雌穗是玉米獲得高產(chǎn)的關(guān)鍵部位,授粉后雌穗發(fā)育速度快,因此通過對玉米雌穗授粉前后基因表達(dá)差異變化及發(fā)育相關(guān)基因的研究,對雌穗在這一時期的生長發(fā)育調(diào)控和代謝機(jī)制有著重要意義。microRNA（miRNA）是一類小分子非編碼單鏈RNA,長度約22個堿基,在植物的發(fā)育、代謝以及適應(yīng)不同程度的脅迫反應(yīng)過程中等都發(fā)揮重要作用。本研究基于HiSeq高通量測序技術(shù)并結(jié)合生物信息學(xué)方法對X178和掖478兩種材料授粉前后雌穗轉(zhuǎn)錄組（RNA-seq）及小分子RNA（small RNA-seq）表達(dá)變化進(jìn)行研究。通過差異表達(dá)倍數(shù)篩選出授粉前后差異表達(dá)的mRNA和miRNA,利用miRNA與靶點(diǎn)mRNA存在負(fù)調(diào)控的關(guān)系,建立miRNA-靶mRNA的對應(yīng)關(guān)系,對靶點(diǎn)及其miRNA進(jìn)行GO分析和KEGG通路分析。本研究最終得到8個候選基因,這些基因可能在授粉前后雌穗發(fā)育過程中起重要作用,為后續(xù)雌穗授粉前后發(fā)育過程的研究提供一些理論參考。研究結(jié)果如下:1.通過對RNA-seq分析,得到X178授粉前后差異表達(dá)基因11336個,掖478授粉前后差異表達(dá)基因8721個（FDR≤0.001,|log₂

【文章來源】：沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué)遼寧省

【文章頁數(shù)】：67 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

植物miRNA的生物合成過程（kidner，2005）

miRNA-RNAseq聯(lián)合分析篩選步驟Fig.2ScreeningstepsformiRNA-RNAseqanalyse

圖 6 X148 中授粉前后 RNA 運(yùn)輸路徑情況 RNAtransport before and after pollination in注：xnnp-xnp，綠色代表上調(diào)，紅色代表下調(diào)。: xnnp-xnp，Green means up regulated，Red means down regu

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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碩士論文
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本文編號：3299234