榅桲C4H基因的克隆、序列分析及表達(dá)
發(fā)布時間:2021-07-23 09:45
【目的】肉桂酸-4-羥化酶(cinnamate 4-hydroxylase,C4H)是調(diào)節(jié)木質(zhì)素合成的關(guān)鍵基因,榅桲是新疆特色經(jīng)濟(jì)果樹之一。目前,有關(guān)榅桲C4H基因的序列信息尚不明確。為了獲得該基因的序列信息及其在果實(shí)不同發(fā)育時期的差異性表達(dá)規(guī)律,為深入研究該基因在榅桲果實(shí)發(fā)育過程中的作用和功能奠定基礎(chǔ)!痉椒ā恳詷X桲果實(shí)為研究材料,基于GenBank已登錄近源物種的C4H基因的cDNA序列,提取其果實(shí)的總RNA并反轉(zhuǎn)錄為cDNA,利用同源克隆的方法獲得榅桲C4H基因的cDNA序列,并對該序列進(jìn)行生物信息學(xué)分析,同時檢測在榅桲果實(shí)開花后不同時間點(diǎn)C4H基因表達(dá)量的差異!窘Y(jié)果】同源克隆結(jié)果表明:C4H基因編碼區(qū)的序列全長為1 518 bp,編碼505個氨基酸,其蛋白的分子質(zhì)量為58.28 kD。生物信息學(xué)分析結(jié)果顯示:榅桲C4H蛋白為親水性不穩(wěn)定蛋白質(zhì),其二級結(jié)構(gòu)以α-螺旋和無規(guī)卷曲結(jié)構(gòu)為主。系統(tǒng)進(jìn)化分析結(jié)果顯示:榅桲C4H蛋白與甜櫻桃(Prunus avium,XP021806844.1)、山杏(Prunus armeniaca,VVA16404.1)的C4H蛋...
【文章來源】:經(jīng)濟(jì)林研究. 2020,38(02)北大核心
【文章頁數(shù)】:8 頁
【部分圖文】:
榅桲C4H基因同源性對比分析結(jié)果
榅桲C4H蛋白的進(jìn)化樹
榅桲C4H蛋白疏水/親水性分析結(jié)果如圖3所示。圖3表明,在榅桲C4H蛋白氨基酸中,第17與第19位氨基酸殘基的疏水性均最強(qiáng)(分別為3.600和3.578),第127與第196位氨基酸殘基的親水性均最強(qiáng)(分別為-3.067和-2.722);另外,在該蛋白中親水氨基酸的數(shù)量遠(yuǎn)高于疏水氨基酸的數(shù)量,由此推斷,榅桲C4H蛋白為親水性蛋白。2.3.3 榅桲C4H基因編碼蛋白二級結(jié)構(gòu)和三級結(jié)構(gòu)的預(yù)測
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]國內(nèi)榅桲種質(zhì)資源研究現(xiàn)狀[J]. 羅華,郝兆祥,張忠濤,畢潤霞,陳穎. 山西果樹. 2018(06)
[2]苦蕎C4H基因的cDNA克隆及生物信息學(xué)分析[J]. 劉榮華,王麗,孫朝霞,侯思宇,李紅英. 山西農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2017(11)
[3]梨屬植物果肉和石細(xì)胞團(tuán)木質(zhì)素相關(guān)性分析[J]. 田路明,董星光,曹玉芬,張瑩,齊丹. 西南農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2017(09)
[4]芒果C4H基因的克隆及其表達(dá)分析[J]. 劉寬亮,趙志常,高愛平,陳業(yè)淵,黃建峰,黨志國,羅睿雄. 江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2017(14)
[5]基于SPME-GC-MS法分析4種榅桲果實(shí)香氣成分[J]. 車玉紅,吳津蓉,郭春苗,楊波. 中國農(nóng)學(xué)通報. 2017(19)
[6]維藥榅桲葉總黃酮對血糖、肝功能和脂代謝紊亂的影響[J]. 帕克提娜依·帕塔爾,阿迪力·阿不都熱合曼,努爾買買提·吐爾孫,齊曼古麗·薩拉木,秦浩,余順杰,鄔利婭·伊明,艾尼瓦爾·吾買爾. 新疆醫(yī)科大學(xué)學(xué)報. 2016(07)
