目的 :篩選肺動脈高壓發(fā)生的關(guān)鍵基因,推斷與肺動脈高壓相關(guān)的一些微小RNA（microRNA）功能,為進一步探索肺動脈高壓可能的潛在調(diào)控靶點提供理論依據(jù)。方法:從基因表達(dá)數(shù)據(jù)庫（Gene Expression Omnibus,GEO）下載3個人肺組織來源的基因芯片,應(yīng)用R語言和GEO2R篩選肺動脈高壓患者與正常人肺組織中差異表達(dá)基因和差異表達(dá)microRNA,并通過DAVID 6.8數(shù)據(jù)庫進行基因功能分析和信號通路富集分析,STRING在線數(shù)據(jù)庫構(gòu)建蛋白之間相互作用可視化網(wǎng)絡(luò)圖（PPI）,TargetScan數(shù)據(jù)庫預(yù)測差異microRNA靶基因,Cytoscape 3.6.1軟件構(gòu)建microRNA-mRNA網(wǎng)絡(luò)。結(jié)果:獲得226個差異基因,這些差異基因主要涉及細(xì)胞趨化、炎癥反應(yīng)等生物學(xué)過程,主要參與造血細(xì)胞系、性別等方面的信號通路,從PPI中識別出10個關(guān)鍵基因HGF、KIT、VCAM1、CXCL12、ITGAM、FPR1、CXCL9、CXCR1、TLR8、CXCR2;獲得29個差異microRNA,構(gòu)建了microRNA-mRNA網(wǎng)絡(luò),并從網(wǎng)絡(luò)中識別出5個關(guān)鍵microRNA。結(jié)論... 

【文章來源】：中國循環(huán)雜志. 2020,35(08)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：8 頁

【部分圖文】：

PPI網(wǎng)絡(luò)中的顯著簇集模塊

226個差異基因的PPI網(wǎng)絡(luò)

上調(diào)差異micro RNA-m RNA網(wǎng)絡(luò)

【參考文獻】：
期刊論文
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本文編號：3294824