玉米響應(yīng)大斑病菌侵染的多組學(xué)分析及重要侵染相關(guān)基因的挖掘
發(fā)布時間:2021-07-19 13:45
玉米大斑病是世界玉米產(chǎn)區(qū)主要的真菌性病害之一,該病害主要通過損傷或殺死玉米葉片組織,減少植株的受光面積,降低光合作用效率,進(jìn)而影響玉米的品質(zhì)和產(chǎn)量。引起該病害的真菌為玉米大斑病菌(Setosphaeria turcica)。有關(guān)病菌侵染玉米的方式和過程已有較多研究,但兩者之間相互作用的分子機(jī)制尚不明確。本研究以大斑病菌為研究對象,通過對病菌與玉米互作轉(zhuǎn)錄組的分析,并結(jié)合分子生物學(xué)手段,挖掘并驗證了一些病菌重要的侵染相關(guān)基因;以玉米為研究對象,基于多種組學(xué)技術(shù),分析了大斑病菌侵染過程中玉米葉片在轉(zhuǎn)錄組、蛋白質(zhì)組以及磷酸化修飾水平上的變化,深入挖掘了與玉米響應(yīng)大斑病菌侵染過程密切相關(guān)的功能基因和代謝途徑,初步探究了玉米與大斑病菌互作過程的分子機(jī)制。主要研究結(jié)果如下:1.玉米大斑病菌重要侵染相關(guān)基因的挖掘與驗證(1)通過互作轉(zhuǎn)錄組分析發(fā)現(xiàn),共挖掘到583個與大斑病菌侵染密切相關(guān)的候選基因,其中包括StPBS2、StMKK1、StHOG1以及StKSS1等7個MAPK基因,STE12在內(nèi)的1 1個轉(zhuǎn)錄因子基因,StSP1和StSP2在內(nèi)的15個有功能注釋的效應(yīng)因子基因,以及StKU80在內(nèi)的1...
【文章來源】:河北農(nóng)業(yè)大學(xué)河北省
【文章頁數(shù)】:144 頁
【學(xué)位級別】:博士
【部分圖文】:
圖2.1玉米大斑病菌侵染過程轉(zhuǎn)錄組分析??(A)測序樣本之間表達(dá)基因的PCA分析,(B)差異表達(dá)基因維恩分析,(C-E)差異表達(dá)基因聚類分析,?1:色和??藍(lán)色分別表示基因上調(diào)和下調(diào)
?玉米響應(yīng)大斑病菌侵染的多組學(xué)分析及重要侵染相關(guān)基因的挖掘???2.2.3?MAPK途徑模型的構(gòu)建??相似的序列具有相似的結(jié)構(gòu),相似的結(jié)構(gòu)具有相似的功能,同源蛋白具有相同的生物功??能.報據(jù)前而的分析,結(jié)合酵母菌及其他植物病原真菌MAPK級聯(lián)反應(yīng)研究結(jié)果HA,推斷玉米??大斑病原菌中可能存在4條MAPK級聯(lián)反應(yīng)(如圖2.3所示)。其中一條為FUS3/KSS1途徑,??首先活化的Stu-Stel?1使Stu-Ste7蛋白磷酸化位點“SDVWS”中的2個Ser殘基磷酸化,激活其活??性;然后活化的Stu-Ste7使Stu-Kssl蛋白的磷酸化位點“TEY”中的Thr殘基磷酸化,激活其活??性,活化的Stu-Kss丨再激活其他的下游靶蛋白。在CWI?(Cell?Wall?Integrity)?-MAPK途徑中,??活化的Stu-Bck丨使Stu-Mkkl蛋白磷酸化位點“SDVWS”中的2個Ser殘基磷酸化,激活活??性:然后活化的Stu-Mkkl使Stu-Slt2蛋白的磷酸化位點“TEY”中的Thr殘基磷酸化,激活其活??性。在HOG-MAPK途徑中,活化的Stu-Ssk2使Stu-Pbs2蛋白磷酸化位點“SDIWS”中的2個Ser??殘基磷酸化,激活其活性;然后活化的Stu-Pbs2使Stu-Hog丨蛋白的磷酸化位點“TGY”中的Thr??殘錐磷酸化,激活it活性。迅說在酵母菌中還沒證據(jù)表明哪個MAPKK能夠激活丨me2,?fll在K??米黑粉病原菌發(fā)現(xiàn)其同源蛋臼作用類似與MAPK,而在玉米大斑病菌中也鑒定出了其M源蛋廣1??Stlme2,?mi;有MAPK家族保守的激酶活性位點-D[L/I/V]K-和-TxY-磷酸化位點。
?河北農(nóng)業(yè)大學(xué)博士學(xué)位論文???'?國?1?00???I080???'7:-?;? ̄2?StSLT2?'?0?60??!?:S,SSK2?_。2。??SIHOG1?i000??—-?3?jS,STE11??i?i??I?卜??一H?量?StBCKI??BBBjBwBBBBj?sikssi??r_BBSIPSS2??%::壓SISTE7??《.#??^?.0??圖2_4玉米大斑病菌MAPK基因在病菌侵染寄主過程中表達(dá)模式分析??TPM農(nóng)沁掂W的表達(dá)M,對;。魳(biāo)準(zhǔn)化處fflUfi繪制熱W,?W屮8額&山藍(lán)到紅趙R坫W農(nóng)達(dá)M山低到A。??Figure?2.4?The?t'xpression?pm⑴e?oftlK'?MAPK?genes?〇r‘S’t"叫w以./a?"