóng)林科技大學 2017
[6]杜仲基因組分析及適應(yīng)性和橡膠生物合成的分子基礎(chǔ)研究[D]. 王淋.中國林業(yè)科學研究院 2017
[7]參與柑橘果實發(fā)育的miRNA和靶基因的挖掘與分析[D]. 劉元龍.華中農(nóng)業(yè)大學 2015
[8]白菜花粉發(fā)育相關(guān)microRNA的篩選鑒定與功能研究[D]. 江建霞.浙江大學 2014
[9]‘金冠’蘋果miRNA克隆分析及Md-miRLn11靶向調(diào)控Md-NBS基因表達影響斑點落葉病抗性研究[D]. 馬超.中國農(nóng)業(yè)大學 2013
[10]葡萄microRNA及其靶基因的識別、鑒定及作用方式研究[D]. 王晨.南京農(nóng)業(yè)大學 2012
碩士論文
[1]受落葉松-楊柵銹菌侵染的川楊novel miRNA靶基因克隆及功能研究[D]. 劉欣.西北農(nóng)林科技大學 2019
[2]橡膠草GGPPS基因的克隆和功能分析[D]. 李永梅.石河子大學 2016
[3]杜仲基因組中橡膠合成相關(guān)基因的鑒定[D]. 劉慧敏.中南林業(yè)科技大學 2015
[4]華東葡萄‘白河-35-1’抗白粉病相關(guān)miRNA的鑒定[D]. 韓麗娟.西北農(nóng)林科技大學 2015
[5]杜仲橡膠合成相關(guān)酶基因的克隆及功能研究[D]. 王淋.中南林業(yè)科技大學 2014
[6]杜仲法尼基焦磷酸合成酶基因超量表達對含膠細胞的影響研究[D]. 趙丹.貴州大學 2009
[7]杜仲葉內(nèi)膠含量及分子質(zhì)量動態(tài)變化研究[D]. 張付遠.西北農(nóng)林科技大學 2008
本文編號:3317771
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