湖南部分養(yǎng)殖場豬、雞源糞腸球菌毒力基因、耐藥性及多位點序列分型研究
發(fā)布時間:2021-07-22 12:12
糞腸球菌(Enterococcus fascalis)是一種廣泛分布的機會致病菌,能夠引起人和動物的多種疾病。近年來,在抗生素的不合理使用下,糞腸球菌的耐藥現象日趨嚴重結合其眾多毒力基因與復雜的致病機制,使得糞腸球菌感染的臨床治療愈加困難。多位點序列分型(MLST)是一種簡單且具有高分辨率的分型方法,主要通過分析多個持家基因的核酸序列來完成對菌株的分型,它有一個專門的MLST數據庫,可實現對不同國家、地區(qū)菌株之間的信息交流,這為研究不同來源菌株的種群結構、耐藥特征及流行型別等之間的相關性奠定了一定基礎。本研究對湖南部分地區(qū)養(yǎng)殖場豬、雞源糞腸球菌進行分離與鑒定,并對分離株的毒力基因及耐藥性進行檢測,再使用MLST方法對部分多重耐藥菌株進行分型,以期初步了解該地區(qū)糞腸球菌的毒力基因攜帶情況、耐藥特征及多重耐藥株的流行型別,為指導糞腸球菌感染用藥提供一定依據。本次研究結果如下:共分離到81株糞腸球菌,分離率雞源(35.8%)高于豬源(28.4%);除esp外其余毒力基因均有檢測到,且85%以上的菌株攜帶兩種及兩種以上毒力基因;分離株對紅霉素、四環(huán)素以及頭孢西丁嚴重耐藥,對萬古霉素普遍敏感,多...
【文章來源】:湖南農業(yè)大學湖南省
【文章頁數】:63 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
糞腸球菌可疑株在腸球菌顯色培養(yǎng)基上的菌落特征
15腸球菌在顯色培養(yǎng)基上為紫紅色光澤菌落,見圖2-1;革蘭氏染色為陽性,且呈單個、成雙或短鏈狀排列,見圖2-2;根據糞腸球菌革蘭氏染色的結果和在腸球菌顯色培養(yǎng)基上的結果,可對糞腸球菌進行初步判定。圖2-1糞腸球菌可疑株在腸球菌顯色培養(yǎng)基上的菌落特征Fig2-1SuspiciousEnterococcusfaecalisonChromogenicmediumofEnterococcus圖2-2糞腸球菌可疑株革蘭氏染色鏡檢圖Fig2-2ThemicroscopicexaminatioofSuspiciousEnterococcusfaecalisbyGramstaining2.3.2糞腸球菌的PCR鑒定結果利用糞腸球菌特異性引物對分離到的可疑菌株進行PCR擴增及電泳,結果共有81株出現1097bp的目的條帶,將部分PCR產物送去測序,測序結果在NCBI網站上進行比對,同源性達98%以上。圖1-3為部分糞腸球菌分離株的PCR鑒定結果。
16圖2-3糞腸球菌分離株的PCR鑒定結果Fig1-3ThePCRresultsofEnterococcusfaecalisisolates注:M為DNA分子質量標準;1為ATCC29212菌株;2為陰性對照;3-10為分離株2.3.3不同地區(qū)糞腸球菌分離情況本次試驗共分離到糞腸球菌81株,其中包括豬源38株,雞源43株,總分離率雞源大于豬源;四個地區(qū)中,常德地區(qū)的樣本分離率最高,占40.0%,瀏陽及寧鄉(xiāng)地區(qū)次之,衡陽地區(qū)最低。具體分離情況見表1-3表1-3湖南省不同地區(qū)豬、雞源糞腸球菌分離結果Table1-3IsolationofEnterococcusfaecalisfrompigsandchickensindifferentareasofHunanProvince豬源Isolatedfrompigs雞源Isolatedfromchickens總計Total地區(qū)Area樣本數Numberofsamples分離數NumberofIsolation分離率Isolationrate/%樣本數Numberofsamples分離數NumberofIsolation分離率Isolationrate/%樣本數Numberofsamples分離數NumberofIsolation分離率Isolationrate/%寧鄉(xiāng)25832.0401230.0652030.8衡陽541425.9301033.3842428.6常德20525.0301550.0502040.0瀏陽351131.420630.0551730.9總計1343828.31204335.82548131.9