仍??TPM?represents?tlie?expression?level?of?genes.?A?heat?map?is?drawn?based?nomaliscd?i賣malh??blue?to?red?corresponds?to?the?expression?level?from?low?lo?iiigh.??2.2.5?MAPK途徑基因與病菌致病性??57尸批2為HOG-MAPK途徑中的MAPKK激酶基,數(shù)也;分析發(fā)現(xiàn)該禍因在__k米火斑病菌侵??染寄主的過程中表達(dá)量最高、上調(diào)倍數(shù)最大。利用本課題組前期創(chuàng)制的2株幻RNAi沉默??突變體,接種到生長至6葉期玉米葉片。觀察發(fā)現(xiàn)3周n絕火多數(shù)接種WT的1<:米觀察到明顯??的病斑,兩株RNAi沉默突體菌株對玉米葉片未造成明品壞死性病斑,初步證實了汾為玉??米大斑病菌侵染相關(guān)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]玉米大斑病菌MAPK超家族的全基因組鑒定及途徑模型建立[J]. 鞏校東,張曉玉,田蘭,王星懿,李坡,張盼,王玥,范永山,韓建民,谷守芹,董金皋. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2014(09)
[2]Receptor-Like Kinases in Plant Innate Immunity[J]. Ying Wu,Jian-Min Zhou. Journal of Integrative Plant Biology. 2013(12)
[3]Research Progress on Northern Leaf Blight in Corn[J]. ZHAO Yingnan, and WANG Zhenhua College of Agriculture, Northeast Agricultural University, Harbin 150030, China. Journal of Northeast Agricultural University(English Edition). 2009(02)
[4]Purification and Structural Analysis of a Selective Toxin Fraction Produced by the Plant Pathogen Setosphaeria turcica[J]. ZHANG Li-hui1,DONG Jin-gao1,WANG Chao-hua1 and LI Zheng-ping1,2 1 Mycotoxin Laboratory,Agricultural University of Hebei,Baoding 071001,P.R.China 2 College of Chemistry,Hebei University,Baoding 071000,P.R.China. Agricultural Sciences in China. 2007(04)
博士論文
[1]玉米大斑病菌漆酶基因家族鑒定及關(guān)鍵基因的功能解析[D]. 劉寧.河北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2019
[2]玉米大斑病菌黑色素合成途徑相關(guān)基因的克隆及功能分析[D]. 曹志艷.河北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2009
本文編號:3290810
【文章來源】:河北農(nóng)業(yè)大學(xué)河北省
【文章頁數(shù)】:144 頁
【學(xué)位級別】:博士
【部分圖文】:
圖2.1玉米大斑病菌侵染過程轉(zhuǎn)錄組分析??(A)測序樣本之間表達(dá)基因的PCA分析,(B)差異表達(dá)基因維恩分析,(C-E)差異表達(dá)基因聚類分析,?1:色和??藍(lán)色分別表示基因上調(diào)和下調(diào)
?玉米響應(yīng)大斑病菌侵染的多組學(xué)分析及重要侵染相關(guān)基因的挖掘???2.2.3?MAPK途徑模型的構(gòu)建??相似的序列具有相似的結(jié)構(gòu),相似的結(jié)構(gòu)具有相似的功能,同源蛋白具有相同的生物功??能.報據(jù)前而的分析,結(jié)合酵母菌及其他植物病原真菌MAPK級聯(lián)反應(yīng)研究結(jié)果HA,推斷玉米??大斑病原菌中可能存在4條MAPK級聯(lián)反應(yīng)(如圖2.3所示)。其中一條為FUS3/KSS1途徑,??首先活化的Stu-Stel?1使Stu-Ste7蛋白磷酸化位點“SDVWS”中的2個Ser殘基磷酸化,激活其活??性;然后活化的Stu-Ste7使Stu-Kssl蛋白的磷酸化位點“TEY”中的Thr殘基磷酸化,激活其活??性,活化的Stu-Kss丨再激活其他的下游靶蛋白。在CWI?(Cell?Wall?Integrity)?-MAPK途徑中,??活化的Stu-Bck丨使Stu-Mkkl蛋白磷酸化位點“SDVWS”中的2個Ser殘基磷酸化,激活活??性:然后活化的Stu-Mkkl使Stu-Slt2蛋白的磷酸化位點“TEY”中的Thr殘基磷酸化,激活其活??性。在HOG-MAPK途徑中,活化的Stu-Ssk2使Stu-Pbs2蛋白磷酸化位點“SDIWS”中的2個Ser??殘基磷酸化,激活其活性;然后活化的Stu-Pbs2使Stu-Hog丨蛋白的磷酸化位點“TGY”中的Thr??殘錐磷酸化,激活it活性。迅說在酵母菌中還沒證據(jù)表明哪個MAPKK能夠激活丨me2,?fll在K??米黑粉病原菌發(fā)現(xiàn)其同源蛋臼作用類似與MAPK,而在玉米大斑病菌中也鑒定出了其M源蛋廣1??Stlme2,?mi;有MAPK家族保守的激酶活性位點-D[L/I/V]K-和-TxY-磷酸化位點。
