【目的】通過生物信息學(xué)方法,預(yù)測肺腺癌及肺鱗癌中高表達(dá)的母體胚胎亮氨酸拉鏈激酶（MELK）在疾病發(fā)生發(fā)展中的功能機(jī)制及臨床意義�！痉椒ā繌幕虮磉_(dá)數(shù)據(jù)（GEO）獲取芯片數(shù)據(jù)集GSE7670,結(jié)合腫瘤基因組圖譜（TCGA）肺腺癌及肺鱗癌數(shù)據(jù)庫進(jìn)行差異分析,篩選差異激酶（P <0.05）。對這些激酶進(jìn)行GO生物學(xué)功能富集分析及KEGG信號通路分析。通過String數(shù)據(jù)庫繪制蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò),并利用Cytoscape的MCODE插件找到關(guān)鍵節(jié)點(diǎn)蛋白,挑選出MELK激酶。通過Oncomine數(shù)據(jù)庫分析MELK表達(dá),從TCGA數(shù)據(jù)庫獲取臨床信息,分析MELK表達(dá)與肺腺癌及肺鱗癌臨床病理特征及預(yù)后的關(guān)系。采用GeneMANIA預(yù)測MELK功能,進(jìn)而用GEPIA2驗(yàn)證相關(guān)共表達(dá)基因。【結(jié)果】共篩選出159個與細(xì)胞增殖、凋亡及各信號通路密切相關(guān)的差異激酶。蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)分析發(fā)現(xiàn)21個關(guān)鍵基因。MELK在男性、年齡較小、高分期的肺腺癌及肺鱗癌中表達(dá)較高。在肺腺癌中,MELK高表達(dá)與較短的總生存期（OS）及無進(jìn)展生存期（PFS）顯著相關(guān),而在肺鱗癌中則無顯著差異。MELK可能參與G2/M期轉(zhuǎn)化,... 

【文章來源】：中山大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)科學(xué)版). 2020,41(06)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：11 頁

【部分圖文】：

GSE7670芯片中肺腺癌和癌旁組織差異表達(dá)基因火山圖

我們通過GeneMANIA預(yù)測可能與MELK具有相同功能且相互作用的基因，并且預(yù)測了MELK的潛在功能（圖6）。在功能上提示MELK可能促進(jìn)G2/M細(xì)胞周期的轉(zhuǎn)化，推測MELK可能與細(xì)胞增殖相關(guān)。因而，進(jìn)一步檢測MELK與增殖相關(guān)基因的共表達(dá)（圖7），結(jié)果表明，在LUAD中，MELK均與MKI67、PCNA、CCNB1、MCM2和TOP2A表達(dá)呈明顯正相關(guān)（P<0.05，相關(guān)系數(shù)R分別為：0.75,0.65,0.81,0.7,0.66）；在LUSC中，MELK也與其呈顯著正相關(guān)（P<0.05，相關(guān)系數(shù)R分別為：0.36,0.46,0.36,0.37,0.38），但相關(guān)性較LUAD較低。圖3 159個激酶中關(guān)鍵蛋白的蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)

159個激酶中關(guān)鍵蛋白的蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)


本文編號：3281372