【參考文獻】:
期刊論文
[1]2012-2014年遼寧省大連市某醫(yī)院分離糞腸球菌耐藥性及多位點序列分析[J]. 李巖,王晶,張桂,楊晶,金東. 疾病監(jiān)測. 2018(05)
[2]新疆北疆地區(qū)豬源糞腸球菌的耐藥性分析[J]. 王蒙蒙,張子榮,歐都·吾吐那生,蒲敬偉,袁立崗,齊亞銀. 中國畜牧獸醫(yī). 2018(05)
[3]河南省部分地區(qū)豬和雞源糞腸球菌的分離鑒定與耐藥性分析[J]. 李金磊,董鵬,狄元冉,方忠意,高延玲,周紅霞,吳志明. 動物醫(yī)學進展. 2018(04)
[4]480株泌尿道感染腸球菌的分布以及耐藥性分析[J]. 侯景英. 抗感染藥學. 2018(01)
[5]江西省豬源糞腸球菌毒力基因及耐藥性分析[J]. 黃奕雯,幸文定,陶政,王萍. 中國獸醫(yī)學報. 2018(03)
[6]東北地區(qū)動物源糞腸球菌耐藥性監(jiān)測與分析[J]. 李延山,李欣南,韓鐫竹,高鐸,武鳳嬌. 現代畜牧獸醫(yī). 2018(02)
[7]糖尿病足患者感染病原菌及藥敏分析[J]. 張慧華,張慧,方水晶,徐惠,毛磊. 中華醫(yī)院感染學雜志. 2018(03)
[8]屎腸球菌和糞腸球菌多位點序列分型及耐藥相關性研究[J]. 鄒紹偉,王占黎,王英,牛海英,張利霞. 中國病原生物學雜志. 2018(01)
[9]2016年內蒙古包頭地區(qū)10家醫(yī)院腸球菌耐藥性監(jiān)測分析[J]. 張利霞,王翠峰,田改林,劉芳馨. 現代預防醫(yī)學. 2017(24)
[10]不同動物源腸球菌耐藥性及毒力基因測定與分析[J]. 陳麗穎,張留君,秦明明,陳飛,金鉞,胡慧,王亞賓. 中國人獸共患病學報. 2017(11)
碩士論文
[1]江西部分地區(qū)豬源糞腸球菌耐藥性及毒力基因檢測與分析[D]. 幸文定.江西農業(yè)大學 2016
[2]Ⅰ類整合子介導糞腸球菌多重耐藥性的研究[D]. 歐都·吾吐那生.石河子大學 2016
[3]動物源性腸球菌多位點序列分型及質粒檢測[D]. 張秀方.河南農業(yè)大學 2015
[4]糞腸球菌心內膜炎抗原EfaA在大鼠心內膜炎中的作用[D]. 王俠.福建醫(yī)科大學 2015
本文編號:3297132
【文章來源】:湖南農業(yè)大學湖南省
【文章頁數】:63 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
糞腸球菌可疑株在腸球菌顯色培養(yǎng)基上的菌落特征
15腸球菌在顯色培養(yǎng)基上為紫紅色光澤菌落,見圖2-1;革蘭氏染色為陽性,且呈單個、成雙或短鏈狀排列,見圖2-2;根據糞腸球菌革蘭氏染色的結果和在腸球菌顯色培養(yǎng)基上的結果,可對糞腸球菌進行初步判定。圖2-1糞腸球菌可疑株在腸球菌顯色培養(yǎng)基上的菌落特征Fig2-1SuspiciousEnterococcusfaecalisonChromogenicmediumofEnterococcus圖2-2糞腸球菌可疑株革蘭氏染色鏡檢圖Fig2-2ThemicroscopicexaminatioofSuspiciousEnterococcusfaecalisbyGramstaining2.3.2糞腸球菌的PCR鑒定結果利用糞腸球菌特異性引物對分離到的可疑菌株進行PCR擴增及電泳,結果共有81株出現1097bp的目的條帶,將部分PCR產物送去測序,測序結果在NCBI網站上進行比對,同源性達98%以上。圖1-3為部分糞腸球菌分離株的PCR鑒定結果。