?河北農(nóng)業(yè)大學(xué)博士學(xué)位論文???'?國?1?00???I080???'7:-?;? ̄2?StSLT2?'?0?60??!?:S,SSK2?_。2。??SIHOG1?i000??—-?3?jS,STE11??i?i??I?卜??一H?量?StBCKI??BBBjBwBBBBj?sikssi??r_BBSIPSS2??%::壓SISTE7??《.#??^?.0??圖2_4玉米大斑病菌MAPK基因在病菌侵染寄主過程中表達(dá)模式分析??TPM農(nóng)沁掂W的表達(dá)M,對;。魳(biāo)準(zhǔn)化處fflUfi繪制熱W,?W屮8額&山藍(lán)到紅趙R坫W農(nóng)達(dá)M山低到A。??Figure?2.4?The?t'xpression?pm⑴e?oftlK'?MAPK?genes?〇r‘S’t"叫w以./a?"仍??TPM?represents?tlie?expression?level?of?genes.?A?heat?map?is?drawn?based?nomaliscd?i賣malh??blue?to?red?corresponds?to?the?expression?level?from?low?lo?iiigh.??2.2.5?MAPK途徑基因與病菌致病性??57尸批2為HOG-MAPK途徑中的MAPKK激酶基,數(shù)也;分析發(fā)現(xiàn)該禍因在__k米火斑病菌侵??染寄主的過程中表達(dá)量最高、上調(diào)倍數(shù)最大。利用本課題組前期創(chuàng)制的2株幻RNAi沉默??突變體,接種到生長至6葉期玉米葉片。觀察發(fā)現(xiàn)3周n絕火多數(shù)接種WT的1<:米觀察到明顯??的病斑,兩株RNAi沉默突體菌株對玉米葉片未造成明品壞死性病斑,初步證實了汾為玉??米大斑病菌侵染相關(guān)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]玉米大斑病菌MAPK超家族的全基因組鑒定及途徑模型建立[J]. 鞏校東,張曉玉,田蘭,王星懿,李坡,張盼,王玥,范永山,韓建民,谷守芹,董金皋. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2014(09)
[2]Receptor-Like Kinases in Plant Innate Immunity[J]. Ying Wu,Jian-Min Zhou. Journal of Integrative Plant Biology. 2013(12)
[3]Research Progress on Northern Leaf Blight in Corn[J]. ZHAO Yingnan, and WANG Zhenhua College of Agriculture, Northeast Agricultural University, Harbin 150030, China. Journal of Northeast Agricultural University(English Edition). 2009(02)
[4]Purification and Structural Analysis of a Selective Toxin Fraction Produced by the Plant Pathogen Setosphaeria turcica[J]. ZHANG Li-hui1,DONG Jin-gao1,WANG Chao-hua1 and LI Zheng-ping1,2 1 Mycotoxin Laboratory,Agricultural University of Hebei,Baoding 071001,P.R.China 2 College of Chemistry,Hebei University,Baoding 071000,P.R.China. Agricultural Sciences in China. 2007(04)
博士論文
[1]玉米大斑病菌漆酶基因家族鑒定及關(guān)鍵基因的功能解析[D]. 劉寧.河北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2019
[2]玉米大斑病菌黑色素合成途徑相關(guān)基因的克隆及功能分析[D]. 曹志艷.河北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2009
本文編號:3290810
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