甘薯海藻糖-6-磷酸合成酶基因IbTPS1克隆與功能鑒定
發(fā)布時間:2021-07-17 12:59
甘薯是世界重要的七大糧食作物之一,由于具有生產(chǎn)成本低,生物產(chǎn)量大,且可利用價值高等優(yōu)點在很多地區(qū)被廣泛推廣。甘薯多生長于貧瘠土地中,環(huán)境對其生物產(chǎn)量的影響至關(guān)重要,因此對甘薯相關(guān)抗逆基因結(jié)構(gòu)和功能的研究具有重要意義。海藻糖作為一種植物滲透調(diào)節(jié)物質(zhì),當植物受到干旱、高鹽、高溫等非生物脅迫時,可取代水分子與生物膜及蛋白質(zhì)等生物大分子的羥基,維持植物細胞膜結(jié)構(gòu)和功能的穩(wěn)定,從而提高植物抗逆性。海藻糖-6-磷酸合成酶(trehalose-6-phosphate synthase,TPS)是植物海藻糖唯一合成途徑中的關(guān)鍵酶,具有無法替代的作用。許多研究表明TPS可參與植物逆境應答反應,提高植物抗性。本研究通過干旱條件下從甘薯轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫中得到一條與擬南芥AtTPS1高度同源的Unigene序列,設(shè)計特異性引物,成功克隆得到IbTPS1基因,對其序列特征、表達模式進行分析后將IbTPS1序列N-端2-88氨基酸進行截斷修飾,構(gòu)建酵母表達載體進行TPS活性鑒定和酵母抗性鑒定,構(gòu)建植物表達載體進行亞細胞定位和轉(zhuǎn)基因甘薯抗性鑒定,并對作用機理進行了研究。具體結(jié)果如下所示:(1)采用RT-PCR技術(shù)成功從...
【文章來源】:山西農(nóng)業(yè)大學山西省
【文章頁數(shù)】:65 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
不同物種TPS分類[46]
-14-增,得到2811bp的電泳條帶(圖2-1),與克隆載體連接,轉(zhuǎn)化大腸桿菌DH5α感受態(tài)細胞,LB(CAR+)固體平板上37℃培養(yǎng)過夜后,挑取白色單菌落于LB(CAR+)固體平板37℃培養(yǎng)8h,挑取單菌落進行PCR鑒定,結(jié)果如圖2-2所示IbTPS1菌液PCR鑒定1-5泳道均得到2811bp目的條帶,提取質(zhì)粒并測序鑒定。圖2-1IbTPS1全長cDNA的PCR擴增Figure2-1FulllengthcDNAofIbTPS1注:M:10000DNAMarker;1-3IbTPS1全長cDNA的PCR擴增電泳條帶Note:M:10000DNAMarker;1-3ElectrophoresisbandsofIbTPS1PCRamplification圖2-2IbTPS1菌液PCR鑒定Figure2-2FulllengthcDNAofIbTPS1注:M:10000DNAMarker;1-5IbTPS1菌液PCR鑒定電泳條帶Note:M:10000DNAMarker;1-5ElectrophoresisbandsofIbTPS1PCRidentification2.3.2IbTPS1序列生物信息學分析2.3.2.1IbTPS1編碼氨基酸一級結(jié)構(gòu)預測ExPASy-ProtScale軟件預測IbTPS1編碼蛋白的分子式C4727H7416N1344O1413S31,理論
IbTPS1菌液PCR鑒定
【參考文獻】:
期刊論文
[1]木薯MeTPS1基因克隆、表達及生物信息學分析[J]. 丁澤紅,付莉莉,吳春來,胡偉. 江蘇農(nóng)業(yè)科學. 2018(09)
[2]超量表達小桐子JcTPS1促進擬南芥開花并增加葉片花青素含量[J]. 趙美麗,倪軍,陳茂盛,徐增富. 分子植物育種. 2018(01)
[3]辣椒TPS家族成員的鑒定與CaTPS1的表達分析[J]. 魏兵強,王蘭蘭,張茹,陳靈芝,張少麗,張建農(nóng). 園藝學報. 2016(08)
[4]海藻糖合成途徑及分子生物學研究進展[J]. 鞏濤,劉德海,王繼雯,楊文玲,解復紅. 中國農(nóng)學通報. 2016(14)
[5]香蕉MaTPS1基因序列及其表達特性分析[J]. 許桂鶯,徐碧玉,邢文婷,賈彩虹,王卓,常勝和,王安邦,舒海燕,金志強. 西北植物學報. 2015(10)
[6]堿茅6-磷酸海藻糖合成酶基因的克隆及其耐逆性分析[J]. 李瑩,柳參奎. 草業(yè)學報. 2015(01)
[7]食用傘菌海藻糖代謝相關(guān)基因調(diào)控及生物工程應用[J]. 劉建輝,尚曉冬,李亞鵬,趙妍,譚琦. 食品工業(yè)科技. 2015(08)
[8]海藻糖生物合成及應用研究進展[J]. 曲茂華,張鳳英,何名芳,陳衛(wèi)平. 食品工業(yè)科技. 2014(16)
[9]丹參海藻糖-6-磷酸合成酶基因(SmTPS)的克隆及其表達分析[J]. 岳思思,姚偉,王東浩,陳玉芹,王喆之. 基因組學與應用生物學. 2014(02)
[10]甘薯的功能成分及其藥用價值[J]. 王洪云,孫健,鈕福祥,徐飛,岳瑞雪,張毅,朱紅. 中國食物與營養(yǎng). 2013(12)