16圖2-3糞腸球菌分離株的PCR鑒定結果Fig1-3ThePCRresultsofEnterococcusfaecalisisolates注:M為DNA分子質量標準;1為ATCC29212菌株;2為陰性對照;3-10為分離株2.3.3不同地區(qū)糞腸球菌分離情況本次試驗共分離到糞腸球菌81株,其中包括豬源38株,雞源43株,總分離率雞源大于豬源;四個地區(qū)中,常德地區(qū)的樣本分離率最高,占40.0%,瀏陽及寧鄉(xiāng)地區(qū)次之,衡陽地區(qū)最低。具體分離情況見表1-3表1-3湖南省不同地區(qū)豬、雞源糞腸球菌分離結果Table1-3IsolationofEnterococcusfaecalisfrompigsandchickensindifferentareasofHunanProvince豬源Isolatedfrompigs雞源Isolatedfromchickens總計Total地區(qū)Area樣本數Numberofsamples分離數NumberofIsolation分離率Isolationrate/%樣本數Numberofsamples分離數NumberofIsolation分離率Isolationrate/%樣本數Numberofsamples分離數NumberofIsolation分離率Isolationrate/%寧鄉(xiāng)25832.0401230.0652030.8衡陽541425.9301033.3842428.6常德20525.0301550.0502040.0瀏陽351131.420630.0551730.9總計1343828.31204335.82548131.9
【參考文獻】:
期刊論文
[1]2012-2014年遼寧省大連市某醫(yī)院分離糞腸球菌耐藥性及多位點序列分析[J]. 李巖,王晶,張桂,楊晶,金東. 疾病監(jiān)測. 2018(05)
[2]新疆北疆地區(qū)豬源糞腸球菌的耐藥性分析[J]. 王蒙蒙,張子榮,歐都·吾吐那生,蒲敬偉,袁立崗,齊亞銀. 中國畜牧獸醫(yī). 2018(05)
[3]河南省部分地區(qū)豬和雞源糞腸球菌的分離鑒定與耐藥性分析[J]. 李金磊,董鵬,狄元冉,方忠意,高延玲,周紅霞,吳志明. 動物醫(yī)學進展. 2018(04)
[4]480株泌尿道感染腸球菌的分布以及耐藥性分析[J]. 侯景英. 抗感染藥學. 2018(01)
[5]江西省豬源糞腸球菌毒力基因及耐藥性分析[J]. 黃奕雯,幸文定,陶政,王萍. 中國獸醫(yī)學報. 2018(03)
[6]東北地區(qū)動物源糞腸球菌耐藥性監(jiān)測與分析[J]. 李延山,李欣南,韓鐫竹,高鐸,武鳳嬌. 現代畜牧獸醫(yī). 2018(02)
[7]糖尿病足患者感染病原菌及藥敏分析[J]. 張慧華,張慧,方水晶,徐惠,毛磊. 中華醫(yī)院感染學雜志. 2018(03)
[8]屎腸球菌和糞腸球菌多位點序列分型及耐藥相關性研究[J]. 鄒紹偉,王占黎,王英,牛海英,張利霞. 中國病原生物學雜志. 2018(01)
[9]2016年內蒙古包頭地區(qū)10家醫(yī)院腸球菌耐藥性監(jiān)測分析[J]. 張利霞,王翠峰,田改林,劉芳馨. 現代預防醫(yī)學. 2017(24)
[10]不同動物源腸球菌耐藥性及毒力基因測定與分析[J]. 陳麗穎,張留君,秦明明,陳飛,金鉞,胡慧,王亞賓. 中國人獸共患病學報. 2017(11)
碩士論文
[1]江西部分地區(qū)豬源糞腸球菌耐藥性及毒力基因檢測與分析[D]. 幸文定.江西農業(yè)大學 2016
[2]Ⅰ類整合子介導糞腸球菌多重耐藥性的研究[D]. 歐都·吾吐那生.石河子大學 2016
[3]動物源性腸球菌多位點序列分型及質粒檢測[D]. 張秀方.河南農業(yè)大學 2015
[4]糞腸球菌心內膜炎抗原EfaA在大鼠心內膜炎中的作用[D]. 王俠.福建醫(yī)科大學 2015
本文編號:3297132
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