發(fā)布時(shí)間：2021-07-23 11:47

　　雌穗是玉米獲得高產(chǎn)的關(guān)鍵部位,授粉后雌穗發(fā)育速度快,因此通過(guò)對(duì)玉米雌穗授粉前后基因表達(dá)差異變化及發(fā)育相關(guān)基因的研究,對(duì)雌穗在這一時(shí)期的生長(zhǎng)發(fā)育調(diào)控和代謝機(jī)制有著重要意義。microRNA（miRNA）是一類小分子非編碼單鏈RNA,長(zhǎng)度約22個(gè)堿基,在植物的發(fā)育、代謝以及適應(yīng)不同程度的脅迫反應(yīng)過(guò)程中等都發(fā)揮重要作用。本研究基于HiSeq高通量測(cè)序技術(shù)并結(jié)合生物信息學(xué)方法對(duì)X178和掖478兩種材料授粉前后雌穗轉(zhuǎn)錄組（RNA-seq）及小分子RNA（small RNA-seq）表達(dá)變化進(jìn)行研究。通過(guò)差異表達(dá)倍數(shù)篩選出授粉前后差異表達(dá)的mRNA和miRNA,利用miRNA與靶點(diǎn)mRNA存在負(fù)調(diào)控的關(guān)系,建立miRNA-靶mRNA的對(duì)應(yīng)關(guān)系,對(duì)靶點(diǎn)及其miRNA進(jìn)行GO分析和KEGG通路分析。本研究最終得到8個(gè)候選基因,這些基因可能在授粉前后雌穗發(fā)育過(guò)程中起重要作用,為后續(xù)雌穗授粉前后發(fā)育過(guò)程的研究提供一些理論參考。研究結(jié)果如下:1.通過(guò)對(duì)RNA-seq分析,得到X178授粉前后差異表達(dá)基因11336個(gè),掖478授粉前后差異表達(dá)基因8721個(gè)（FDR≤0.001,|log₂

【文章來(lái)源】：沈陽(yáng)農(nóng)業(yè)大學(xué)遼寧省

【文章頁(yè)數(shù)】：67 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

植物miRNA的生物合成過(guò)程（kidner，2005）

miRNA-RNAseq聯(lián)合分析篩選步驟Fig.2ScreeningstepsformiRNA-RNAseqanalyse

圖 6 X148 中授粉前后 RNA 運(yùn)輸路徑情況 RNAtransport before and after pollination in注：xnnp-xnp，綠色代表上調(diào)，紅色代表下調(diào)。: xnnp-xnp，Green means up regulated，Red means down regu

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]玉米雌穗發(fā)育雜種優(yōu)勢(shì)相關(guān)miRNA的研究[J]. 王琪月,孟淑君,張柯,張戰(zhàn)輝,湯繼華,丁冬.  作物學(xué)報(bào). 2018(06)
[2]植物miR172及其靶基因調(diào)控開(kāi)花與發(fā)育的研究進(jìn)展[J]. 趙曉暉,孔凡江,劉寶輝.  黑龍江農(nóng)業(yè)科學(xué). 2017(02)
[3]主要農(nóng)作物產(chǎn)量性狀形成的分子基礎(chǔ)研究與展望[J]. 劉倩,傅向東.  植物生理學(xué)報(bào). 2016(12)
[4]基于深度測(cè)序技術(shù)的RNA編輯調(diào)控研究[J]. 楊欣壯,丁晚秋,陳加余,李川昀.  生命科學(xué)儀器. 2016(Z1)
[5]植物MicroRNA研究進(jìn)展[J]. 鄭海澤,張紅芳.  山西林業(yè)科技. 2015(03)
[6]miRNA在植物種子發(fā)育過(guò)程中的作用[J]. 龔淑敏,丁艷菲,朱誠(chéng).  遺傳. 2015(06)
[7]植物miRNA的研究方法概述[J]. 易小婭,楊瑞瑞,曾幼玲.  植物生理學(xué)報(bào). 2015(04)
[8]高通量測(cè)序技術(shù)的發(fā)展及其在生命科學(xué)中的應(yīng)用[J]. 杜玲,劉剛,陸健,劉丑生,哈福.  中國(guó)畜牧獸醫(yī). 2014(12)
[9]植物體內(nèi)調(diào)控miRNA合成與功能的機(jī)制研究進(jìn)展[J]. 熊雪梅,吳瑩,王洋.  植物研究. 2014(02)
[10]植物Cu,Zn-SOD分子調(diào)控機(jī)理研究進(jìn)展[J]. 姚婕,趙艷玲.  熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué). 2014(03)

博士論文
[1]白菜花粉發(fā)育和授粉受精相關(guān)基因的表達(dá)分析與功能驗(yàn)證[D]. 蔣晶晶.浙江大學(xué) 2012
[2]雙胚苗水稻中單倍體與二倍體表型和基因表達(dá)的差異分析[D]. 張紅宇.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2006

碩士論文
[1]玉米穗發(fā)育對(duì)高溫脅迫的響應(yīng)[D]. 于康珂.河南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[2]玉米miR169及其靶基因NF-YA轉(zhuǎn)錄因子功能的初步研究[D]. 欒明達(dá).西南科技大學(xué) 2014
[3]半夏miRNA的檢測(cè)及其靶基因的鑒定[D]. 董淼.浙江理工大學(xué) 2013
[4]白菜花粉發(fā)育與授粉受精相關(guān)基因BcAHA8的表達(dá)分析及BcSKS11的功能鑒定[D]. 邱琳.浙江大學(xué) 2012



本文編號(hào)：3299234