博士論文
[1]玉米海藻糖-6-磷酸合成酶基因家族的功能驗證和差異表達分析[D]. 蔣偉.四川農(nóng)業(yè)大學 2010
碩士論文
[1]墊狀卷柏海藻糖-6-磷酸合成酶基因(SpTPS1)的截短修飾[D]. 趙生美.四川農(nóng)業(yè)大學 2012
[2]海藻糖改善枯草芽孢桿菌電轉(zhuǎn)化方法的研究[D]. 張曉慧.南京農(nóng)業(yè)大學 2010
[3]墊狀卷柏海藻糖-6-磷酸合成酶基因(SpTPS1)的克隆及其功能分析[D]. 林荊.四川農(nóng)業(yè)大學 2009
[4]Pseudomonas putida S1海藻糖合成酶基因在大腸桿菌中的表達及其條件研究[D]. 姚林.江南大學 2008
本文編號:3288223
【文章來源】:山西農(nóng)業(yè)大學山西省
【文章頁數(shù)】:65 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
不同物種TPS分類[46]
-14-增,得到2811bp的電泳條帶(圖2-1),與克隆載體連接,轉(zhuǎn)化大腸桿菌DH5α感受態(tài)細胞,LB(CAR+)固體平板上37℃培養(yǎng)過夜后,挑取白色單菌落于LB(CAR+)固體平板37℃培養(yǎng)8h,挑取單菌落進行PCR鑒定,結(jié)果如圖2-2所示IbTPS1菌液PCR鑒定1-5泳道均得到2811bp目的條帶,提取質(zhì)粒并測序鑒定。圖2-1IbTPS1全長cDNA的PCR擴增Figure2-1FulllengthcDNAofIbTPS1注:M:10000DNAMarker;1-3IbTPS1全長cDNA的PCR擴增電泳條帶Note:M:10000DNAMarker;1-3ElectrophoresisbandsofIbTPS1PCRamplification圖2-2IbTPS1菌液PCR鑒定Figure2-2FulllengthcDNAofIbTPS1注:M:10000DNAMarker;1-5IbTPS1菌液PCR鑒定電泳條帶Note:M:10000DNAMarker;1-5ElectrophoresisbandsofIbTPS1PCRidentification2.3.2IbTPS1序列生物信息學分析2.3.2.1IbTPS1編碼氨基酸一級結(jié)構(gòu)預測ExPASy-ProtScale軟件預測IbTPS1編碼蛋白的分子式C4727H7416N1344O1413S31,理論
IbTPS1菌液PCR鑒定
【參考文獻】:
期刊論文
[1]木薯MeTPS1基因克隆、表達及生物信息學分析[J]. 丁澤紅,付莉莉,吳春來,胡偉. 江蘇農(nóng)業(yè)科學. 2018(09)
[2]超量表達小桐子JcTPS1促進擬南芥開花并增加葉片花青素含量[J]. 趙美麗,倪軍,陳茂盛,徐增富. 分子植物育種. 2018(01)
[3]辣椒TPS家族成員的鑒定與CaTPS1的表達分析[J]. 魏兵強,王蘭蘭,張茹,陳靈芝,張少麗,張建農(nóng). 園藝學報. 2016(08)
[4]海藻糖合成途徑及分子生物學研究進展[J]. 鞏濤,劉德海,王繼雯,楊文玲,解復紅. 中國農(nóng)學通報. 2016(14)
[5]香蕉MaTPS1基因序列及其表達特性分析[J]. 許桂鶯,徐碧玉,邢文婷,賈彩虹,王卓,常勝和,王安邦,舒海燕,金志強. 西北植物學報. 2015(10)
[6]堿茅6-磷酸海藻糖合成酶基因的克隆及其耐逆性分析[J]. 李瑩,柳參奎. 草業(yè)學報. 2015(01)
[7]食用傘菌海藻糖代謝相關(guān)基因調(diào)控及生物工程應用[J]. 劉建輝,尚曉冬,李亞鵬,趙妍,譚琦. 食品工業(yè)科技. 2015(08)
[8]海藻糖生物合成及應用研究進展[J]. 曲茂華,張鳳英,何名芳,陳衛(wèi)平. 食品工業(yè)科技. 2014(16)
[9]丹參海藻糖-6-磷酸合成酶基因(SmTPS)的克隆及其表達分析[J]. 岳思思,姚偉,王東浩,陳玉芹,王喆之. 基因組學與應用生物學. 2014(02)
[10]甘薯的功能成分及其藥用價值[J]. 王洪云,孫健,鈕福祥,徐飛,岳瑞雪,張毅,朱紅. 中國食物與營養(yǎng). 2013(12)
博士論文
[1]玉米海藻糖-6-磷酸合成酶基因家族的功能驗證和差異表達分析[D]. 蔣偉.四川農(nóng)業(yè)大學 2010
碩士論文
[1]墊狀卷柏海藻糖-6-磷酸合成酶基因(SpTPS1)的截短修飾[D]. 趙生美.四川農(nóng)業(yè)大學 2012
[2]海藻糖改善枯草芽孢桿菌電轉(zhuǎn)化方法的研究[D]. 張曉慧.南京農(nóng)業(yè)大學 2010
[3]墊狀卷柏海藻糖-6-磷酸合成酶基因(SpTPS1)的克隆及其功能分析[D]. 林荊.四川農(nóng)業(yè)大學 2009
[4]Pseudomonas putida S1海藻糖合成酶基因在大腸桿菌中的表達及其條件研究[D]. 姚林.江南大學 2008
本文編號:3288223
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