高通量技術(shù)作為一種革命性的測序技術(shù),由于其高通量、高精度、低成本的特點(diǎn),已經(jīng)成為了可以替代基于雜交的微陣列技術(shù)進(jìn)行生物學(xué)研究的一種工具。目前,以Roche公司的454技術(shù)、Illumina公司的Solexa技術(shù)以及ABI公司的SOLID技術(shù)為標(biāo)志的新一代測序技術(shù)（Next generation sequencing,NGS）已經(jīng)被廣泛地應(yīng)用于實(shí)際的生物學(xué)研究中。高通量測序技術(shù)在為基因組的研究提供了有利工具的同時也帶來了統(tǒng)計上的挑戰(zhàn)。由于基因長度、測序深度以及樣本間片段分布的差異性,我們通常不能直接對原始數(shù)據(jù)進(jìn)行處理。現(xiàn)有的文獻(xiàn)提供了多種方法來進(jìn)行相同物種RNA-Seq數(shù)據(jù)的標(biāo)準(zhǔn)化,并且利用標(biāo)準(zhǔn)化之后的數(shù)據(jù)進(jìn)行基因的差異化表達(dá)分析。本文考慮針對不同物種的RNA-Seq數(shù)據(jù)進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化的問題。識別不同物種之間的差異化表達(dá)的基因能夠有效地發(fā)現(xiàn)進(jìn)化上保守的轉(zhuǎn)錄反應(yīng),而且對探索哺乳動物器官中基因表達(dá)水平的演變和研究醫(yī)學(xué)中基因的表達(dá)水平具有重大影響。由于不同物種之間的基因個數(shù)、同源基因的長度以及測序深度的差異,對不同物種的RNA-seq數(shù)據(jù)的標(biāo)準(zhǔn)化更為復(fù)雜,過去所使用的針對相同物種的標(biāo)準(zhǔn)化方法不能直... 

【文章來源】：深圳大學(xué)廣東省

【文章頁數(shù)】：47 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

Illumina測序技術(shù)的基本步驟

Roche454測序技術(shù)的基本步驟

離子洪流：質(zhì)子/PGM測序技術(shù)的基本步驟


本文編號：3294610