黃連木抗逆基因PcHsf及PcHsp70-90的功能探究
發(fā)布時間:2021-07-27 07:57
中國黃連木(Pistacia chinensis Bunge.)是我國特有的重要生物能源樹種,其結(jié)果壽命長,但結(jié)實率低且果實單產(chǎn)量低,雌雄異株被認為是其低產(chǎn)的主因。項目組在調(diào)查中發(fā)現(xiàn)雌雄同株黃連木資源,雌雄同株黃連木可進行自花授粉,打破了雌雄異株低產(chǎn)的瓶頸。為了探明黃連木性別決定機制并將雌雄同株資源投入實際生產(chǎn)中,項目組選取各性別表型分化關(guān)鍵期進行轉(zhuǎn)錄組、small RNA和蛋白的關(guān)聯(lián)分析,篩選到部分影響性別決定的基因和蛋白,其中與抗逆相關(guān)的HSF和HSP家族與中國黃連木花發(fā)育關(guān)系密切。本研究為了進一步探究黃連木PcHsf和PcHsp70-90基因的功能,以期揭示黃連木花發(fā)育過程中對逆境的響應(yīng)機制。主要結(jié)果有:1. 成功克隆了PcHsf和PcHsp70-90基因,并對基因全長序列進行了生物信息學分析,對PcHsf和PcHsp70-90蛋白進行氨基酸多重序列比對和系統(tǒng)進化樹分析得出,PcHsf蛋白與柑橘(Gossypium arboreum)親緣關(guān)系最近,PcHsp70-90蛋白與中華柑桔(Citrus sinensis)親緣性性較高。2. 構(gòu)建了35S::PcHsf、35S::PcHs...
【文章來源】:北京林業(yè)大學北京市 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:68 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
PcHsf和PcHsp70-90的PCR擴增Figure3.1PCRamplificationofPcHsfandPcHsp70-90
結(jié)果和分析21A:markerDL2000及PcHsf;B:markerDL10000及PcHsp70-90A:markerDL2000andPcHsf;B:markerDL10000andPcHsp70-903.2PcHsf和PcHsp70-90基因的生物信息學分析3.2.1基因全長cDNA序列分析利用NACI在線程序ORFFinder進行開放閱讀框分析,PcHsf的核苷酸序列全長為859bp,其最大ORF長度為819bp,預(yù)測編碼273個氨基酸的蛋白質(zhì)。圖3.2中紅色圓圈代表起始密碼子,氨基酸序列起始位置為41,終止位置為859。利用在線軟件Protparam推測分子質(zhì)量為30.37kD,包含氨基酸種類20種,稍微豐富的有賴氨酸Lys(K:9.9%)、絲氨酸Ser(S:9.5%)、天冬氨酸Asp(D:8.8%),理論等電點(pI)為7.55,帶正電氨基酸殘基總數(shù)(Arg+Lys)為41總平均親疏水系數(shù)為-0.708。紅色圓圈代表起始密碼子;綠色圓圈代表終止密碼子。圖3.2PcHsf基因cDNA全長ORF分析Figure3.2ORFanalysisoffull-lengthcDNAofPcHsfgene同上述方法對PcHsp70-90進行序列分析,該基因的核苷酸序列全長為1734bp,其最大ORF長度為1605bp,預(yù)測編碼534個氨基酸的蛋白質(zhì)。圖3.3中紅色圓圈代表起始密碼子,氨基酸序列起始位置為1,綠色圓圈代表終止密碼子,終止位置為1605。利用Protparam在線軟件推測分子質(zhì)量為60.49kD,包含氨基酸種類20種,稍微豐
黃連木花發(fā)育相關(guān)基因PcHsf及PcHsp70-90的功能探究22富的有Ala(A:12.4%),Glu(E:11.4%),Lys(K:11.4%),理論等電點(pI)為6.54,帶正電氨基酸殘基總數(shù)(Arg+Lys)為90總平均親疏水系數(shù)為-0.888。紅色圓圈代表起始密碼子;綠色圓圈代表終止密碼子。圖3.3PcHsp70-90基因cDNA全長ORF分析Figure3.3Full-lengthORFanalysisofPcHsp70-90genecDNA3.2.2蛋白的親/疏水性預(yù)測分析根據(jù)PcHsf和PcHsp70-90蛋白進行親/疏水性分析(圖3.4):PcHsf蛋白多肽鏈第184位具有最高分值1.933,疏水性最強,第238位具有最低分值-3.233,親水性最
本文編號:3305403
【文章來源】:北京林業(yè)大學北京市 211工程院校 教育部直屬院校
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【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
PcHsf和PcHsp70-90的PCR擴增Figure3.1PCRamplificationofPcHsfandPcHsp70-90
結(jié)果和分析21A:markerDL2000及PcHsf;B:markerDL10000及PcHsp70-90A:markerDL2000andPcHsf;B:markerDL10000andPcHsp70-903.2PcHsf和PcHsp70-90基因的生物信息學分析3.2.1基因全長cDNA序列分析利用NACI在線程序ORFFinder進行開放閱讀框分析,PcHsf的核苷酸序列全長為859bp,其最大ORF長度為819bp,預(yù)測編碼273個氨基酸的蛋白質(zhì)。圖3.2中紅色圓圈代表起始密碼子,氨基酸序列起始位置為41,終止位置為859。利用在線軟件Protparam推測分子質(zhì)量為30.37kD,包含氨基酸種類20種,稍微豐富的有賴氨酸Lys(K:9.9%)、絲氨酸Ser(S:9.5%)、天冬氨酸Asp(D:8.8%),理論等電點(pI)為7.55,帶正電氨基酸殘基總數(shù)(Arg+Lys)為41總平均親疏水系數(shù)為-0.708。紅色圓圈代表起始密碼子;綠色圓圈代表終止密碼子。圖3.2PcHsf基因cDNA全長ORF分析Figure3.2ORFanalysisoffull-lengthcDNAofPcHsfgene同上述方法對PcHsp70-90進行序列分析,該基因的核苷酸序列全長為1734bp,其最大ORF長度為1605bp,預(yù)測編碼534個氨基酸的蛋白質(zhì)。圖3.3中紅色圓圈代表起始密碼子,氨基酸序列起始位置為1,綠色圓圈代表終止密碼子,終止位置為1605。利用Protparam在線軟件推測分子質(zhì)量為60.49kD,包含氨基酸種類20種,稍微豐
黃連木花發(fā)育相關(guān)基因PcHsf及PcHsp70-90的功能探究22富的有Ala(A:12.4%),Glu(E:11.4%),Lys(K:11.4%),理論等電點(pI)為6.54,帶正電氨基酸殘基總數(shù)(Arg+Lys)為90總平均親疏水系數(shù)為-0.888。紅色圓圈代表起始密碼子;綠色圓圈代表終止密碼子。圖3.3PcHsp70-90基因cDNA全長ORF分析Figure3.3Full-lengthORFanalysisofPcHsp70-90genecDNA3.2.2蛋白的親/疏水性預(yù)測分析根據(jù)PcHsf和PcHsp70-90蛋白進行親/疏水性分析(圖3.4):PcHsf蛋白多肽鏈第184位具有最高分值1.933,疏水性最強,第238位具有最低分值-3.233,親水性最
本文編號:3305403
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