[7]桂花C4H基因的克隆與表達(dá)特性分析[J]. 曾祥玲,鄭日如,羅靖,王彩云. 園藝學(xué)報. 2016(03)
[8]新疆莎車大果榅桲果實(shí)營養(yǎng)分析及評價[J]. 車玉紅,楊波,艾沙江·買買提,郭春苗,張軍,馬文鵬,蔣平. 食品工業(yè)科技. 2015(24)
[9]榅桲總黃酮降壓作用及抗炎機(jī)制的實(shí)驗(yàn)研究[J]. 周文婷,鄔利婭·伊明,馬虎,古再努爾·買買提,艾尼瓦爾·吾買爾. 中藥材. 2015(10)
[10]維藥榅桲多糖抗血栓作用及其機(jī)制研究[J]. 美合日阿依·伊薩克,馬虎,周文婷,艾尼瓦爾·吾買爾. 中國藥理學(xué)通報. 2015(02)
本文編號:3298949
【文章來源】:經(jīng)濟(jì)林研究. 2020,38(02)北大核心
【文章頁數(shù)】:8 頁
【部分圖文】:
榅桲C4H基因同源性對比分析結(jié)果
榅桲C4H蛋白的進(jìn)化樹
榅桲C4H蛋白疏水/親水性分析結(jié)果如圖3所示。圖3表明,在榅桲C4H蛋白氨基酸中,第17與第19位氨基酸殘基的疏水性均最強(qiáng)(分別為3.600和3.578),第127與第196位氨基酸殘基的親水性均最強(qiáng)(分別為-3.067和-2.722);另外,在該蛋白中親水氨基酸的數(shù)量遠(yuǎn)高于疏水氨基酸的數(shù)量,由此推斷,榅桲C4H蛋白為親水性蛋白。2.3.3 榅桲C4H基因編碼蛋白二級結(jié)構(gòu)和三級結(jié)構(gòu)的預(yù)測
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]國內(nèi)榅桲種質(zhì)資源研究現(xiàn)狀[J]. 羅華,郝兆祥,張忠濤,畢潤霞,陳穎. 山西果樹. 2018(06)
[2]苦蕎C4H基因的cDNA克隆及生物信息學(xué)分析[J]. 劉榮華,王麗,孫朝霞,侯思宇,李紅英. 山西農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2017(11)
[3]梨屬植物果肉和石細(xì)胞團(tuán)木質(zhì)素相關(guān)性分析[J]. 田路明,董星光,曹玉芬,張瑩,齊丹. 西南農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2017(09)
[4]芒果C4H基因的克隆及其表達(dá)分析[J]. 劉寬亮,趙志常,高愛平,陳業(yè)淵,黃建峰,黨志國,羅睿雄. 江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2017(14)
[5]基于SPME-GC-MS法分析4種榅桲果實(shí)香氣成分[J]. 車玉紅,吳津蓉,郭春苗,楊波. 中國農(nóng)學(xué)通報. 2017(19)
[6]維藥榅桲葉總黃酮對血糖、肝功能和脂代謝紊亂的影響[J]. 帕克提娜依·帕塔爾,阿迪力·阿不都熱合曼,努爾買買提·吐爾孫,齊曼古麗·薩拉木,秦浩,余順杰,鄔利婭·伊明,艾尼瓦爾·吾買爾. 新疆醫(yī)科大學(xué)學(xué)報. 2016(07)
[7]桂花C4H基因的克隆與表達(dá)特性分析[J]. 曾祥玲,鄭日如,羅靖,王彩云. 園藝學(xué)報. 2016(03)
[8]新疆莎車大果榅桲果實(shí)營養(yǎng)分析及評價[J]. 車玉紅,楊波,艾沙江·買買提,郭春苗,張軍,馬文鵬,蔣平. 食品工業(yè)科技. 2015(24)
[9]榅桲總黃酮降壓作用及抗炎機(jī)制的實(shí)驗(yàn)研究[J]. 周文婷,鄔利婭·伊明,馬虎,古再努爾·買買提,艾尼瓦爾·吾買爾. 中藥材. 2015(10)
[10]維藥榅桲多糖抗血栓作用及其機(jī)制研究[J]. 美合日阿依·伊薩克,馬虎,周文婷,艾尼瓦爾·吾買爾. 中國藥理學(xué)通報. 2015(02)
本文編號:3298949
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