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榅桲C4H基因的克隆、序列分析及表達

發(fā)布時間:2021-07-23 09:45
  【目的】肉桂酸-4-羥化酶(cinnamate 4-hydroxylase,C4H)是調節(jié)木質素合成的關鍵基因,榅桲是新疆特色經(jīng)濟果樹之一。目前,有關榅桲C4H基因的序列信息尚不明確。為了獲得該基因的序列信息及其在果實不同發(fā)育時期的差異性表達規(guī)律,為深入研究該基因在榅桲果實發(fā)育過程中的作用和功能奠定基礎。【方法】以榅桲果實為研究材料,基于GenBank已登錄近源物種的C4H基因的cDNA序列,提取其果實的總RNA并反轉錄為cDNA,利用同源克隆的方法獲得榅桲C4H基因的cDNA序列,并對該序列進行生物信息學分析,同時檢測在榅桲果實開花后不同時間點C4H基因表達量的差異。【結果】同源克隆結果表明:C4H基因編碼區(qū)的序列全長為1 518 bp,編碼505個氨基酸,其蛋白的分子質量為58.28 kD。生物信息學分析結果顯示:榅桲C4H蛋白為親水性不穩(wěn)定蛋白質,其二級結構以α-螺旋和無規(guī)卷曲結構為主。系統(tǒng)進化分析結果顯示:榅桲C4H蛋白與甜櫻桃(Prunus avium,XP021806844.1)、山杏(Prunus armeniaca,VVA16404.1)的C4H蛋... 

【文章來源】:經(jīng)濟林研究. 2020,38(02)北大核心

【文章頁數(shù)】:8 頁

【部分圖文】:

榅桲C4H基因的克


榅桲C4H基因同源性對比分析結果

分析結果圖,進化樹,蛋白,基因


榅桲C4H蛋白的進化樹

蛋白,親水,疏水性,基因


榅桲C4H蛋白疏水/親水性分析結果如圖3所示。圖3表明,在榅桲C4H蛋白氨基酸中,第17與第19位氨基酸殘基的疏水性均最強(分別為3.600和3.578),第127與第196位氨基酸殘基的親水性均最強(分別為-3.067和-2.722);另外,在該蛋白中親水氨基酸的數(shù)量遠高于疏水氨基酸的數(shù)量,由此推斷,榅桲C4H蛋白為親水性蛋白。2.3.3 榅桲C4H基因編碼蛋白二級結構和三級結構的預測

【參考文獻】:
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